MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. CC9902 chromosome

Total Repeats: 44761

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12002	NC_007513	ACG	2	6	592246	592251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184164
12003	NC_007513	CGTT	2	8	592319	592326	0 %	50 %	25 %	25 %	78184164
12004	NC_007513	GGC	2	6	592345	592350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78184164
12005	NC_007513	TGT	2	6	592471	592476	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78184164
12006	NC_007513	CCAGC	2	10	592493	592502	20 %	0 %	20 %	60 %	78184164
12007	NC_007513	TGA	2	6	592525	592530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78184164
12008	NC_007513	TGA	2	6	592550	592555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78184164
12009	NC_007513	TCAA	2	8	592574	592581	50 %	25 %	0 %	25 %	78184164
12010	NC_007513	TTG	2	6	592617	592622	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78184164
12011	NC_007513	TGT	2	6	592668	592673	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78184164
12012	NC_007513	TTA	2	6	592680	592685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78184164
12013	NC_007513	GAT	2	6	592701	592706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78184164
12014	NC_007513	TGC	2	6	592715	592720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184164
12015	NC_007513	TATT	2	8	592747	592754	25 %	75 %	0 %	0 %	78184164
12016	NC_007513	TCA	2	6	592807	592812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78184164
12017	NC_007513	TGC	2	6	592838	592843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184164
12018	NC_007513	CAGC	2	8	592877	592884	25 %	0 %	25 %	50 %	78184164
12019	NC_007513	TTTTGC	2	12	592906	592917	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	78184164
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12022	NC_007513	TGC	2	6	593060	593065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184165
12023	NC_007513	TGG	2	6	593070	593075	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184165
12024	NC_007513	TTA	2	6	593077	593082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78184165
12025	NC_007513	TGG	2	6	593096	593101	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184165
12026	NC_007513	TGA	2	6	593118	593123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78184165
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12031	NC_007513	GCTG	2	8	593452	593459	0 %	25 %	50 %	25 %	78184165
12032	NC_007513	TCG	2	6	593628	593633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184165
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12039	NC_007513	GCA	2	6	594030	594035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184165
12040	NC_007513	TTCG	2	8	594111	594118	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
12041	NC_007513	AGT	2	6	594184	594189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78184166
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12047	NC_007513	TTGCT	2	10	594541	594550	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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12052	NC_007513	TGA	2	6	594841	594846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12053	NC_007513	ATT	2	6	594970	594975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12054	NC_007513	CTA	2	6	594999	595004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12062	NC_007513	CCGTC	2	10	595284	595293	0 %	20 %	20 %	60 %	78184167
12063	NC_007513	ATG	2	6	595322	595327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78184167
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12121	NC_007513	GTC	2	6	597919	597924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184169
12122	NC_007513	GCG	2	6	597959	597964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78184169
12123	NC_007513	CAA	2	6	598000	598005	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78184169
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12125	NC_007513	AGC	2	6	598109	598114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184169
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12130	NC_007513	CTT	2	6	598245	598250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78184169
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12151	NC_007513	GGCT	2	8	599007	599014	0 %	25 %	50 %	25 %	78184169
12152	NC_007513	CTG	2	6	599029	599034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184169
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12226	NC_007513	A	7	7	602418	602424	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12227	NC_007513	GTG	2	6	602458	602463	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184172
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12232	NC_007513	CAG	2	6	602823	602828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184172
12233	NC_007513	CA	3	6	602837	602842	50 %	0 %	0 %	50 %	78184172
12234	NC_007513	GCT	2	6	602879	602884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184172
12235	NC_007513	AGA	2	6	602896	602901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78184172
12236	NC_007513	GTTG	2	8	603027	603034	0 %	50 %	50 %	0 %	78184173
12237	NC_007513	CTT	2	6	603172	603177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78184173
12238	NC_007513	CTG	2	6	603193	603198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184173
12239	NC_007513	TAC	2	6	603317	603322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78184174
12240	NC_007513	GTT	2	6	603341	603346	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78184174
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12242	NC_007513	CT	3	6	603368	603373	0 %	50 %	0 %	50 %	78184174
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12364	NC_007513	TGGCC	2	10	610435	610444	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
12365	NC_007513	TCT	2	6	610557	610562	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12487	NC_007513	GGT	2	6	616809	616814	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184184
12488	NC_007513	GCTG	2	8	616833	616840	0 %	25 %	50 %	25 %	78184184
12489	NC_007513	CT	3	6	616867	616872	0 %	50 %	0 %	50 %	78184184
12490	NC_007513	AGGC	2	8	616886	616893	25 %	0 %	50 %	25 %	78184184
12491	NC_007513	CAT	2	6	617013	617018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78184184
12492	NC_007513	GGT	2	6	617077	617082	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184184
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12494	NC_007513	GTG	2	6	617099	617104	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184184
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