MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella sonnei Ss046 plasmid pSS_046

Total Repeats: 4514

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_007385	CGTC	2	8	118559	118566	0 %	25 %	25 %	50 %	74314968
2502	NC_007385	CGC	2	6	118711	118716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74314968
2503	NC_007385	GGT	2	6	118775	118780	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74314968
2504	NC_007385	TG	3	6	118781	118786	0 %	50 %	50 %	0 %	74314968
2505	NC_007385	GAA	2	6	118825	118830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	74314968
2506	NC_007385	AAC	2	6	118832	118837	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	74314968
2507	NC_007385	GCTG	2	8	118870	118877	0 %	25 %	50 %	25 %	74314968
2508	NC_007385	AAGGT	2	10	118929	118938	40 %	20 %	40 %	0 %	74314968
2509	NC_007385	CTT	2	6	118969	118974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	74314968
2510	NC_007385	TCAA	2	8	119010	119017	50 %	25 %	0 %	25 %	74314968
2511	NC_007385	TGG	2	6	119194	119199	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74314968
2512	NC_007385	TG	3	6	119226	119231	0 %	50 %	50 %	0 %	74314968
2513	NC_007385	TGG	2	6	119295	119300	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74314968
2514	NC_007385	CTGG	2	8	119328	119335	0 %	25 %	50 %	25 %	74314968
2515	NC_007385	GCA	2	6	119368	119373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74314968
2516	NC_007385	GTCA	2	8	119375	119382	25 %	25 %	25 %	25 %	74314968
2517	NC_007385	GAG	2	6	119411	119416	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	74314968
2518	NC_007385	TGT	2	6	119418	119423	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	74314968
2519	NC_007385	CTG	2	6	119443	119448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74314969
2520	NC_007385	CTG	2	6	119491	119496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74314969
2521	NC_007385	A	6	6	119509	119514	100 %	0 %	0 %	0 %	74314969
2522	NC_007385	CAG	2	6	119551	119556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74314969
2523	NC_007385	GGCA	2	8	119566	119573	25 %	0 %	50 %	25 %	74314969
2524	NC_007385	CTGG	2	8	119686	119693	0 %	25 %	50 %	25 %	74314969
2525	NC_007385	CTG	2	6	119728	119733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74314969
2526	NC_007385	CCT	2	6	119737	119742	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	74314969
2527	NC_007385	TGA	2	6	119843	119848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74314969
2528	NC_007385	AG	3	6	119944	119949	50 %	0 %	50 %	0 %	74314969
2529	NC_007385	TTC	2	6	119962	119967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	74314969
2530	NC_007385	CAT	2	6	120000	120005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74314969
2531	NC_007385	CAAA	2	8	120014	120021	75 %	0 %	0 %	25 %	74314969
2532	NC_007385	GCT	2	6	120084	120089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74314969
2533	NC_007385	GA	3	6	120119	120124	50 %	0 %	50 %	0 %	74314969
2534	NC_007385	TGA	3	9	120186	120194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74314969
2535	NC_007385	TGG	2	6	120197	120202	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74314969
2536	NC_007385	TCA	2	6	120309	120314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2537	NC_007385	GTAT	2	8	120454	120461	25 %	50 %	25 %	0 %	74314970
2538	NC_007385	AC	3	6	120471	120476	50 %	0 %	0 %	50 %	74314970
2539	NC_007385	GTGG	2	8	120634	120641	0 %	25 %	75 %	0 %	74314970
2540	NC_007385	CGA	2	6	120656	120661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74314970
2541	NC_007385	CTC	2	6	120684	120689	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	74314970
2542	NC_007385	GCAGAA	2	12	120692	120703	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	74314970
2543	NC_007385	TTA	2	6	120709	120714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	74314970
2544	NC_007385	GAT	2	6	120731	120736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74314970
2545	NC_007385	CCA	2	6	120807	120812	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	74314971
2546	NC_007385	GTT	2	6	120822	120827	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	74314971
2547	NC_007385	GC	3	6	120883	120888	0 %	0 %	50 %	50 %	74314971
2548	NC_007385	TA	3	6	120895	120900	50 %	50 %	0 %	0 %	74314971
2549	NC_007385	A	6	6	120947	120952	100 %	0 %	0 %	0 %	74314971
2550	NC_007385	GAA	2	6	120958	120963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	74314971
2551	NC_007385	ATC	2	6	120988	120993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2552	NC_007385	ATTG	2	8	121027	121034	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2553	NC_007385	T	6	6	121055	121060	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2554	NC_007385	CAC	2	6	121112	121117	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2555	NC_007385	CAT	2	6	121141	121146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2556	NC_007385	CTG	2	6	121240	121245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74314972
2557	NC_007385	CGC	2	6	121325	121330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74314972
2558	NC_007385	TCG	2	6	121407	121412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74314972
