MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. CC9902 chromosome

Total Repeats: 44761

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_007513	GTT	2	6	539381	539386	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78184105
11002	NC_007513	TGA	2	6	539507	539512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78184105
11003	NC_007513	AGC	2	6	539533	539538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184105
11004	NC_007513	TTC	2	6	539575	539580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78184105
11005	NC_007513	GGAT	2	8	539629	539636	25 %	25 %	50 %	0 %	78184105
11006	NC_007513	ACG	2	6	539670	539675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184105
11007	NC_007513	TTTG	2	8	539680	539687	0 %	75 %	25 %	0 %	78184105
11008	NC_007513	CG	3	6	539823	539828	0 %	0 %	50 %	50 %	78184105
11009	NC_007513	CCT	2	6	539909	539914	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78184105
11010	NC_007513	CGA	2	6	539922	539927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184105
11011	NC_007513	TTG	2	6	540030	540035	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78184105
11012	NC_007513	GTT	2	6	540119	540124	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78184105
11013	NC_007513	AC	3	6	540134	540139	50 %	0 %	0 %	50 %	78184105
11014	NC_007513	ATCA	2	8	540290	540297	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11015	NC_007513	CAA	2	6	540342	540347	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78184106
11016	NC_007513	TGA	2	6	540363	540368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78184106
11017	NC_007513	GCA	2	6	540385	540390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184106
11018	NC_007513	GAC	2	6	540499	540504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184106
11019	NC_007513	GAA	2	6	540580	540585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78184106
11020	NC_007513	CCA	2	6	540599	540604	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11021	NC_007513	ACC	2	6	540629	540634	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11022	NC_007513	T	6	6	540648	540653	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11023	NC_007513	T	6	6	540655	540660	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11024	NC_007513	GTC	2	6	540695	540700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11025	NC_007513	CTG	2	6	540725	540730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184107
11026	NC_007513	G	6	6	540758	540763	0 %	0 %	100 %	0 %	78184107
11027	NC_007513	GGA	2	6	540846	540851	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78184107
11028	NC_007513	GGC	2	6	540867	540872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78184107
11029	NC_007513	GC	3	6	540905	540910	0 %	0 %	50 %	50 %	78184107
11030	NC_007513	CGT	2	6	540918	540923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184107
11031	NC_007513	TCCG	2	8	540983	540990	0 %	25 %	25 %	50 %	78184107
11032	NC_007513	GTG	2	6	541012	541017	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184107
11033	NC_007513	CTCG	2	8	541032	541039	0 %	25 %	25 %	50 %	78184107
11034	NC_007513	TTGA	2	8	541076	541083	25 %	50 %	25 %	0 %	78184107
11035	NC_007513	GAT	2	6	541124	541129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11036	NC_007513	GGTT	2	8	541228	541235	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11037	NC_007513	TAT	2	6	541246	541251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11038	NC_007513	A	7	7	541263	541269	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11039	NC_007513	A	6	6	541279	541284	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11040	NC_007513	TGT	2	6	541304	541309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11041	NC_007513	AAAT	2	8	541363	541370	75 %	25 %	0 %	0 %	78184108
11042	NC_007513	GCC	2	6	541374	541379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78184108
11043	NC_007513	GAC	2	6	541387	541392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184108
11044	NC_007513	TCG	3	9	541444	541452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184108
11045	NC_007513	CGT	2	6	541523	541528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184108
11046	NC_007513	CCA	2	6	541553	541558	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78184108
11047	NC_007513	AGCCAA	2	12	541587	541598	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	78184108
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11050	NC_007513	TCT	2	6	542040	542045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78184109
11051	NC_007513	GGTG	2	8	542083	542090	0 %	25 %	75 %	0 %	78184109
11052	NC_007513	CCG	3	9	542116	542124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78184109
11053	NC_007513	GCC	2	6	542130	542135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78184109
11054	NC_007513	GCT	2	6	542238	542243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184109
11055	NC_007513	CT	3	6	542289	542294	0 %	50 %	0 %	50 %	78184109
11056	NC_007513	GGGA	2	8	542381	542388	25 %	0 %	75 %	0 %	78184109
11057	NC_007513	TCG	2	6	542502	542507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184109
11058	NC_007513	GTC	2	6	542907	542912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11059	NC_007513	TTC	2	6	542922	542927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11060	NC_007513	CTGG	2	8	542938	542945	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11061	NC_007513	GGC	2	6	542957	542962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78184110
