MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. CC9902 chromosome

Total Repeats: 44761

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_007513	CGA	2	6	318272	318277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78183889
6502	NC_007513	GCA	3	9	318383	318391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78183889
6503	NC_007513	CAA	2	6	318414	318419	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78183889
6504	NC_007513	CCCAT	2	10	318494	318503	20 %	20 %	0 %	60 %	78183889
6505	NC_007513	GGC	2	6	318564	318569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78183889
6506	NC_007513	CTG	2	6	318602	318607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183889
6507	NC_007513	ACA	2	6	318629	318634	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78183889
6508	NC_007513	CAA	2	6	318681	318686	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78183889
6509	NC_007513	CGG	2	6	318696	318701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78183889
6510	NC_007513	CCG	2	6	318706	318711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78183889
6511	NC_007513	CGG	2	6	318728	318733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78183889
6512	NC_007513	GGGA	2	8	318777	318784	25 %	0 %	75 %	0 %	78183889
6513	NC_007513	GAT	2	6	318812	318817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78183890
6514	NC_007513	ATC	2	6	318875	318880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78183890
6515	NC_007513	CTT	2	6	318961	318966	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78183890
6516	NC_007513	CAG	2	6	319019	319024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78183890
6517	NC_007513	TTG	2	6	319080	319085	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78183890
6518	NC_007513	CCT	2	6	319144	319149	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78183890
6519	NC_007513	GAA	2	6	319162	319167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78183890
6520	NC_007513	CAC	2	6	319211	319216	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78183890
6521	NC_007513	CAT	2	6	319346	319351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78183890
6522	NC_007513	CAC	2	6	319361	319366	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78183890
6523	NC_007513	AAC	2	6	319389	319394	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78183890
6524	NC_007513	ACG	2	6	319425	319430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78183890
6525	NC_007513	ATC	2	6	319440	319445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78183890
6526	NC_007513	GGAG	2	8	319511	319518	25 %	0 %	75 %	0 %	78183890
6527	NC_007513	C	6	6	319577	319582	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6528	NC_007513	TTC	2	6	319605	319610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6529	NC_007513	TTG	2	6	319718	319723	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78183891
6530	NC_007513	GCC	4	12	319748	319759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78183891
6531	NC_007513	TGC	2	6	319761	319766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183891
6532	NC_007513	CCAGA	2	10	319768	319777	40 %	0 %	20 %	40 %	78183891
6533	NC_007513	G	6	6	319914	319919	0 %	0 %	100 %	0 %	78183891
6534	NC_007513	CTT	2	6	319945	319950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78183891
6535	NC_007513	GGC	2	6	319971	319976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78183891
6536	NC_007513	GCA	2	6	320016	320021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78183891
6537	NC_007513	GGA	2	6	320103	320108	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78183891
6538	NC_007513	CGG	2	6	320126	320131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78183891
6539	NC_007513	CTC	3	9	320257	320265	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78183891
6540	NC_007513	TGG	2	6	320321	320326	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78183891
6541	NC_007513	GCCA	2	8	320359	320366	25 %	0 %	25 %	50 %	78183891
6542	NC_007513	CTG	2	6	320371	320376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183891
6543	NC_007513	CGG	2	6	320436	320441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78183891
6544	NC_007513	GGA	2	6	320712	320717	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78183891
6545	NC_007513	GGT	2	6	320748	320753	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78183891
6546	NC_007513	C	6	6	320778	320783	0 %	0 %	0 %	100 %	78183891
6547	NC_007513	AGG	2	6	320814	320819	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78183891
6548	NC_007513	CGGT	2	8	320831	320838	0 %	25 %	50 %	25 %	78183891
6549	NC_007513	AAG	2	6	320858	320863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78183891
6550	NC_007513	CGGCT	2	10	320864	320873	0 %	20 %	40 %	40 %	78183891
6551	NC_007513	GTC	2	6	320890	320895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183891
6552	NC_007513	CTTG	2	8	320943	320950	0 %	50 %	25 %	25 %	78183891
6553	NC_007513	GCC	2	6	320953	320958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78183891
6554	NC_007513	TGA	2	6	320991	320996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78183891
6555	NC_007513	TGC	2	6	321043	321048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183892
6556	NC_007513	CAT	2	6	321151	321156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78183892
6557	NC_007513	TTG	2	6	321158	321163	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78183892
6558	NC_007513	TTC	2	6	321170	321175	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78183892
6559	NC_007513	GTT	2	6	321229	321234	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78183892
6560	NC_007513	TCC	2	6	321279	321284	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78183892
6561	NC_007513	AAT	2	6	321302	321307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	78183892
6562	NC_007513	CGGT	2	8	321333	321340	0 %	25 %	50 %	25 %	78183892
6563	NC_007513	TCG	2	6	321366	321371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183892
6564	NC_007513	CAT	2	6	321400	321405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78183892
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6567	NC_007513	GC	3	6	321546	321551	0 %	0 %	50 %	50 %	78183892
6568	NC_007513	CGT	2	6	321640	321645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183893
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6573	NC_007513	TGG	2	6	321896	321901	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78183893
6574	NC_007513	TGG	2	6	321921	321926	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78183893
6575	NC_007513	TGC	2	6	321939	321944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183893
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6582	NC_007513	GTC	2	6	322504	322509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183893
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6589	NC_007513	TGG	2	6	322872	322877	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78183893
6590	NC_007513	GCG	2	6	322937	322942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78183893
6591	NC_007513	GGTT	2	8	322949	322956	0 %	50 %	50 %	0 %	78183893
6592	NC_007513	GGT	2	6	322964	322969	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78183893
6593	NC_007513	GCT	2	6	322988	322993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183893
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6602	NC_007513	TTGG	2	8	323363	323370	0 %	50 %	50 %	0 %	78183893
6603	NC_007513	GTG	2	6	323460	323465	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78183893
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6607	NC_007513	CCG	2	6	323685	323690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78183893
6608	NC_007513	T	6	6	323778	323783	0 %	100 %	0 %	0 %	78183893
6609	NC_007513	TGC	2	6	323832	323837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183893
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6612	NC_007513	CGT	2	6	324382	324387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183894
6613	NC_007513	ATCGA	2	10	324404	324413	40 %	20 %	20 %	20 %	78183894
6614	NC_007513	GCGTC	2	10	324435	324444	0 %	20 %	40 %	40 %	78183894
6615	NC_007513	AGTG	2	8	324557	324564	25 %	25 %	50 %	0 %	78183894
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