MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella sonnei Ss046 plasmid pSS_046

Total Repeats: 4514

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_007385	AGG	2	6	192665	192670	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	74315057
4002	NC_007385	ATT	2	6	192714	192719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	74315057
4003	NC_007385	TG	3	6	192785	192790	0 %	50 %	50 %	0 %	74315057
4004	NC_007385	GCC	2	6	192854	192859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74315056
4005	NC_007385	GGCA	2	8	192930	192937	25 %	0 %	50 %	25 %	74315056
4006	NC_007385	ATC	2	6	192960	192965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74315056
4007	NC_007385	A	6	6	192992	192997	100 %	0 %	0 %	0 %	74315056
4008	NC_007385	CCG	2	6	193186	193191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4009	NC_007385	GCA	2	6	193196	193201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4010	NC_007385	TTG	2	6	193274	193279	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_007385	T	6	6	193349	193354	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_007385	TTC	2	6	193365	193370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4013	NC_007385	ATTTTT	2	12	193371	193382	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4014	NC_007385	ATAA	2	8	193392	193399	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_007385	GAA	2	6	193531	193536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	74315058
4016	NC_007385	A	6	6	193535	193540	100 %	0 %	0 %	0 %	74315058
4017	NC_007385	AGC	2	6	193579	193584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74315058
4018	NC_007385	CAC	2	6	193638	193643	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	74315058
4019	NC_007385	GATTT	2	10	193745	193754	20 %	60 %	20 %	0 %	74315058
4020	NC_007385	AG	3	6	193792	193797	50 %	0 %	50 %	0 %	74315058
4021	NC_007385	TAT	2	6	193805	193810	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	74315058
4022	NC_007385	AAT	2	6	193823	193828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	74315058
4023	NC_007385	CCA	2	6	193895	193900	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	74315058
4024	NC_007385	TAC	2	6	193922	193927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74315058
4025	NC_007385	ATA	2	6	193928	193933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	74315058
4026	NC_007385	ACT	2	6	193969	193974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74315058
4027	NC_007385	TAA	2	6	193996	194001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	74315058
4028	NC_007385	TGA	2	6	194023	194028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74315058
4029	NC_007385	TAAA	2	8	194064	194071	75 %	25 %	0 %	0 %	74315058
4030	NC_007385	ATT	2	6	194075	194080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	74315058
4031	NC_007385	AAC	2	6	194143	194148	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	74315058
4032	NC_007385	GGC	2	6	194189	194194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74315058
4033	NC_007385	CAG	2	6	194247	194252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74315058
4034	NC_007385	ATT	2	6	194279	194284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	74315058
4035	NC_007385	TGA	2	6	194320	194325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74315058
4036	NC_007385	CAA	2	6	194413	194418	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	74315058
4037	NC_007385	TTG	2	6	194532	194537	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_007385	ATG	2	6	194572	194577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74315059
4039	NC_007385	GAAA	2	8	194666	194673	75 %	0 %	25 %	0 %	74315059
4040	NC_007385	ACG	2	6	194677	194682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74315059
4041	NC_007385	TAA	2	6	194697	194702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	74315059
4042	NC_007385	TGA	2	6	194712	194717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74315059
4043	NC_007385	GTT	2	6	194763	194768	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	74315059
4044	NC_007385	TATT	2	8	194825	194832	25 %	75 %	0 %	0 %	74315059
4045	NC_007385	ATAAAC	2	12	194855	194866	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	74315059
4046	NC_007385	ATA	2	6	194914	194919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	74315059
4047	NC_007385	TTA	2	6	194933	194938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	74315059
4048	NC_007385	AGA	3	9	194970	194978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	74315059
4049	NC_007385	T	7	7	195027	195033	0 %	100 %	0 %	0 %	74315059
4050	NC_007385	TA	3	6	195146	195151	50 %	50 %	0 %	0 %	74315059
4051	NC_007385	TAA	2	6	195155	195160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	74315059
4052	NC_007385	CAT	2	6	195182	195187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74315059
4053	NC_007385	TAT	2	6	195267	195272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	74315059
4054	NC_007385	TAA	2	6	195276	195281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	74315059
4055	NC_007385	T	6	6	195333	195338	0 %	100 %	0 %	0 %	74315059
4056	NC_007385	TAG	2	6	195356	195361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74315059
4057	NC_007385	TTA	2	6	195387	195392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	74315059
4058	NC_007385	ATC	2	6	195422	195427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74315059
4059	NC_007385	GAT	2	6	195432	195437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74315059