11062	NC_007513	GCT	3	9	543112	543120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184110
11063	NC_007513	CGC	2	6	543242	543247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78184110
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11065	NC_007513	CCA	2	6	543421	543426	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78184110
11066	NC_007513	TGC	2	6	543460	543465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184110
11067	NC_007513	GGATG	2	10	543503	543512	20 %	20 %	60 %	0 %	78184110
11068	NC_007513	CGTT	2	8	543593	543600	0 %	50 %	25 %	25 %	78184110
11069	NC_007513	CAG	2	6	543643	543648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184110
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11073	NC_007513	CAGGC	2	10	543854	543863	20 %	0 %	40 %	40 %	78184110
11074	NC_007513	CTG	2	6	543957	543962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184110
11075	NC_007513	CGT	2	6	544001	544006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184110
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11079	NC_007513	GGTG	2	8	544204	544211	0 %	25 %	75 %	0 %	78184110
11080	NC_007513	TAC	2	6	544325	544330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78184110
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11082	NC_007513	TGG	2	6	544406	544411	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184110
11083	NC_007513	TTG	2	6	544480	544485	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78184111
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11087	NC_007513	ATGC	2	8	544842	544849	25 %	25 %	25 %	25 %	78184111
11088	NC_007513	AAC	2	6	544883	544888	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78184111
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11096	NC_007513	TCC	2	6	545203	545208	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78184111
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11101	NC_007513	T	6	6	545829	545834	0 %	100 %	0 %	0 %	78184114
11102	NC_007513	CCG	2	6	545906	545911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78184114
11103	NC_007513	GAG	2	6	545961	545966	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11104	NC_007513	GCA	2	6	545994	545999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11105	NC_007513	ACG	2	6	546003	546008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11106	NC_007513	TTG	2	6	546052	546057	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11107	NC_007513	CAGA	2	8	546065	546072	50 %	0 %	25 %	25 %	78184115
11108	NC_007513	AGA	2	6	546137	546142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78184115
11109	NC_007513	TTG	2	6	546229	546234	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78184115
11110	NC_007513	GCC	2	6	546322	546327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11111	NC_007513	GCC	2	6	546341	546346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11112	NC_007513	GGC	2	6	546417	546422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11113	NC_007513	CTCA	2	8	546445	546452	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11114	NC_007513	TCG	2	6	546462	546467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11115	NC_007513	GTGAG	2	10	546530	546539	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
11116	NC_007513	AGC	2	6	546653	546658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11117	NC_007513	GC	3	6	546657	546662	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11118	NC_007513	CT	3	6	546699	546704	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11119	NC_007513	ATC	2	6	546868	546873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11120	NC_007513	GCA	2	6	546888	546893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11121	NC_007513	T	6	6	546959	546964	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11122	NC_007513	GTT	2	6	547034	547039	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11124	NC_007513	CTG	2	6	547169	547174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184116
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11250	NC_007513	TTC	2	6	553649	553654	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78184124
11251	NC_007513	TG	3	6	553694	553699	0 %	50 %	50 %	0 %	78184124
11252	NC_007513	CCT	2	6	553720	553725	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78184124
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11255	NC_007513	TGAT	2	8	553930	553937	25 %	50 %	25 %	0 %	78184125
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11295	NC_007513	TCA	2	6	555847	555852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78184127
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11366	NC_007513	CGA	2	6	559823	559828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184129
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11370	NC_007513	TTGCAG	3	18	559946	559963	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	78184129
11371	NC_007513	TGG	2	6	559978	559983	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184129
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11394	NC_007513	GCTG	2	8	560724	560731	0 %	25 %	50 %	25 %	78184130
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