MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. CC9902 chromosome

Total Repeats: 44761

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10002	NC_007513	CAG	2	6	489645	489650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184049
10003	NC_007513	TAG	2	6	489712	489717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78184049
10004	NC_007513	CAG	2	6	489793	489798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184049
10005	NC_007513	AAGG	2	8	489945	489952	50 %	0 %	50 %	0 %	78184049
10006	NC_007513	AATC	2	8	489996	490003	50 %	25 %	0 %	25 %	78184049
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10013	NC_007513	CCAA	2	8	490515	490522	50 %	0 %	0 %	50 %	78184050
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10015	NC_007513	TGGTG	2	10	490539	490548	0 %	40 %	60 %	0 %	78184050
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10052	NC_007513	GGT	2	6	491953	491958	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184051
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10095	NC_007513	AC	3	6	494007	494012	50 %	0 %	0 %	50 %	78184055
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10111	NC_007513	GCC	2	6	494880	494885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10112	NC_007513	CAA	2	6	494997	495002	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10114	NC_007513	CCTT	2	8	495137	495144	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10115	NC_007513	CAA	2	6	495162	495167	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10116	NC_007513	GAG	2	6	495182	495187	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10117	NC_007513	AGC	2	6	495219	495224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10119	NC_007513	CCAT	2	8	495371	495378	25 %	25 %	0 %	50 %	78184057
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10121	NC_007513	GCT	2	6	495524	495529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184057
10122	NC_007513	TTC	2	6	495583	495588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78184057
10123	NC_007513	TCAA	2	8	495638	495645	50 %	25 %	0 %	25 %	78184057
10124	NC_007513	CTTG	2	8	495678	495685	0 %	50 %	25 %	25 %	78184057
10125	NC_007513	TGAT	2	8	495699	495706	25 %	50 %	25 %	0 %	78184057
10126	NC_007513	TTG	2	6	495747	495752	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78184057
10127	NC_007513	GTG	3	9	495822	495830	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184057
10128	NC_007513	CGT	2	6	496007	496012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184057
10129	NC_007513	TG	3	6	496040	496045	0 %	50 %	50 %	0 %	78184057
10130	NC_007513	ACGA	2	8	496073	496080	50 %	0 %	25 %	25 %	78184057
10131	NC_007513	CG	3	6	496110	496115	0 %	0 %	50 %	50 %	78184057
10132	NC_007513	TGA	2	6	496155	496160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78184057
10133	NC_007513	CCA	2	6	496227	496232	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78184057
10134	NC_007513	GAG	2	6	496306	496311	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78184057
10135	NC_007513	TGA	2	6	496338	496343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78184057
10136	NC_007513	GCG	2	6	496363	496368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78184057
10137	NC_007513	ACC	2	6	496576	496581	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78184057
10138	NC_007513	CAG	2	6	496690	496695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184057
10139	NC_007513	TGC	2	6	496791	496796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184057
10140	NC_007513	TTC	2	6	496963	496968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78184057
10141	NC_007513	CGG	2	6	496989	496994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78184057
10142	NC_007513	TCGA	2	8	497066	497073	25 %	25 %	25 %	25 %	78184057
10143	NC_007513	CCA	2	6	497112	497117	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78184057
10144	NC_007513	CGTA	2	8	497180	497187	25 %	25 %	25 %	25 %	78184057
10145	NC_007513	CTGG	2	8	497218	497225	0 %	25 %	50 %	25 %	78184057
10146	NC_007513	GAT	2	6	497299	497304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78184057
10147	NC_007513	CTTC	2	8	497354	497361	0 %	50 %	0 %	50 %	78184057
10148	NC_007513	CTG	2	6	497398	497403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184057
10149	NC_007513	CAA	2	6	497458	497463	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78184057
10150	NC_007513	AAG	2	6	497515	497520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78184057
10151	NC_007513	GAC	2	6	497749	497754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184057
10152	NC_007513	GGT	2	6	497893	497898	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184057
10153	NC_007513	GTG	2	6	497915	497920	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184057
10154	NC_007513	GTG	2	6	497943	497948	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184057
10155	NC_007513	GCC	2	6	497950	497955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78184057
10156	NC_007513	GCT	2	6	497972	497977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184057
10157	NC_007513	GCC	2	6	498002	498007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78184057
10158	NC_007513	GGC	2	6	498016	498021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78184057
10159	NC_007513	CTG	2	6	498094	498099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184057
10160	NC_007513	GAG	2	6	498144	498149	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78184057
10161	NC_007513	CG	3	6	498153	498158	0 %	0 %	50 %	50 %	78184057
10162	NC_007513	GCT	2	6	498166	498171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184057
10163	NC_007513	TTG	2	6	498229	498234	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10164	NC_007513	CTG	2	6	498271	498276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10165	NC_007513	GCA	2	6	498312	498317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184058
10166	NC_007513	TGA	2	6	498330	498335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78184058
