MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. CC9902 chromosome

Total Repeats: 44761

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_007513	GCTCG	2	10	694010	694019	0 %	20 %	40 %	40 %	78184262
14002	NC_007513	CGCA	2	8	694103	694110	25 %	0 %	25 %	50 %	78184262
14003	NC_007513	TGA	2	6	694122	694127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78184262
14004	NC_007513	GATC	2	8	694147	694154	25 %	25 %	25 %	25 %	78184263
14005	NC_007513	TGT	2	6	694167	694172	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78184263
14006	NC_007513	GGC	2	6	694231	694236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78184263
14007	NC_007513	TGG	2	6	694324	694329	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184263
14008	NC_007513	TCG	2	6	694335	694340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184263
14009	NC_007513	GTG	2	6	694341	694346	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184263
14010	NC_007513	TGG	2	6	694420	694425	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184263
14011	NC_007513	GTC	2	6	694429	694434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184263
14012	NC_007513	TGGCGA	2	12	694557	694568	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	78184263
14013	NC_007513	GCTG	2	8	694578	694585	0 %	25 %	50 %	25 %	78184263
14014	NC_007513	C	6	6	694592	694597	0 %	0 %	0 %	100 %	78184263
14015	NC_007513	TGG	2	6	694653	694658	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184263
14016	NC_007513	ACC	2	6	694679	694684	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78184263
14017	NC_007513	GGT	2	6	694685	694690	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184263
14018	NC_007513	TGG	3	9	694710	694718	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184263
14019	NC_007513	TTG	2	6	694727	694732	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78184263
14020	NC_007513	TGG	2	6	694756	694761	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184263
14021	NC_007513	GTG	2	6	694775	694780	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184263
14022	NC_007513	TC	3	6	694782	694787	0 %	50 %	0 %	50 %	78184263
14023	NC_007513	GCA	5	15	694811	694825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184263
14024	NC_007513	TGT	2	6	694831	694836	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78184263
14025	NC_007513	CAGT	2	8	694840	694847	25 %	25 %	25 %	25 %	78184263
14026	NC_007513	TTG	2	6	694851	694856	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78184263
14027	NC_007513	TGG	2	6	694869	694874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184263
14028	NC_007513	GTT	2	6	694939	694944	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78184263
14029	NC_007513	TGG	2	6	694945	694950	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184263
14030	NC_007513	GTG	3	9	694983	694991	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184263
14031	NC_007513	GGC	2	6	695044	695049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78184263
14032	NC_007513	AGC	2	6	695232	695237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184263
14033	NC_007513	GATG	2	8	695245	695252	25 %	25 %	50 %	0 %	78184263
14034	NC_007513	TGGTGT	2	12	695283	695294	0 %	50 %	50 %	0 %	78184263
14035	NC_007513	GTG	2	6	695309	695314	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184263
14036	NC_007513	GCA	2	6	695374	695379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184263
14037	NC_007513	AGT	2	6	695538	695543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78184263
14038	NC_007513	AGC	2	6	695588	695593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184264
14039	NC_007513	TTC	2	6	695601	695606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78184264
14040	NC_007513	CAG	2	6	695611	695616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184264
14041	NC_007513	GTC	2	6	695693	695698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184264
14042	NC_007513	TGG	2	6	695705	695710	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184264
14043	NC_007513	GCG	2	6	695734	695739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78184264
14044	NC_007513	CTT	2	6	695761	695766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78184264
14045	NC_007513	GTT	2	6	695799	695804	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78184264
14046	NC_007513	CGG	2	6	695845	695850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78184264
14047	NC_007513	TTTG	2	8	695858	695865	0 %	75 %	25 %	0 %	78184264
14048	NC_007513	TGC	2	6	695885	695890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184264
14049	NC_007513	CGG	2	6	695931	695936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78184264
14050	NC_007513	CCT	2	6	695964	695969	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78184264
14051	NC_007513	TGCCCG	2	12	695979	695990	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	78184264
14052	NC_007513	GTT	2	6	696012	696017	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78184264
14053	NC_007513	G	6	6	696036	696041	0 %	0 %	100 %	0 %	78184264
14054	NC_007513	TGCC	2	8	696057	696064	0 %	25 %	25 %	50 %	78184264
14055	NC_007513	T	6	6	696092	696097	0 %	100 %	0 %	0 %	78184264
14056	NC_007513	TCGA	2	8	696136	696143	25 %	25 %	25 %	25 %	78184264
14057	NC_007513	GCT	2	6	696174	696179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184264
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14059	NC_007513	TGC	2	6	696255	696260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184264
