MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. CC9902 chromosome

Total Repeats: 44761

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13502	NC_007513	GA	3	6	668421	668426	50 %	0 %	50 %	0 %	78184235
13503	NC_007513	TGG	2	6	668497	668502	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184235
13504	NC_007513	CCGT	2	8	668885	668892	0 %	25 %	25 %	50 %	78184236
13505	NC_007513	CAG	2	6	668924	668929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184236
13506	NC_007513	GCA	2	6	668935	668940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184236
13507	NC_007513	GAG	2	6	668951	668956	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78184236
13508	NC_007513	TCC	2	6	668960	668965	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78184236
13509	NC_007513	GCA	2	6	668986	668991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184236
13510	NC_007513	GTG	2	6	669015	669020	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184236
13511	NC_007513	ACC	2	6	669055	669060	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78184236
13512	NC_007513	CAT	2	6	669101	669106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78184236
13513	NC_007513	TGG	2	6	669120	669125	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184236
13514	NC_007513	TGG	2	6	669192	669197	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184236
13515	NC_007513	TGAT	2	8	669198	669205	25 %	50 %	25 %	0 %	78184236
13516	NC_007513	GT	3	6	669255	669260	0 %	50 %	50 %	0 %	78184236
13517	NC_007513	GGC	2	6	669280	669285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78184236
13518	NC_007513	TTGG	2	8	669383	669390	0 %	50 %	50 %	0 %	78184236
13519	NC_007513	GGTC	2	8	669397	669404	0 %	25 %	50 %	25 %	78184236
13520	NC_007513	ACG	2	6	669573	669578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184237
13521	NC_007513	CAGTT	2	10	669699	669708	20 %	40 %	20 %	20 %	78184237
13522	NC_007513	GCT	2	6	669738	669743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184237
13523	NC_007513	GTT	2	6	669788	669793	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78184237
13524	NC_007513	TGGT	2	8	669813	669820	0 %	50 %	50 %	0 %	78184237
13525	NC_007513	GAG	2	6	669885	669890	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78184237
13526	NC_007513	GGT	3	9	669995	670003	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184237
13527	NC_007513	TGGA	2	8	670024	670031	25 %	25 %	50 %	0 %	78184237
13528	NC_007513	GCT	2	6	670049	670054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184237
13529	NC_007513	GTC	2	6	670055	670060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184237
13530	NC_007513	CT	3	6	670071	670076	0 %	50 %	0 %	50 %	78184237
13531	NC_007513	GCA	2	6	670119	670124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184237
13532	NC_007513	CACG	2	8	670187	670194	25 %	0 %	25 %	50 %	78184237
13533	NC_007513	TTG	2	6	670200	670205	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78184237
13534	NC_007513	TG	3	6	670227	670232	0 %	50 %	50 %	0 %	78184237
13535	NC_007513	CTT	2	6	670307	670312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78184237
13536	NC_007513	CA	3	6	670328	670333	50 %	0 %	0 %	50 %	78184237
13537	NC_007513	GGCT	2	8	670427	670434	0 %	25 %	50 %	25 %	78184237
13538	NC_007513	GCTT	2	8	670474	670481	0 %	50 %	25 %	25 %	78184237
13539	NC_007513	TTG	2	6	670629	670634	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78184237
13540	NC_007513	GCG	2	6	670660	670665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78184237
13541	NC_007513	GCTT	2	8	670670	670677	0 %	50 %	25 %	25 %	78184237
13542	NC_007513	GGA	3	9	670689	670697	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78184237
13543	NC_007513	C	6	6	670705	670710	0 %	0 %	0 %	100 %	78184237
13544	NC_007513	T	6	6	670722	670727	0 %	100 %	0 %	0 %	78184237
13545	NC_007513	TGG	2	6	670750	670755	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184237
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13548	NC_007513	TGG	2	6	671149	671154	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184237
13549	NC_007513	TTG	2	6	671206	671211	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78184237
13550	NC_007513	GCT	2	6	671276	671281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184237
13551	NC_007513	CTG	2	6	671286	671291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184237
13552	NC_007513	AGC	2	6	671317	671322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184237
13553	NC_007513	TGG	2	6	671365	671370	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184237
13554	NC_007513	ACA	2	6	671443	671448	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78184237
13555	NC_007513	GC	3	6	671589	671594	0 %	0 %	50 %	50 %	78184238
13556	NC_007513	CGT	2	6	671595	671600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184238
13557	NC_007513	CAG	2	6	671662	671667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184238
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13560	NC_007513	TCG	2	6	671712	671717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184238
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13562	NC_007513	GC	3	6	671790	671795	0 %	0 %	50 %	50 %	78184238
13563	NC_007513	CAG	2	6	671830	671835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184238
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13592	NC_007513	TGATT	2	10	673349	673358	20 %	60 %	20 %	0 %	78184239
13593	NC_007513	CAG	2	6	673412	673417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184240
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13602	NC_007513	CAAGG	2	10	673612	673621	40 %	0 %	40 %	20 %	78184240
