MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella sonnei Ss046 plasmid pSS_046

Total Repeats: 4514

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_007385	GCG	2	6	143457	143462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74315000
3002	NC_007385	GACG	2	8	143607	143614	25 %	0 %	50 %	25 %	74315000
3003	NC_007385	GTA	2	6	143636	143641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74315000
3004	NC_007385	GCA	2	6	143644	143649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74315000
3005	NC_007385	CTGG	2	8	143784	143791	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3006	NC_007385	CCGT	2	8	143821	143828	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3007	NC_007385	CGA	2	6	143857	143862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3008	NC_007385	TCCT	2	8	143893	143900	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3009	NC_007385	TAA	2	6	143926	143931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	74315001
3010	NC_007385	CCG	2	6	144067	144072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74315001
3011	NC_007385	AT	3	6	144175	144180	50 %	50 %	0 %	0 %	74315001
3012	NC_007385	A	7	7	144182	144188	100 %	0 %	0 %	0 %	74315001
3013	NC_007385	ACA	2	6	144247	144252	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3014	NC_007385	TTA	2	6	144301	144306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3015	NC_007385	CAGA	2	8	144330	144337	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3016	NC_007385	TGA	2	6	144346	144351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3017	NC_007385	CGG	2	6	144410	144415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74315002
3018	NC_007385	CAT	2	6	144442	144447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74315002
3019	NC_007385	CTG	2	6	144563	144568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74315002
3020	NC_007385	CA	3	6	144631	144636	50 %	0 %	0 %	50 %	74315002
3021	NC_007385	CCA	2	6	144784	144789	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	74315002
3022	NC_007385	GTCTG	2	10	144844	144853	0 %	40 %	40 %	20 %	74315002
3023	NC_007385	TAA	2	6	144952	144957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	74315002
3024	NC_007385	CGT	2	6	145016	145021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74315002
3025	NC_007385	ATC	2	6	145068	145073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74315002
3026	NC_007385	GCT	2	6	145079	145084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74315002
3027	NC_007385	A	7	7	145086	145092	100 %	0 %	0 %	0 %	74315002
3028	NC_007385	CTG	2	6	145140	145145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3029	NC_007385	CT	3	6	145173	145178	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3030	NC_007385	ACA	2	6	145223	145228	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3031	NC_007385	A	6	6	145300	145305	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3032	NC_007385	GCT	2	6	145447	145452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74315003
3033	NC_007385	ACA	2	6	145480	145485	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	74315003
3034	NC_007385	GTT	2	6	145512	145517	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	74315003
3035	NC_007385	GGC	2	6	145568	145573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74315003
3036	NC_007385	GACG	2	8	145634	145641	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3037	NC_007385	GGA	2	6	145667	145672	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3038	NC_007385	TGC	2	6	145687	145692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3039	NC_007385	GTGA	2	8	145718	145725	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3040	NC_007385	CAG	2	6	145762	145767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3041	NC_007385	GTT	2	6	145771	145776	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3042	NC_007385	ACA	2	6	145786	145791	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3043	NC_007385	GCCAG	2	10	145800	145809	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3044	NC_007385	TCA	2	6	145875	145880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3045	NC_007385	ACA	3	9	145981	145989	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3046	NC_007385	GCCCG	2	10	145999	146008	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
3047	NC_007385	TTAC	2	8	146087	146094	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3048	NC_007385	A	7	7	146123	146129	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3049	NC_007385	GCA	2	6	146132	146137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3050	NC_007385	A	6	6	146139	146144	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3051	NC_007385	T	6	6	146179	146184	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3052	NC_007385	AT	3	6	146211	146216	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_007385	AGC	2	6	146261	146266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3054	NC_007385	T	7	7	146324	146330	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3055	NC_007385	TTA	2	6	146351	146356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3056	NC_007385	TAA	2	6	146357	146362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3057	NC_007385	A	6	6	146361	146366	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3058	NC_007385	TTCAT	2	10	146376	146385	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
3059	NC_007385	CAT	2	6	146460	146465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74315004
3060	NC_007385	ATAA	2	8	146473	146480	75 %	25 %	0 %	0 %	74315004
3061	NC_007385	TGA	2	6	146592	146597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74315004
3062	NC_007385	AAT	2	6	146629	146634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	74315004
3063	NC_007385	GCT	2	6	146703	146708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74315004
3064	NC_007385	TAAC	2	8	146729	146736	50 %	25 %	0 %	25 %	74315004
3065	NC_007385	A	7	7	146760	146766	100 %	0 %	0 %	0 %	74315004
3066	NC_007385	CCT	2	6	146809	146814	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	74315004
