MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. CC9902 chromosome

Total Repeats: 44761

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_007513	TGTA	2	8	567246	567253	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11502	NC_007513	CTG	2	6	567255	567260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11503	NC_007513	GAT	2	6	567324	567329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11504	NC_007513	GTCG	2	8	567402	567409	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11505	NC_007513	CCA	2	6	567479	567484	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78184137
11506	NC_007513	CCG	2	6	567544	567549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78184137
11507	NC_007513	ACC	2	6	567568	567573	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78184137
11508	NC_007513	AGT	2	6	567616	567621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78184137
11509	NC_007513	GAA	2	6	567661	567666	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78184137
11510	NC_007513	GC	3	6	567676	567681	0 %	0 %	50 %	50 %	78184138
11511	NC_007513	CGATAT	2	12	567769	567780	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	78184138
11512	NC_007513	GCC	2	6	567839	567844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78184138
11513	NC_007513	GTT	2	6	567980	567985	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78184138
11514	NC_007513	CGA	2	6	568018	568023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184138
11515	NC_007513	GCC	2	6	568108	568113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78184138
11516	NC_007513	GTT	2	6	568127	568132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78184138
11517	NC_007513	GGC	2	6	568154	568159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78184138
11518	NC_007513	CGG	2	6	568183	568188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78184138
11519	NC_007513	AGG	2	6	568210	568215	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78184138
11520	NC_007513	CCA	3	9	568216	568224	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78184138
11521	NC_007513	CGG	2	6	568240	568245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78184138
11522	NC_007513	TCA	2	6	568309	568314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78184138
11523	NC_007513	C	6	6	568329	568334	0 %	0 %	0 %	100 %	78184138
11524	NC_007513	CCG	2	6	568350	568355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78184138
11525	NC_007513	GGCGA	2	10	568385	568394	20 %	0 %	60 %	20 %	78184138
11526	NC_007513	GCTC	2	8	568503	568510	0 %	25 %	25 %	50 %	78184138
11527	NC_007513	GCA	2	6	568548	568553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184138
11528	NC_007513	TGC	2	6	568568	568573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184138
11529	NC_007513	GCG	2	6	568659	568664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78184138
11530	NC_007513	TTC	2	6	568712	568717	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78184138
11531	NC_007513	GCC	2	6	568863	568868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78184138
11532	NC_007513	CTG	2	6	568997	569002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184138
11533	NC_007513	GCT	2	6	569012	569017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184138
11534	NC_007513	CCG	2	6	569047	569052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78184138
11535	NC_007513	TGG	2	6	569053	569058	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184138
11536	NC_007513	CGA	2	6	569080	569085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184138
11537	NC_007513	CGC	2	6	569095	569100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78184138
11538	NC_007513	TGG	2	6	569116	569121	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184138
11539	NC_007513	TTA	2	6	569234	569239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78184139
11540	NC_007513	TGT	2	6	569267	569272	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78184139
11541	NC_007513	GCG	2	6	569281	569286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78184139
11542	NC_007513	GT	3	6	569292	569297	0 %	50 %	50 %	0 %	78184139
11543	NC_007513	CAG	2	6	569443	569448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184139
11544	NC_007513	G	7	7	569466	569472	0 %	0 %	100 %	0 %	78184139
11545	NC_007513	AAAT	2	8	569486	569493	75 %	25 %	0 %	0 %	78184139
11546	NC_007513	GGC	2	6	569494	569499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78184139
11547	NC_007513	GGC	2	6	569590	569595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78184139
11548	NC_007513	GCT	2	6	569682	569687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184139
11549	NC_007513	GCT	2	6	569852	569857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184140
11550	NC_007513	AGT	2	6	569925	569930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78184140
11551	NC_007513	TTC	2	6	569969	569974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78184140
11552	NC_007513	GTT	2	6	569984	569989	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78184140
11553	NC_007513	GCG	2	6	570019	570024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78184140
11554	NC_007513	GTC	2	6	570104	570109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184140
11555	NC_007513	C	7	7	570127	570133	0 %	0 %	0 %	100 %	78184140
11556	NC_007513	AAG	2	6	570149	570154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78184140
11557	NC_007513	CTG	2	6	570194	570199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184140
11558	NC_007513	GAC	2	6	570282	570287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184140
11559	NC_007513	GCA	2	6	570316	570321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184140
11560	NC_007513	TCA	2	6	570466	570471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78184141
11561	NC_007513	TGT	2	6	570490	570495	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78184141
11562	NC_007513	GCG	2	6	570503	570508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78184141
11563	NC_007513	GTG	2	6	570633	570638	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184141
