MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. CC9902 chromosome

Total Repeats: 44761

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15002	NC_007513	GTT	2	6	740199	740204	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78184302
15003	NC_007513	GA	3	6	740233	740238	50 %	0 %	50 %	0 %	78184302
15004	NC_007513	CTT	2	6	740263	740268	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78184302
15005	NC_007513	TCG	2	6	740337	740342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184302
15006	NC_007513	TGT	2	6	740348	740353	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78184302
15007	NC_007513	TCT	2	6	740375	740380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78184302
15008	NC_007513	CGAT	2	8	740437	740444	25 %	25 %	25 %	25 %	78184302
15009	NC_007513	CT	3	6	740447	740452	0 %	50 %	0 %	50 %	78184302
15010	NC_007513	TC	3	6	740453	740458	0 %	50 %	0 %	50 %	78184302
15011	NC_007513	ATTG	2	8	740477	740484	25 %	50 %	25 %	0 %	78184302
15012	NC_007513	TGA	2	6	740525	740530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78184302
15013	NC_007513	ACG	2	6	740628	740633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184302
15014	NC_007513	GTC	2	6	740636	740641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184302
15015	NC_007513	TGA	2	6	740642	740647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78184302
15016	NC_007513	GAT	2	6	740661	740666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78184302
15017	NC_007513	AAG	2	6	740683	740688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78184302
15018	NC_007513	TGA	2	6	740693	740698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78184302
15019	NC_007513	ATCA	2	8	740711	740718	50 %	25 %	0 %	25 %	78184302
15020	NC_007513	TCG	2	6	740732	740737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184302
15021	NC_007513	TTG	2	6	740743	740748	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78184302
15022	NC_007513	GGC	2	6	740760	740765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78184302
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15025	NC_007513	GTG	2	6	740898	740903	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184302
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15029	NC_007513	TTG	2	6	741147	741152	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78184302
15030	NC_007513	TGA	2	6	741161	741166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78184302
15031	NC_007513	GTC	2	6	741172	741177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184302
15032	NC_007513	GA	3	6	741329	741334	50 %	0 %	50 %	0 %	78184302
15033	NC_007513	GGT	2	6	741357	741362	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184302
15034	NC_007513	TGG	2	6	741385	741390	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184302
15035	NC_007513	ATG	2	6	741418	741423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78184302
15036	NC_007513	ATC	2	6	741441	741446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78184302
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15039	NC_007513	ATT	2	6	741537	741542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78184302
15040	NC_007513	TGG	2	6	741545	741550	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184302
15041	NC_007513	TGC	2	6	741695	741700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184302
15042	NC_007513	ATG	2	6	741715	741720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78184302
15043	NC_007513	A	6	6	741816	741821	100 %	0 %	0 %	0 %	78184302
15044	NC_007513	GC	3	6	741926	741931	0 %	0 %	50 %	50 %	78184302
15045	NC_007513	GGT	2	6	741945	741950	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184302
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15052	NC_007513	TTG	2	6	742078	742083	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78184302
15053	NC_007513	AGA	2	6	742139	742144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78184302
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15055	NC_007513	TGT	2	6	742232	742237	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78184302
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15057	NC_007513	TGAT	2	8	742318	742325	25 %	50 %	25 %	0 %	78184302
15058	NC_007513	CT	3	6	742374	742379	0 %	50 %	0 %	50 %	78184302
15059	NC_007513	GGA	2	6	742419	742424	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78184302
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15062	NC_007513	GGT	2	6	742485	742490	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184302
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15108	NC_007513	TGT	2	6	744347	744352	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78184302
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15111	NC_007513	GGCTT	2	10	744548	744557	0 %	40 %	40 %	20 %	78184302
15112	NC_007513	AAT	2	6	744573	744578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	78184302
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15121	NC_007513	TGG	2	6	745055	745060	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184303
15122	NC_007513	GAT	2	6	745090	745095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78184303