10167	NC_007513	AAG	2	6	498336	498341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78184058
10168	NC_007513	GCC	2	6	498356	498361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78184058
10169	NC_007513	GTG	2	6	498368	498373	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184058
10170	NC_007513	CTTCCC	2	12	498391	498402	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78184058
10171	NC_007513	CCT	2	6	498428	498433	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78184058
10172	NC_007513	GCA	3	9	498499	498507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184058
10173	NC_007513	ATT	2	6	498552	498557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78184058
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10175	NC_007513	GTTC	2	8	498662	498669	0 %	50 %	25 %	25 %	78184058
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10181	NC_007513	CGG	2	6	498898	498903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78184058
10182	NC_007513	CGT	2	6	498962	498967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184058
10183	NC_007513	AGC	2	6	498975	498980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184058
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10185	NC_007513	GTTT	2	8	499062	499069	0 %	75 %	25 %	0 %	78184058
10186	NC_007513	TC	3	6	499182	499187	0 %	50 %	0 %	50 %	78184058
10187	NC_007513	GTG	2	6	499192	499197	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184058
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10190	NC_007513	CTTG	2	8	499317	499324	0 %	50 %	25 %	25 %	78184058
10191	NC_007513	TTG	2	6	499467	499472	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78184058
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10194	NC_007513	GTC	2	6	499543	499548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184059
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10196	NC_007513	CTG	2	6	499578	499583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184059
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10200	NC_007513	TTC	2	6	499858	499863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78184059
10201	NC_007513	GCTGAG	2	12	499879	499890	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	78184059
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10204	NC_007513	TTG	2	6	500050	500055	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78184060
10205	NC_007513	CT	3	6	500188	500193	0 %	50 %	0 %	50 %	78184060
10206	NC_007513	ATC	2	6	500244	500249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78184060
10207	NC_007513	TTC	2	6	500367	500372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78184060
10208	NC_007513	ATC	2	6	500415	500420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78184060
10209	NC_007513	CTCTCC	2	12	500439	500450	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78184060
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10211	NC_007513	CG	3	6	500681	500686	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10212	NC_007513	CT	3	6	500710	500715	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10213	NC_007513	G	6	6	500736	500741	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10214	NC_007513	TTCAG	2	10	500760	500769	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
10215	NC_007513	CCCA	2	8	500793	500800	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
10216	NC_007513	CCG	2	6	500819	500824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78184061
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10218	NC_007513	GCT	2	6	500836	500841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184061
10219	NC_007513	CGC	2	6	500859	500864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78184061
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10221	NC_007513	CGCC	2	8	500919	500926	0 %	0 %	25 %	75 %	78184061
10222	NC_007513	CCGAAG	2	12	500930	500941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184061
10223	NC_007513	CTG	3	9	500959	500967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184061
10224	NC_007513	TGG	2	6	501005	501010	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184061
10225	NC_007513	TTCC	2	8	501096	501103	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10226	NC_007513	GGAG	2	8	501153	501160	25 %	0 %	75 %	0 %	78184062
10227	NC_007513	GGT	2	6	501204	501209	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184062
10228	NC_007513	CCTT	2	8	501218	501225	0 %	50 %	0 %	50 %	78184062
10229	NC_007513	CT	3	6	501233	501238	0 %	50 %	0 %	50 %	78184062
10230	NC_007513	TCCG	2	8	501242	501249	0 %	25 %	25 %	50 %	78184062
10231	NC_007513	CCA	2	6	501287	501292	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78184062
10232	NC_007513	TCG	2	6	501392	501397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184062
10233	NC_007513	AGG	2	6	501407	501412	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78184062
10234	NC_007513	GCTC	2	8	501435	501442	0 %	25 %	25 %	50 %	78184062
10235	NC_007513	GAAG	2	8	501468	501475	50 %	0 %	50 %	0 %	78184062
10236	NC_007513	AG	3	6	501474	501479	50 %	0 %	50 %	0 %	78184062
10237	NC_007513	CGC	2	6	501481	501486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78184062
10238	NC_007513	CTCAA	2	10	501518	501527	40 %	20 %	0 %	40 %	78184062
10239	NC_007513	TCAGC	2	10	501540	501549	20 %	20 %	20 %	40 %	78184062
10240	NC_007513	GCTG	2	8	501570	501577	0 %	25 %	50 %	25 %	78184062
10241	NC_007513	TGA	2	6	501580	501585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78184062
10242	NC_007513	CGT	2	6	501687	501692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184063
10243	NC_007513	TGC	3	9	501779	501787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184063
10244	NC_007513	GCA	2	6	501831	501836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184063
10245	NC_007513	CAAG	2	8	501887	501894	50 %	0 %	25 %	25 %	78184063
10246	NC_007513	TGCCGA	3	18	501902	501919	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	78184063