14060	NC_007513	TGC	2	6	696285	696290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184264
14061	NC_007513	ACG	2	6	696317	696322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184264
14062	NC_007513	TCATC	2	10	696357	696366	20 %	40 %	0 %	40 %	78184264
14063	NC_007513	GCC	2	6	696384	696389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78184264
14064	NC_007513	TTG	2	6	696394	696399	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78184264
14065	NC_007513	GAT	2	6	696412	696417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78184264
14066	NC_007513	GGA	2	6	696502	696507	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78184264
14067	NC_007513	GCT	2	6	696533	696538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184264
14068	NC_007513	CGC	2	6	696552	696557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78184264
14069	NC_007513	TCG	2	6	696575	696580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184264
14070	NC_007513	TTC	2	6	696597	696602	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78184265
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14075	NC_007513	TGA	2	6	696880	696885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78184265
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14078	NC_007513	CAT	2	6	696994	696999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78184266
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14080	NC_007513	GGC	2	6	697118	697123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78184266
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14083	NC_007513	CATG	2	8	697178	697185	25 %	25 %	25 %	25 %	78184266
14084	NC_007513	GCC	2	6	697246	697251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78184266
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14091	NC_007513	GGGT	2	8	697606	697613	0 %	25 %	75 %	0 %	78184266
14092	NC_007513	CAA	2	6	697697	697702	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78184266
14093	NC_007513	T	7	7	697714	697720	0 %	100 %	0 %	0 %	78184266
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14099	NC_007513	AGG	2	6	697815	697820	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78184266
14100	NC_007513	CAC	2	6	697844	697849	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78184266
14101	NC_007513	GGC	2	6	697871	697876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78184266
14102	NC_007513	CCA	2	6	697900	697905	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78184266
14103	NC_007513	GTCG	2	8	697924	697931	0 %	25 %	50 %	25 %	78184266
14104	NC_007513	CCA	2	6	697993	697998	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78184266
14105	NC_007513	CCA	2	6	698026	698031	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78184266
14106	NC_007513	ACG	2	6	698064	698069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184266
14107	NC_007513	GTC	2	6	698087	698092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184266
14108	NC_007513	CCA	2	6	698183	698188	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14109	NC_007513	GGC	3	9	698285	698293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78184267
14110	NC_007513	TGG	2	6	698392	698397	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184267
14111	NC_007513	CTGC	2	8	698399	698406	0 %	25 %	25 %	50 %	78184267
14112	NC_007513	TGG	2	6	698413	698418	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184267
14113	NC_007513	GCA	2	6	698437	698442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184267
14114	NC_007513	GCTG	2	8	698503	698510	0 %	25 %	50 %	25 %	78184267
14115	NC_007513	GGT	2	6	698585	698590	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184267
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14117	NC_007513	T	6	6	698631	698636	0 %	100 %	0 %	0 %	78184267
14118	NC_007513	GTG	2	6	698647	698652	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184267
14119	NC_007513	GTG	3	9	698700	698708	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184267
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14486	NC_007513	GCT	2	6	715949	715954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184281
14487	NC_007513	CGC	2	6	715955	715960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78184281
14488	NC_007513	AGG	2	6	715962	715967	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78184281
14489	NC_007513	ATC	2	6	715979	715984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78184281
14490	NC_007513	CCA	2	6	716029	716034	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78184281
14491	NC_007513	CCCGGC	2	12	716051	716062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78184281
14492	NC_007513	GATCG	2	10	716090	716099	20 %	20 %	40 %	20 %	78184281
14493	NC_007513	GTT	2	6	716117	716122	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78184281
14494	NC_007513	GGGT	2	8	716164	716171	0 %	25 %	75 %	0 %	78184281
14495	NC_007513	GA	5	10	716180	716189	50 %	0 %	50 %	0 %	78184281
14496	NC_007513	CGG	2	6	716368	716373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78184281
14497	NC_007513	ATCC	2	8	716380	716387	25 %	25 %	0 %	50 %	78184281
14498	NC_007513	AGC	2	6	716453	716458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184281
14499	NC_007513	GTG	2	6	716493	716498	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184281
14500	NC_007513	TGA	2	6	716503	716508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78184281

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