15123	NC_007513	TGC	2	6	745182	745187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184303
15124	NC_007513	CA	3	6	745283	745288	50 %	0 %	0 %	50 %	78184303
15125	NC_007513	GCT	2	6	745299	745304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184303
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15145	NC_007513	CGT	2	6	746580	746585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15230	NC_007513	C	7	7	750158	750164	0 %	0 %	0 %	100 %	78184308
15231	NC_007513	TCG	2	6	750225	750230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184309
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15233	NC_007513	GCT	2	6	750350	750355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184309
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15235	NC_007513	TG	4	8	750484	750491	0 %	50 %	50 %	0 %	78184310
15236	NC_007513	TGGGG	2	10	750500	750509	0 %	20 %	80 %	0 %	78184310
15237	NC_007513	CG	3	6	750552	750557	0 %	0 %	50 %	50 %	78184310
15238	NC_007513	TGCC	2	8	750635	750642	0 %	25 %	25 %	50 %	78184310
15239	NC_007513	ACG	2	6	750643	750648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184310
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15241	NC_007513	CAA	2	6	750750	750755	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78184310
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15352	NC_007513	G	6	6	755704	755709	0 %	0 %	100 %	0 %	78184315
15353	NC_007513	GA	3	6	755724	755729	50 %	0 %	50 %	0 %	78184315
15354	NC_007513	GCCA	2	8	755735	755742	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
15355	NC_007513	TCCA	2	8	755746	755753	25 %	25 %	0 %	50 %	78184316
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15364	NC_007513	CCA	2	6	756054	756059	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78184316
15365	NC_007513	GCT	2	6	756106	756111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184316
15366	NC_007513	TGG	2	6	756129	756134	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184316
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15377	NC_007513	GAC	2	6	756353	756358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184316
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15385	NC_007513	GATC	2	8	756642	756649	25 %	25 %	25 %	25 %	78184316
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15405	NC_007513	TGC	2	6	757372	757377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184318
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15454	NC_007513	GC	3	6	759336	759341	0 %	0 %	50 %	50 %	78184320
15455	NC_007513	C	6	6	759408	759413	0 %	0 %	0 %	100 %	78184320
15456	NC_007513	AGC	2	6	759414	759419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184320
15457	NC_007513	CCAG	2	8	759428	759435	25 %	0 %	25 %	50 %	78184320
15458	NC_007513	GCT	2	6	759596	759601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184320
15459	NC_007513	GCCCA	2	10	759684	759693	20 %	0 %	20 %	60 %	78184320
15460	NC_007513	GCG	2	6	759742	759747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78184320
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15462	NC_007513	GT	3	6	759829	759834	0 %	50 %	50 %	0 %	78184320
15463	NC_007513	TCA	2	6	759905	759910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78184320
15464	NC_007513	TGGG	2	8	759932	759939	0 %	25 %	75 %	0 %	78184320
15465	NC_007513	GAA	2	6	759960	759965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15466	NC_007513	GCCAA	2	10	759974	759983	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
15467	NC_007513	CGT	2	6	760348	760353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184321
15468	NC_007513	GCT	2	6	760355	760360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184321
15469	NC_007513	GCGAA	2	10	760434	760443	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
15470	NC_007513	GTC	2	6	760568	760573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184322
15471	NC_007513	C	6	6	760573	760578	0 %	0 %	0 %	100 %	78184322
15472	NC_007513	TGGG	2	8	760666	760673	0 %	25 %	75 %	0 %	78184322
15473	NC_007513	ACG	2	6	760745	760750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184322
15474	NC_007513	AGCT	2	8	760756	760763	25 %	25 %	25 %	25 %	78184322
15475	NC_007513	AAT	2	6	760793	760798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	78184322
15476	NC_007513	CCAGCG	2	12	760799	760810	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	78184322
15477	NC_007513	GCT	2	6	760837	760842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184322
15478	NC_007513	GCG	2	6	760889	760894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78184322
15479	NC_007513	TCG	2	6	760911	760916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184323
15480	NC_007513	AAC	2	6	760917	760922	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78184323
15481	NC_007513	GCCA	2	8	760995	761002	25 %	0 %	25 %	50 %	78184323
15482	NC_007513	CGT	2	6	761025	761030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184323
15483	NC_007513	GGC	2	6	761127	761132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78184323
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15485	NC_007513	GCC	2	6	761220	761225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78184323
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