13603	NC_007513	CCG	2	6	673630	673635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78184240
13604	NC_007513	TGG	3	9	673639	673647	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184240
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13606	NC_007513	TTTG	2	8	673695	673702	0 %	75 %	25 %	0 %	78184240
13607	NC_007513	GC	3	6	673703	673708	0 %	0 %	50 %	50 %	78184240
13608	NC_007513	TGC	2	6	673773	673778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184240
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13610	NC_007513	ATCG	2	8	673840	673847	25 %	25 %	25 %	25 %	78184240
13611	NC_007513	GCC	2	6	673882	673887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78184240
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13619	NC_007513	GGAG	2	8	674206	674213	25 %	0 %	75 %	0 %	78184240
13620	NC_007513	GT	3	6	674232	674237	0 %	50 %	50 %	0 %	78184240
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13745	NC_007513	AGG	2	6	680408	680413	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78184245
13746	NC_007513	GAA	2	6	680449	680454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78184245
13747	NC_007513	GCT	2	6	680458	680463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184245
13748	NC_007513	CGA	2	6	680547	680552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184245
13749	NC_007513	GCA	2	6	680574	680579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184245
13750	NC_007513	CAA	2	6	680613	680618	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78184245
13751	NC_007513	GCC	2	6	680629	680634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78184245
13752	NC_007513	AGC	3	9	680681	680689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184245
13753	NC_007513	CAG	2	6	680724	680729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184245
13754	NC_007513	ACG	3	9	680757	680765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184245
13755	NC_007513	AGG	2	6	680784	680789	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78184245
13756	NC_007513	CAGC	2	8	680809	680816	25 %	0 %	25 %	50 %	78184245
13757	NC_007513	GC	3	6	680928	680933	0 %	0 %	50 %	50 %	78184245
13758	NC_007513	GC	3	6	681098	681103	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13759	NC_007513	GCA	2	6	681149	681154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184246
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13761	NC_007513	CTT	2	6	681235	681240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78184246
13762	NC_007513	CGC	2	6	681346	681351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78184246
13763	NC_007513	CCT	2	6	681363	681368	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78184246
13764	NC_007513	CGC	3	9	681539	681547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78184246
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13766	NC_007513	AGGA	2	8	681627	681634	50 %	0 %	50 %	0 %	78184246
13767	NC_007513	TCG	2	6	681699	681704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184247
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13770	NC_007513	TGC	2	6	681876	681881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184247
13771	NC_007513	CGT	2	6	681916	681921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184247
13772	NC_007513	ACG	2	6	681929	681934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184247
13773	NC_007513	GTG	2	6	681952	681957	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184247
13774	NC_007513	GTT	2	6	681976	681981	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78184247
13775	NC_007513	CGTTC	2	10	682009	682018	0 %	40 %	20 %	40 %	78184247
13776	NC_007513	TTG	2	6	682046	682051	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78184247
13777	NC_007513	GAGAA	2	10	682103	682112	60 %	0 %	40 %	0 %	78184247
13778	NC_007513	GTT	2	6	682309	682314	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78184247
13779	NC_007513	GGATC	2	10	682332	682341	20 %	20 %	40 %	20 %	78184247
13780	NC_007513	AGCC	2	8	682347	682354	25 %	0 %	25 %	50 %	78184247
13781	NC_007513	TCA	2	6	682484	682489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78184248
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13783	NC_007513	CTTTCA	2	12	682622	682633	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	78184248
13784	NC_007513	CCA	3	9	682748	682756	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78184248
13785	NC_007513	CGG	2	6	682822	682827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78184248
13786	NC_007513	TCC	2	6	682867	682872	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78184248
13787	NC_007513	CTG	2	6	682901	682906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184249
13788	NC_007513	CTG	2	6	682915	682920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184249
13789	NC_007513	CTG	2	6	682923	682928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184249
13790	NC_007513	CCAG	2	8	682945	682952	25 %	0 %	25 %	50 %	78184249
13791	NC_007513	GCA	2	6	682954	682959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184249
13792	NC_007513	GTTGT	2	10	683116	683125	0 %	60 %	40 %	0 %	78184249
13793	NC_007513	CGGT	2	8	683212	683219	0 %	25 %	50 %	25 %	78184249
13794	NC_007513	CGG	2	6	683220	683225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78184249
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13797	NC_007513	TGC	2	6	683311	683316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184249
13798	NC_007513	CGT	2	6	683388	683393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184249