4060	NC_007385	CGT	2	6	195448	195453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74315059
4061	NC_007385	A	7	7	195496	195502	100 %	0 %	0 %	0 %	74315059
4062	NC_007385	AAC	2	6	195509	195514	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	74315059
4063	NC_007385	TGAT	2	8	195596	195603	25 %	50 %	25 %	0 %	74315059
4064	NC_007385	ATT	2	6	195604	195609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	74315059
4065	NC_007385	CAATAT	2	12	195627	195638	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	74315059
4066	NC_007385	ATG	2	6	195725	195730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74315059
4067	NC_007385	AAT	2	6	195732	195737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	74315059
4068	NC_007385	CA	3	6	195749	195754	50 %	0 %	0 %	50 %	74315059
4069	NC_007385	GA	3	6	195773	195778	50 %	0 %	50 %	0 %	74315059
4070	NC_007385	A	7	7	195841	195847	100 %	0 %	0 %	0 %	74315059
4071	NC_007385	A	7	7	195876	195882	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4072	NC_007385	TGATA	2	10	195895	195904	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4073	NC_007385	CAG	2	6	195984	195989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74315060
4074	NC_007385	T	6	6	195994	195999	0 %	100 %	0 %	0 %	74315060
4075	NC_007385	TTAAA	2	10	196066	196075	60 %	40 %	0 %	0 %	74315060
4076	NC_007385	GTT	2	6	196080	196085	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	74315060
4077	NC_007385	TGA	2	6	196127	196132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74315060
4078	NC_007385	TTG	2	6	196279	196284	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	74315060
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4080	NC_007385	TGC	2	6	196373	196378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74315060
4081	NC_007385	ATC	2	6	196399	196404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74315060
4082	NC_007385	GTC	3	9	196549	196557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74315060
4083	NC_007385	TGC	2	6	196577	196582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74315060
4084	NC_007385	CAG	2	6	196600	196605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74315060
4085	NC_007385	TGA	2	6	196619	196624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74315060
4086	NC_007385	TA	3	6	196627	196632	50 %	50 %	0 %	0 %	74315060
4087	NC_007385	TA	3	6	196668	196673	50 %	50 %	0 %	0 %	74315060
4088	NC_007385	AT	3	6	196693	196698	50 %	50 %	0 %	0 %	74315060
4089	NC_007385	ATA	2	6	196729	196734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	74315060
4090	NC_007385	TA	4	8	196733	196740	50 %	50 %	0 %	0 %	74315060
4091	NC_007385	AAC	2	6	196760	196765	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	74315060
4092	NC_007385	ATG	2	6	196792	196797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74315060
4093	NC_007385	TTAAT	2	10	196801	196810	40 %	60 %	0 %	0 %	74315060
4094	NC_007385	AG	3	6	196842	196847	50 %	0 %	50 %	0 %	74315060
4095	NC_007385	AG	3	6	196932	196937	50 %	0 %	50 %	0 %	74315060
4096	NC_007385	AATA	2	8	197000	197007	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4097	NC_007385	TTA	2	6	197024	197029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4098	NC_007385	TATT	2	8	197051	197058	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4099	NC_007385	TGAT	2	8	197087	197094	25 %	50 %	25 %	0 %	74315061
4100	NC_007385	GGT	2	6	197098	197103	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74315061
4101	NC_007385	CA	3	6	197151	197156	50 %	0 %	0 %	50 %	74315061
4102	NC_007385	TAC	2	6	197169	197174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74315061
4103	NC_007385	TAT	2	6	197181	197186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	74315061
4104	NC_007385	ATA	2	6	197270	197275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	74315061
4105	NC_007385	ATT	2	6	197292	197297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	74315061
4106	NC_007385	AAG	2	6	197301	197306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	74315061
4107	NC_007385	T	7	7	197327	197333	0 %	100 %	0 %	0 %	74315061
4108	NC_007385	TTTG	2	8	197419	197426	0 %	75 %	25 %	0 %	74315061
4109	NC_007385	TA	4	8	197483	197490	50 %	50 %	0 %	0 %	74315061
4110	NC_007385	CAA	2	6	197501	197506	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	74315061
4111	NC_007385	TA	4	8	197508	197515	50 %	50 %	0 %	0 %	74315061
4112	NC_007385	ATTT	2	8	197525	197532	25 %	75 %	0 %	0 %	74315061
4113	NC_007385	TAT	2	6	197557	197562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	74315061
4114	NC_007385	TCA	2	6	197608	197613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74315061
4115	NC_007385	T	6	6	197673	197678	0 %	100 %	0 %	0 %	74315061
4116	NC_007385	TGT	2	6	197715	197720	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	74315061
4117	NC_007385	TA	3	6	197778	197783	50 %	50 %	0 %	0 %	74315061
4118	NC_007385	GGT	2	6	197787	197792	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74315061
4119	NC_007385	TAA	2	6	197813	197818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	74315061
4120	NC_007385	TTAT	2	8	197831	197838	25 %	75 %	0 %	0 %	74315061
4121	NC_007385	TTA	2	6	197862	197867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	74315061
4122	NC_007385	AT	4	8	197910	197917	50 %	50 %	0 %	0 %	74315061
4123	NC_007385	TTA	2	6	197929	197934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	74315061
4124	NC_007385	TAT	2	6	197947	197952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	74315061
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