MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. CC9902 chromosome

Total Repeats: 44761

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_007513	CAG	2	6	264983	264988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78183836
5502	NC_007513	CGG	2	6	264999	265004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78183836
5503	NC_007513	CCG	2	6	265076	265081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78183836
5504	NC_007513	TGA	2	6	265152	265157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78183836
5505	NC_007513	GTT	2	6	265189	265194	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78183836
5506	NC_007513	GGT	2	6	265232	265237	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78183836
5507	NC_007513	TGG	2	6	265323	265328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78183836
5508	NC_007513	GTA	2	6	265348	265353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78183836
5509	NC_007513	TCA	2	6	265364	265369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78183836
5510	NC_007513	CGC	2	6	265509	265514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78183836
5511	NC_007513	CAA	2	6	265521	265526	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78183836
5512	NC_007513	CGG	2	6	265533	265538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78183836
5513	NC_007513	ACC	2	6	265567	265572	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78183836
5514	NC_007513	GTC	2	6	265780	265785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183836
5515	NC_007513	TTC	2	6	265825	265830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78183836
5516	NC_007513	CTT	2	6	265920	265925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78183836
5517	NC_007513	GCT	2	6	265987	265992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183836
5518	NC_007513	GCGA	2	8	266054	266061	25 %	0 %	50 %	25 %	78183836
5519	NC_007513	GCG	2	6	266063	266068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78183836
5520	NC_007513	TCC	2	6	266086	266091	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78183836
5521	NC_007513	GAT	2	6	266095	266100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78183836
5522	NC_007513	CAC	2	6	266101	266106	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78183836
5523	NC_007513	GGGA	2	8	266120	266127	25 %	0 %	75 %	0 %	78183836
5524	NC_007513	GTT	2	6	266134	266139	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78183836
5525	NC_007513	CTG	2	6	266189	266194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183837
5526	NC_007513	ACGA	2	8	266277	266284	50 %	0 %	25 %	25 %	78183837
5527	NC_007513	TCGA	2	8	266338	266345	25 %	25 %	25 %	25 %	78183837
5528	NC_007513	TCG	2	6	266413	266418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183837
5529	NC_007513	GCC	2	6	266449	266454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78183837
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5531	NC_007513	CCA	2	6	266547	266552	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78183837
5532	NC_007513	TCC	2	6	266635	266640	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78183837
5533	NC_007513	GCT	2	6	266721	266726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183837
5534	NC_007513	ATC	2	6	266872	266877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78183837
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5536	NC_007513	GC	3	6	266948	266953	0 %	0 %	50 %	50 %	78183837
5537	NC_007513	GCC	2	6	266967	266972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78183837
5538	NC_007513	CCA	2	6	267079	267084	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78183837
5539	NC_007513	CGA	2	6	267116	267121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78183837
5540	NC_007513	CAT	2	6	267212	267217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5541	NC_007513	GCG	2	6	267261	267266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5542	NC_007513	GGC	2	6	267334	267339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5543	NC_007513	TGG	2	6	267352	267357	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5544	NC_007513	CGG	3	9	267405	267413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5545	NC_007513	CCA	2	6	267445	267450	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5546	NC_007513	TTC	2	6	267506	267511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5547	NC_007513	T	6	6	267542	267547	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5548	NC_007513	GAG	2	6	267683	267688	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5549	NC_007513	GCC	2	6	267692	267697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5550	NC_007513	CGTG	2	8	267799	267806	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5551	NC_007513	TTG	2	6	267946	267951	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5552	NC_007513	CAG	2	6	268086	268091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5553	NC_007513	GGC	2	6	268162	268167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5554	NC_007513	CGTCAG	2	12	268237	268248	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5555	NC_007513	GTT	2	6	268299	268304	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78183838
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5557	NC_007513	T	7	7	268376	268382	0 %	100 %	0 %	0 %	78183838
5558	NC_007513	GTT	2	6	268417	268422	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78183838
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5560	NC_007513	G	6	6	268464	268469	0 %	0 %	100 %	0 %	78183838
5561	NC_007513	GAGCG	2	10	268557	268566	20 %	0 %	60 %	20 %	78183838
5562	NC_007513	GTC	2	6	268684	268689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183838
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5567	NC_007513	CTC	2	6	269300	269305	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78183839
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5569	NC_007513	CCG	2	6	269348	269353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78183839
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5583	NC_007513	CTG	2	6	269930	269935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183839
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5589	NC_007513	GCG	3	9	270232	270240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78183839
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5595	NC_007513	GCG	2	6	270515	270520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78183840
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5599	NC_007513	TGC	2	6	270614	270619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183840
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5602	NC_007513	GC	3	6	270756	270761	0 %	0 %	50 %	50 %	78183840
5603	NC_007513	ACC	2	6	270974	270979	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78183840
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5605	NC_007513	TCG	2	6	270995	271000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183840
5606	NC_007513	CGG	2	6	271048	271053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78183840
5607	NC_007513	GTGAG	2	10	271066	271075	20 %	20 %	60 %	0 %	78183840
5608	NC_007513	GCG	2	6	271091	271096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78183840
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5622	NC_007513	CAAGG	2	10	271997	272006	40 %	0 %	40 %	20 %	78183841
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5624	NC_007513	ATCC	2	8	272106	272113	25 %	25 %	0 %	50 %	78183841
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5863	NC_007513	G	6	6	284479	284484	0 %	0 %	100 %	0 %	78183853
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5865	NC_007513	C	7	7	284722	284728	0 %	0 %	0 %	100 %	78183853
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