MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella sonnei Ss046 plasmid pSS_046

Total Repeats: 4514

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_007385	AAG	2	6	168369	168374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	74315027
3502	NC_007385	G	6	6	168402	168407	0 %	0 %	100 %	0 %	74315027
3503	NC_007385	GAA	2	6	168435	168440	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	74315027
3504	NC_007385	GTG	2	6	168486	168491	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74315027
3505	NC_007385	GCA	2	6	168515	168520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74315027
3506	NC_007385	ATC	2	6	168526	168531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74315027
3507	NC_007385	GCA	2	6	168542	168547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74315027
3508	NC_007385	CGT	2	6	168555	168560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74315027
3509	NC_007385	GGA	2	6	168596	168601	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	74315027
3510	NC_007385	GAT	2	6	168615	168620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74315027
3511	NC_007385	TGA	2	6	168624	168629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74315027
3512	NC_007385	GCC	2	6	168659	168664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74315028
3513	NC_007385	TTA	2	6	168687	168692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	74315028
3514	NC_007385	AAT	2	6	168698	168703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	74315028
3515	NC_007385	GT	4	8	168795	168802	0 %	50 %	50 %	0 %	74315028
3516	NC_007385	GCA	2	6	168807	168812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74315028
3517	NC_007385	CGT	2	6	168814	168819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74315028
3518	NC_007385	T	6	6	168886	168891	0 %	100 %	0 %	0 %	74315028
3519	NC_007385	AT	3	6	168899	168904	50 %	50 %	0 %	0 %	74315028
3520	NC_007385	TC	3	6	169125	169130	0 %	50 %	0 %	50 %	74315028
3521	NC_007385	GGT	2	6	169249	169254	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74315028
3522	NC_007385	ATT	2	6	169259	169264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	74315028
3523	NC_007385	CCT	2	6	169267	169272	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	74315028
3524	NC_007385	ATG	2	6	169342	169347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74315028
3525	NC_007385	ATT	2	6	169385	169390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	74315029
3526	NC_007385	GCA	2	6	169421	169426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74315029
3527	NC_007385	GGCC	2	8	169440	169447	0 %	0 %	50 %	50 %	74315029
3528	NC_007385	AAC	2	6	169457	169462	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	74315029
3529	NC_007385	GACCT	2	10	169582	169591	20 %	20 %	20 %	40 %	74315029
3530	NC_007385	ATG	2	6	169615	169620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74315029
3531	NC_007385	G	7	7	169630	169636	0 %	0 %	100 %	0 %	74315029
3532	NC_007385	TGA	2	6	169715	169720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74315029
3533	NC_007385	CGGA	2	8	169721	169728	25 %	0 %	50 %	25 %	74315029
3534	NC_007385	AC	3	6	169809	169814	50 %	0 %	0 %	50 %	74315029
3535	NC_007385	GGT	2	6	169821	169826	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74315029
3536	NC_007385	GCA	2	6	169839	169844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74315029
3537	NC_007385	GGC	2	6	170109	170114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74315029
3538	NC_007385	AAC	2	6	170228	170233	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	74315029
3539	NC_007385	CGCA	2	8	170245	170252	25 %	0 %	25 %	50 %	74315029
3540	NC_007385	GCA	2	6	170289	170294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74315029
3541	NC_007385	CTG	2	6	170356	170361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74315029
3542	NC_007385	GCC	2	6	170382	170387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74315029
3543	NC_007385	AGC	2	6	170444	170449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74315029
3544	NC_007385	CAT	2	6	170535	170540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74315029
3545	NC_007385	CCGT	2	8	170628	170635	0 %	25 %	25 %	50 %	74315029
3546	NC_007385	ATG	2	6	170701	170706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74315029
3547	NC_007385	GCT	2	6	170740	170745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74315029
3548	NC_007385	TCGC	2	8	170751	170758	0 %	25 %	25 %	50 %	74315029
3549	NC_007385	CGT	2	6	170809	170814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74315029
3550	NC_007385	TCG	2	6	170858	170863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74315029
3551	NC_007385	CTG	2	6	170902	170907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74315029
3552	NC_007385	G	6	6	171024	171029	0 %	0 %	100 %	0 %	74315029
3553	NC_007385	CCA	2	6	171044	171049	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	74315029
3554	NC_007385	TCA	2	6	171050	171055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74315029
3555	NC_007385	AG	3	6	171126	171131	50 %	0 %	50 %	0 %	74315029
3556	NC_007385	CTGG	2	8	171252	171259	0 %	25 %	50 %	25 %	74315029
3557	NC_007385	GGT	2	6	171414	171419	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74315029
3558	NC_007385	TTC	2	6	171426	171431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	74315029
