MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. CC9902 chromosome

Total Repeats: 44761

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_007513	CAC	2	6	617661	617666	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78184184
12502	NC_007513	GAA	2	6	617698	617703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78184184
12503	NC_007513	GCA	2	6	617777	617782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184184
12504	NC_007513	A	6	6	617878	617883	100 %	0 %	0 %	0 %	78184184
12505	NC_007513	CAA	2	6	617961	617966	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78184184
12506	NC_007513	GTT	2	6	617976	617981	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78184184
12507	NC_007513	GAT	2	6	617982	617987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78184184
12508	NC_007513	GTT	2	6	618022	618027	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78184184
12509	NC_007513	GTT	2	6	618055	618060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78184184
12510	NC_007513	TTC	2	6	618083	618088	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78184184
12511	NC_007513	ATT	2	6	618094	618099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78184184
12512	NC_007513	GTG	2	6	618104	618109	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184184
12513	NC_007513	CTG	2	6	618421	618426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184184
12514	NC_007513	ACT	2	6	618435	618440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78184184
12515	NC_007513	TC	3	6	618515	618520	0 %	50 %	0 %	50 %	78184184
12516	NC_007513	TCG	2	6	618555	618560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184184
12517	NC_007513	TGT	2	6	618642	618647	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78184184
12518	NC_007513	GTT	2	6	618682	618687	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78184184
12519	NC_007513	TCG	2	6	618720	618725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184184
12520	NC_007513	TTG	2	6	618731	618736	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78184184
12521	NC_007513	ACC	3	9	618751	618759	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78184184
12522	NC_007513	CCGT	2	8	618778	618785	0 %	25 %	25 %	50 %	78184184
12523	NC_007513	GGTG	2	8	618789	618796	0 %	25 %	75 %	0 %	78184184
12524	NC_007513	AGCG	2	8	618822	618829	25 %	0 %	50 %	25 %	78184184
12525	NC_007513	TTG	2	6	618843	618848	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78184184
12526	NC_007513	GCA	2	6	618872	618877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184184
12527	NC_007513	GTC	2	6	618896	618901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184184
12528	NC_007513	CT	3	6	618974	618979	0 %	50 %	0 %	50 %	78184184
12529	NC_007513	AGA	2	6	618995	619000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78184184
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12531	NC_007513	CTG	2	6	619039	619044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184184
12532	NC_007513	CGT	2	6	619051	619056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184184
12533	NC_007513	CGA	2	6	619152	619157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184184
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12538	NC_007513	AAG	2	6	619325	619330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78184184
12539	NC_007513	GCA	2	6	619344	619349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184184
12540	NC_007513	GAC	2	6	619402	619407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184184
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12542	NC_007513	GTG	2	6	619544	619549	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184184
12543	NC_007513	GCG	2	6	619621	619626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78184184
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12545	NC_007513	CTG	2	6	619730	619735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184184
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12547	NC_007513	GGA	2	6	619803	619808	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78184184
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12549	NC_007513	C	6	6	619864	619869	0 %	0 %	0 %	100 %	78184184
12550	NC_007513	TGC	2	6	619965	619970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184184
12551	NC_007513	GTT	2	6	620014	620019	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78184184
12552	NC_007513	AAG	2	6	620045	620050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78184184
12553	NC_007513	CT	3	6	620059	620064	0 %	50 %	0 %	50 %	78184184
12554	NC_007513	ATTG	2	8	620095	620102	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12555	NC_007513	GTT	2	6	620244	620249	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78184185
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12563	NC_007513	TCG	2	6	620696	620701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184186
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12570	NC_007513	ATC	2	6	621061	621066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78184186
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12581	NC_007513	TGG	2	6	621427	621432	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12582	NC_007513	TGA	2	6	621435	621440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12585	NC_007513	TGG	2	6	621514	621519	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12586	NC_007513	CTT	3	9	621547	621555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78184187
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12589	NC_007513	TCG	2	6	621629	621634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184187
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12594	NC_007513	CGGAG	2	10	621817	621826	20 %	0 %	60 %	20 %	78184187
12595	NC_007513	TGC	4	12	621867	621878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184187
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12601	NC_007513	GGT	2	6	622068	622073	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184187
12602	NC_007513	TGG	2	6	622074	622079	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184187
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12604	NC_007513	GCT	2	6	622153	622158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184187
12605	NC_007513	TGCA	2	8	622160	622167	25 %	25 %	25 %	25 %	78184187
12606	NC_007513	TTG	2	6	622222	622227	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78184187
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12608	NC_007513	TCG	2	6	622335	622340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184187
12609	NC_007513	GGC	2	6	622348	622353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78184187
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12611	NC_007513	GCTG	2	8	622408	622415	0 %	25 %	50 %	25 %	78184187
12612	NC_007513	ACT	2	6	622433	622438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78184187
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12617	NC_007513	TTGG	2	8	622696	622703	0 %	50 %	50 %	0 %	78184187
12618	NC_007513	CCA	2	6	622709	622714	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78184187
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12622	NC_007513	TGG	2	6	622837	622842	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184187
12623	NC_007513	TGC	3	9	622851	622859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184187
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12989	NC_007513	TCT	2	6	642470	642475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78184210
12990	NC_007513	ATAA	2	8	642478	642485	75 %	25 %	0 %	0 %	78184210
12991	NC_007513	T	7	7	642580	642586	0 %	100 %	0 %	0 %	78184210
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