10247	NC_007513	CTGA	2	8	501981	501988	25 %	25 %	25 %	25 %	78184063
10248	NC_007513	CGCAG	2	10	502010	502019	20 %	0 %	40 %	40 %	78184063
10249	NC_007513	TTGA	2	8	502026	502033	25 %	50 %	25 %	0 %	78184063
10250	NC_007513	CCA	2	6	502036	502041	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78184063
10251	NC_007513	AGC	2	6	502161	502166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184064
10252	NC_007513	CAGCT	2	10	502183	502192	20 %	20 %	20 %	40 %	78184064
10253	NC_007513	TC	3	6	502283	502288	0 %	50 %	0 %	50 %	78184064
10254	NC_007513	TGA	2	6	502344	502349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78184064
10255	NC_007513	CAG	2	6	502376	502381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184064
10256	NC_007513	GGC	2	6	502435	502440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78184064
10257	NC_007513	CTGG	2	8	502562	502569	0 %	25 %	50 %	25 %	78184064
10258	NC_007513	CAC	2	6	502616	502621	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10259	NC_007513	CGA	2	6	502687	502692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184065
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10262	NC_007513	GAC	2	6	502874	502879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184065
10263	NC_007513	GCA	2	6	502926	502931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184065
10264	NC_007513	CGAT	2	8	503013	503020	25 %	25 %	25 %	25 %	78184065
10265	NC_007513	ATCGA	2	10	503057	503066	40 %	20 %	20 %	20 %	78184065
10266	NC_007513	CAT	2	6	503077	503082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78184065
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10273	NC_007513	GGC	2	6	503470	503475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78184065
10274	NC_007513	TGC	3	9	503496	503504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184065
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10279	NC_007513	A	7	7	503798	503804	100 %	0 %	0 %	0 %	78184065
10280	NC_007513	GCC	2	6	503849	503854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78184065
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10287	NC_007513	AGC	2	6	504194	504199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10288	NC_007513	TCG	2	6	504299	504304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184066
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10300	NC_007513	CAC	2	6	504827	504832	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78184066
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10302	NC_007513	TGC	2	6	504943	504948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184066
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10308	NC_007513	T	6	6	505204	505209	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10309	NC_007513	TGA	2	6	505217	505222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10310	NC_007513	TCA	2	6	505233	505238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78184067
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10312	NC_007513	GATG	2	8	505351	505358	25 %	25 %	50 %	0 %	78184067
10313	NC_007513	GCA	2	6	505425	505430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184067
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10315	NC_007513	GTC	2	6	505544	505549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184067
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10320	NC_007513	GCGTT	2	10	505807	505816	0 %	40 %	40 %	20 %	78184067
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10324	NC_007513	CGG	2	6	505972	505977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78184068
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10347	NC_007513	TGG	2	6	506981	506986	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184070
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10351	NC_007513	GCG	2	6	507253	507258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78184070
10352	NC_007513	GTG	2	6	507298	507303	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184070
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10354	NC_007513	TGT	2	6	507386	507391	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78184070
10355	NC_007513	GTC	2	6	507417	507422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184070
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10357	NC_007513	GTTG	2	8	507462	507469	0 %	50 %	50 %	0 %	78184070
10358	NC_007513	CAAGGG	2	12	507545	507556	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	78184071
10359	NC_007513	GCCCCT	2	12	507580	507591	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	78184071
10360	NC_007513	GCT	2	6	507613	507618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184071
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10487	NC_007513	AGCGGC	2	12	513868	513879	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	78184077
10488	NC_007513	CGC	2	6	513889	513894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78184077
10489	NC_007513	T	6	6	513949	513954	0 %	100 %	0 %	0 %	78184077
10490	NC_007513	CGA	2	6	513970	513975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184077
10491	NC_007513	TGT	2	6	513993	513998	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78184077
10492	NC_007513	CCAA	2	8	514039	514046	50 %	0 %	0 %	50 %	78184077
10493	NC_007513	GCG	2	6	514055	514060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78184077
10494	NC_007513	GA	3	6	514148	514153	50 %	0 %	50 %	0 %	78184077
10495	NC_007513	GTC	2	6	514200	514205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184077
10496	NC_007513	GCTG	2	8	514228	514235	0 %	25 %	50 %	25 %	78184077
10497	NC_007513	TACG	2	8	514255	514262	25 %	25 %	25 %	25 %	78184077
10498	NC_007513	GCG	2	6	514277	514282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78184077
10499	NC_007513	TGG	2	6	514290	514295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184077
10500	NC_007513	CGCCGA	2	12	514296	514307	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	78184077

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