13799	NC_007513	CGT	3	9	683406	683414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184249
13800	NC_007513	TGC	2	6	683450	683455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184249
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13803	NC_007513	GCC	2	6	683682	683687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78184249
13804	NC_007513	GCC	2	6	683704	683709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78184249
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13807	NC_007513	ATC	2	6	683935	683940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78184250
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13812	NC_007513	CCTG	2	8	684187	684194	0 %	25 %	25 %	50 %	78184250
13813	NC_007513	GGT	2	6	684251	684256	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184250
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13815	NC_007513	GCT	4	12	684368	684379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184250
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13818	NC_007513	GCG	2	6	684593	684598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78184250
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13821	NC_007513	GTGG	2	8	684691	684698	0 %	25 %	75 %	0 %	78184250
13822	NC_007513	TGG	2	6	684929	684934	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184250
13823	NC_007513	GCC	3	9	684935	684943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78184250
13824	NC_007513	GCG	2	6	684968	684973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78184250
13825	NC_007513	GCC	2	6	685137	685142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162138555
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13827	NC_007513	GATT	2	8	685206	685213	25 %	50 %	25 %	0 %	162138555
13828	NC_007513	CAG	2	6	685214	685219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13829	NC_007513	TGG	2	6	685277	685282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184252
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13832	NC_007513	GGC	2	6	685374	685379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78184252
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13834	NC_007513	GCC	2	6	685477	685482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78184252
13835	NC_007513	CTG	2	6	685657	685662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184252
13836	NC_007513	TCC	2	6	685688	685693	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78184252
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13839	NC_007513	GT	3	6	685943	685948	0 %	50 %	50 %	0 %	78184252
13840	NC_007513	GGT	3	9	686050	686058	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184252
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13843	NC_007513	A	6	6	686212	686217	100 %	0 %	0 %	0 %	78184252
13844	NC_007513	GCTCA	2	10	686291	686300	20 %	20 %	20 %	40 %	78184253
13845	NC_007513	CT	3	6	686327	686332	0 %	50 %	0 %	50 %	78184253
13846	NC_007513	CGTG	2	8	686357	686364	0 %	25 %	50 %	25 %	78184253
13847	NC_007513	AGA	2	6	686413	686418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78184253
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13852	NC_007513	GGA	2	6	686550	686555	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78184254
13853	NC_007513	TTGT	2	8	686589	686596	0 %	75 %	25 %	0 %	78184254
13854	NC_007513	TGGCAG	2	12	686718	686729	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	78184254
13855	NC_007513	GTG	2	6	686822	686827	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184254
13856	NC_007513	ACA	2	6	686858	686863	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78184254
13857	NC_007513	TTG	2	6	686873	686878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78184254
13858	NC_007513	CGA	2	6	686910	686915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184254
13859	NC_007513	TGA	2	6	686934	686939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78184254
13860	NC_007513	GGT	2	6	687037	687042	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184254
13861	NC_007513	AG	3	6	687141	687146	50 %	0 %	50 %	0 %	78184254
13862	NC_007513	CCG	2	6	687165	687170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78184254
13863	NC_007513	TCG	2	6	687257	687262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184254
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13865	NC_007513	TGC	2	6	687286	687291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184254
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13989	NC_007513	CTG	2	6	693691	693696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184261
13990	NC_007513	CAGTT	2	10	693718	693727	20 %	40 %	20 %	20 %	78184261
13991	NC_007513	GAT	2	6	693736	693741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78184261
13992	NC_007513	GTT	2	6	693755	693760	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78184261
13993	NC_007513	CCG	2	6	693783	693788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78184261
13994	NC_007513	TTG	2	6	693832	693837	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78184262
13995	NC_007513	TGC	2	6	693850	693855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184262
13996	NC_007513	CCAC	2	8	693897	693904	25 %	0 %	0 %	75 %	78184262
13997	NC_007513	CA	3	6	693909	693914	50 %	0 %	0 %	50 %	78184262
13998	NC_007513	TGA	2	6	693919	693924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78184262
13999	NC_007513	GTG	2	6	693925	693930	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184262
14000	NC_007513	CAT	2	6	693974	693979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78184262

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