3559	NC_007385	CAG	2	6	171438	171443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74315029
3560	NC_007385	CCGG	2	8	171456	171463	0 %	0 %	50 %	50 %	74315029
3561	NC_007385	A	6	6	171464	171469	100 %	0 %	0 %	0 %	74315029
3562	NC_007385	CGG	2	6	171531	171536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74315029
3563	NC_007385	GTT	2	6	171580	171585	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	74315029
3564	NC_007385	CCTG	2	8	171612	171619	0 %	25 %	25 %	50 %	74315029
3565	NC_007385	CA	3	6	171717	171722	50 %	0 %	0 %	50 %	74315029
3566	NC_007385	CCT	2	6	171833	171838	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	74315029
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3568	NC_007385	CAG	2	6	171934	171939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74315029
3569	NC_007385	TGG	2	6	171992	171997	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74315029
3570	NC_007385	CTG	2	6	172000	172005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74315029
3571	NC_007385	TGC	2	6	172023	172028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74315029
3572	NC_007385	ATGTGG	2	12	172097	172108	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	74315029
3573	NC_007385	CTG	2	6	172129	172134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74315029
3574	NC_007385	CGT	2	6	172145	172150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74315029
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3579	NC_007385	GC	3	6	172260	172265	0 %	0 %	50 %	50 %	74315029
3580	NC_007385	GGT	2	6	172305	172310	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74315029
3581	NC_007385	CA	3	6	172338	172343	50 %	0 %	0 %	50 %	74315029
3582	NC_007385	TGC	2	6	172373	172378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74315029
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3584	NC_007385	GCA	2	6	172497	172502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74315029
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3586	NC_007385	CGGT	2	8	172604	172611	0 %	25 %	50 %	25 %	74315029
3587	NC_007385	CAG	2	6	172684	172689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74315029
3588	NC_007385	TGC	2	6	172698	172703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74315029
3589	NC_007385	TCA	2	6	172712	172717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74315029
3590	NC_007385	GCA	2	6	172911	172916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74315029
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3592	NC_007385	GCAGGT	2	12	173106	173117	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	74315029
3593	NC_007385	CGT	2	6	173164	173169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74315029
3594	NC_007385	TGCCCT	2	12	173196	173207	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	74315029
3595	NC_007385	CAG	2	6	173473	173478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74315029
3596	NC_007385	TGA	2	6	173615	173620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74315029
3597	NC_007385	TCCT	2	8	173644	173651	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3598	NC_007385	TAA	2	6	173677	173682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	74315030
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3600	NC_007385	AT	3	6	173926	173931	50 %	50 %	0 %	0 %	74315030
3601	NC_007385	A	7	7	173933	173939	100 %	0 %	0 %	0 %	74315030
3602	NC_007385	ACA	2	6	173998	174003	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3603	NC_007385	TTA	2	6	174052	174057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3604	NC_007385	CAGA	2	8	174081	174088	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3605	NC_007385	TGA	2	6	174097	174102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3606	NC_007385	CGG	2	6	174161	174166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74315031
3607	NC_007385	CAT	2	6	174193	174198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74315031
3608	NC_007385	CTG	2	6	174314	174319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74315031
3609	NC_007385	CA	3	6	174382	174387	50 %	0 %	0 %	50 %	74315031
3610	NC_007385	CCA	2	6	174535	174540	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	74315031
3611	NC_007385	GTCTG	2	10	174595	174604	0 %	40 %	40 %	20 %	74315031
3612	NC_007385	TAA	2	6	174703	174708	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	74315031
3613	NC_007385	CGT	2	6	174767	174772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74315031
3614	NC_007385	ATC	2	6	174819	174824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74315031
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3616	NC_007385	A	7	7	174837	174843	100 %	0 %	0 %	0 %	74315031
3617	NC_007385	ATG	2	6	174881	174886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3618	NC_007385	AGC	2	6	174927	174932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3619	NC_007385	CAA	2	6	174979	174984	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3620	NC_007385	ACCGG	2	10	175027	175036	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3621	NC_007385	GGC	2	6	175090	175095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74315032
3622	NC_007385	GCCGT	2	10	175098	175107	0 %	20 %	40 %	40 %	74315032
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