3067	NC_007385	ACA	2	6	146835	146840	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	74315004
3068	NC_007385	AAT	2	6	146998	147003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	74315004
3069	NC_007385	AG	3	6	147013	147018	50 %	0 %	50 %	0 %	74315004
3070	NC_007385	T	7	7	147021	147027	0 %	100 %	0 %	0 %	74315004
3071	NC_007385	GAAT	2	8	147075	147082	50 %	25 %	25 %	0 %	74315004
3072	NC_007385	ATC	2	6	147111	147116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74315004
3073	NC_007385	ACA	2	6	147198	147203	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	74315004
3074	NC_007385	ACAA	2	8	147257	147264	75 %	0 %	0 %	25 %	74315004
3075	NC_007385	CAG	2	6	147433	147438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74315004
3076	NC_007385	TGC	2	6	147450	147455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74315004
3077	NC_007385	CCT	2	6	147516	147521	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	74315004
3078	NC_007385	GCTCT	2	10	147565	147574	0 %	40 %	20 %	40 %	74315004
3079	NC_007385	GGA	2	6	147609	147614	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	74315004
3080	NC_007385	GAAT	2	8	147804	147811	50 %	25 %	25 %	0 %	74315004
3081	NC_007385	GCAG	2	8	147882	147889	25 %	0 %	50 %	25 %	74315004
3082	NC_007385	GATGCG	2	12	147970	147981	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	74315004
3083	NC_007385	CAG	2	6	148021	148026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74315004
3084	NC_007385	CTGA	2	8	148039	148046	25 %	25 %	25 %	25 %	74315004
3085	NC_007385	CGG	2	6	148179	148184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3086	NC_007385	CTC	2	6	148190	148195	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3087	NC_007385	CAA	2	6	148205	148210	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3088	NC_007385	GCC	2	6	148217	148222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3089	NC_007385	TA	3	6	148270	148275	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3090	NC_007385	TA	3	6	148281	148286	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3091	NC_007385	GCA	2	6	148437	148442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74315005
3092	NC_007385	CTG	3	9	148529	148537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74315005
3093	NC_007385	ATG	2	6	148575	148580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74315005
3094	NC_007385	CAGGA	2	10	148608	148617	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
3095	NC_007385	GTA	2	6	148627	148632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3096	NC_007385	GCC	2	6	148655	148660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74315006
3097	NC_007385	CAGC	2	8	148689	148696	25 %	0 %	25 %	50 %	74315006
3098	NC_007385	GGCAG	2	10	148702	148711	20 %	0 %	60 %	20 %	74315006
3099	NC_007385	GGAA	2	8	148738	148745	50 %	0 %	50 %	0 %	74315006
3100	NC_007385	CA	3	6	148755	148760	50 %	0 %	0 %	50 %	74315006
3101	NC_007385	TG	3	6	148782	148787	0 %	50 %	50 %	0 %	74315006
3102	NC_007385	ATT	2	6	148848	148853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	74315007
3103	NC_007385	AAT	3	9	148875	148883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	74315007
3104	NC_007385	CAG	2	6	148942	148947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74315007
3105	NC_007385	GTT	2	6	149085	149090	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	74315007
3106	NC_007385	TGC	2	6	149122	149127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74315007
3107	NC_007385	ATA	2	6	149176	149181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	74315007
3108	NC_007385	AG	3	6	149183	149188	50 %	0 %	50 %	0 %	74315007
3109	NC_007385	TGAGT	2	10	149219	149228	20 %	40 %	40 %	0 %	74315007
3110	NC_007385	AAAG	2	8	149271	149278	75 %	0 %	25 %	0 %	74315007
3111	NC_007385	A	6	6	149337	149342	100 %	0 %	0 %	0 %	74315007
3112	NC_007385	CGAC	2	8	149357	149364	25 %	0 %	25 %	50 %	74315007
3113	NC_007385	TTA	2	6	149397	149402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	74315007
3114	NC_007385	TTG	2	6	149427	149432	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3115	NC_007385	GCA	2	6	149542	149547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74315008
3116	NC_007385	CAA	2	6	149563	149568	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	74315008
3117	NC_007385	ACC	2	6	149569	149574	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	74315008
3118	NC_007385	CCG	2	6	149582	149587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74315008
3119	NC_007385	GCA	2	6	149627	149632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74315008
3120	NC_007385	CACG	2	8	149641	149648	25 %	0 %	25 %	50 %	74315008
3121	NC_007385	CCAG	2	8	149654	149661	25 %	0 %	25 %	50 %	74315008
3122	NC_007385	AAT	2	6	149724	149729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3123	NC_007385	CAT	2	6	149733	149738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3124	NC_007385	GAA	2	6	149804	149809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3125	NC_007385	CTGT	2	8	149859	149866	0 %	50 %	25 %	25 %	74315009
3126	NC_007385	CTT	2	6	149945	149950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	74315009
3127	NC_007385	TACT	2	8	149979	149986	25 %	50 %	0 %	25 %	74315009
3128	NC_007385	GGT	2	6	150013	150018	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74315009
3129	NC_007385	A	7	7	150019	150025	100 %	0 %	0 %	0 %	74315009
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3233	NC_007385	T	7	7	155129	155135	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3239	NC_007385	A	7	7	155495	155501	100 %	0 %	0 %	0 %	74315014
3240	NC_007385	ACA	2	6	155560	155565	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3241	NC_007385	TTA	2	6	155614	155619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3242	NC_007385	CAGA	2	8	155643	155650	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3243	NC_007385	TGA	2	6	155659	155664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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