11564	NC_007513	CAACGG	2	12	570700	570711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184141
11565	NC_007513	AG	3	6	570717	570722	50 %	0 %	50 %	0 %	78184141
11566	NC_007513	T	6	6	570726	570731	0 %	100 %	0 %	0 %	78184141
11567	NC_007513	CCA	2	6	570836	570841	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78184142
11568	NC_007513	GTG	2	6	571034	571039	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184142
11569	NC_007513	CGG	3	9	571057	571065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78184142
11570	NC_007513	CTG	2	6	571068	571073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184142
11571	NC_007513	CCA	2	6	571144	571149	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78184142
11572	NC_007513	CAG	2	6	571215	571220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184142
11573	NC_007513	AGC	2	6	571241	571246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184142
11574	NC_007513	CCA	2	6	571277	571282	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78184142
11575	NC_007513	CGT	2	6	571334	571339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184142
11576	NC_007513	CAAA	2	8	571406	571413	75 %	0 %	0 %	25 %	78184142
11577	NC_007513	TC	3	6	571468	571473	0 %	50 %	0 %	50 %	78184142
11578	NC_007513	TGG	2	6	571545	571550	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11579	NC_007513	ATG	2	6	571562	571567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11580	NC_007513	AACG	2	8	571624	571631	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11581	NC_007513	CTT	2	6	571650	571655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78184143
11582	NC_007513	CAG	2	6	571705	571710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184143
11583	NC_007513	AAG	2	6	571756	571761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78184143
11584	NC_007513	GGA	2	6	571779	571784	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78184143
11585	NC_007513	AGC	2	6	571859	571864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184143
11586	NC_007513	ACC	2	6	571924	571929	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78184143
11587	NC_007513	CGT	2	6	572038	572043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184144
11588	NC_007513	GCTGAG	2	12	572136	572147	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	78184144
11589	NC_007513	CCGT	2	8	572150	572157	0 %	25 %	25 %	50 %	78184144
11590	NC_007513	ACA	2	6	572449	572454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78184144
11591	NC_007513	AGA	2	6	572534	572539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78184144
11592	NC_007513	ACA	2	6	572554	572559	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78184144
11593	NC_007513	CCT	2	6	572597	572602	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78184144
11594	NC_007513	TGT	2	6	572725	572730	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78184144
11595	NC_007513	TTGG	2	8	572739	572746	0 %	50 %	50 %	0 %	78184144
11596	NC_007513	A	6	6	572761	572766	100 %	0 %	0 %	0 %	78184144
11597	NC_007513	GAC	2	6	572802	572807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184144
11598	NC_007513	GA	3	6	572914	572919	50 %	0 %	50 %	0 %	78184144
11599	NC_007513	TGGT	2	8	573004	573011	0 %	50 %	50 %	0 %	78184144
11600	NC_007513	TTGC	2	8	573051	573058	0 %	50 %	25 %	25 %	78184144
11601	NC_007513	TGA	2	6	573088	573093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78184144
11602	NC_007513	CAG	2	6	573113	573118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184144
11603	NC_007513	GCG	2	6	573128	573133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78184144
11604	NC_007513	G	6	6	573143	573148	0 %	0 %	100 %	0 %	78184144
11605	NC_007513	TGC	2	6	573149	573154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184144
11606	NC_007513	A	6	6	573169	573174	100 %	0 %	0 %	0 %	78184144
11607	NC_007513	TGC	2	6	573226	573231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184144
11608	NC_007513	A	7	7	573240	573246	100 %	0 %	0 %	0 %	78184144
11609	NC_007513	TGA	2	6	573357	573362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78184145
11610	NC_007513	GGCT	2	8	573388	573395	0 %	25 %	50 %	25 %	78184145
11611	NC_007513	TGG	2	6	573413	573418	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184145
11612	NC_007513	GCA	2	6	573489	573494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184145
11613	NC_007513	ACG	2	6	573542	573547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184145
11614	NC_007513	AAC	2	6	573746	573751	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78184145
11615	NC_007513	T	6	6	573823	573828	0 %	100 %	0 %	0 %	78184145
11616	NC_007513	TGAT	2	8	573834	573841	25 %	50 %	25 %	0 %	78184145
11617	NC_007513	TGCA	2	8	573907	573914	25 %	25 %	25 %	25 %	78184145
11618	NC_007513	CGG	2	6	573924	573929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78184145
11619	NC_007513	TGG	2	6	573994	573999	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184145
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11990	NC_007513	ACA	2	6	591685	591690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78184163
11991	NC_007513	AGG	2	6	591696	591701	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78184163
11992	NC_007513	GGCGTT	2	12	591710	591721	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	78184163
11993	NC_007513	GCA	2	6	591757	591762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11994	NC_007513	CGGC	2	8	591815	591822	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11995	NC_007513	CAACG	2	10	591847	591856	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
11996	NC_007513	GTTG	3	12	591946	591957	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11997	NC_007513	GGC	2	6	591965	591970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78184164
11998	NC_007513	GTTGCC	2	12	592032	592043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184164
11999	NC_007513	TCT	2	6	592142	592147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78184164
12000	NC_007513	GAT	2	6	592149	592154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78184164

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