2559	NC_007385	TCA	2	6	121417	121422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74314972
2560	NC_007385	TCT	2	6	121431	121436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	74314972
2561	NC_007385	TGT	2	6	121453	121458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	74314972
2562	NC_007385	GGC	2	6	121498	121503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74314972
2563	NC_007385	GCT	2	6	121516	121521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74314972
2564	NC_007385	CCAG	2	8	121525	121532	25 %	0 %	25 %	50 %	74314972
2565	NC_007385	CTG	2	6	121550	121555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74314972
2566	NC_007385	TCA	2	6	121718	121723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74314973
2567	NC_007385	AGA	2	6	121737	121742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	74314973
2568	NC_007385	T	6	6	121747	121752	0 %	100 %	0 %	0 %	74314973
2569	NC_007385	CTT	3	9	121839	121847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	74314973
2570	NC_007385	A	7	7	121852	121858	100 %	0 %	0 %	0 %	74314973
2571	NC_007385	GGA	2	6	121887	121892	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	74314973
2572	NC_007385	CTT	2	6	121898	121903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	74314973
2573	NC_007385	GCC	2	6	122024	122029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2574	NC_007385	CTTA	2	8	122068	122075	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2575	NC_007385	TAA	2	6	122076	122081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2576	NC_007385	TTCAT	2	10	122158	122167	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
2577	NC_007385	TCAA	2	8	122188	122195	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2578	NC_007385	CGC	2	6	122385	122390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2579	NC_007385	GCAG	2	8	122409	122416	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2580	NC_007385	CCA	2	6	122441	122446	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2581	NC_007385	CAT	2	6	122456	122461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2582	NC_007385	CAT	2	6	122478	122483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2583	NC_007385	TCGT	2	8	122497	122504	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2584	NC_007385	CAC	3	9	122556	122564	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2585	NC_007385	GCA	3	9	122576	122584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2586	NC_007385	GCCTGC	2	12	122599	122610	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
2587	NC_007385	CA	3	6	122694	122699	50 %	0 %	0 %	50 %	74314974
2588	NC_007385	CAG	2	6	122756	122761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74314974
2589	NC_007385	ATG	2	6	122863	122868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74314974
2590	NC_007385	CAG	2	6	122956	122961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74314975
2591	NC_007385	TCA	2	6	123003	123008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74314975
2592	NC_007385	CAG	2	6	123158	123163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74314976
2593	NC_007385	CAGG	2	8	123175	123182	25 %	0 %	50 %	25 %	74314976
2594	NC_007385	CA	3	6	123291	123296	50 %	0 %	0 %	50 %	74314976
2595	NC_007385	CTG	2	6	123378	123383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74314977
2596	NC_007385	GT	3	6	123386	123391	0 %	50 %	50 %	0 %	74314977
2597	NC_007385	CCG	2	6	123402	123407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74314977
2598	NC_007385	TGA	2	6	123464	123469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74314977
2599	NC_007385	AAC	2	6	123608	123613	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	74314977
2600	NC_007385	TGA	2	6	123644	123649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74314977
2601	NC_007385	TCTT	2	8	123674	123681	0 %	75 %	0 %	25 %	74314977
2602	NC_007385	ATG	3	9	123721	123729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74314977
2603	NC_007385	CAG	2	6	123820	123825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74314977
2604	NC_007385	ATT	2	6	123830	123835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	74314977
2605	NC_007385	T	6	6	123834	123839	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2606	NC_007385	GCG	2	6	123903	123908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2607	NC_007385	GGT	2	6	123957	123962	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74314978
2608	NC_007385	GAA	2	6	124292	124297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2609	NC_007385	T	7	7	124300	124306	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2610	NC_007385	AATAT	2	10	124321	124330	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2611	NC_007385	ATG	2	6	124351	124356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74314979
2612	NC_007385	GAC	2	6	124370	124375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74314979
2613	NC_007385	TTA	2	6	124453	124458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	74314979
2614	NC_007385	TGA	2	6	124497	124502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74314979
2615	NC_007385	C	6	6	124521	124526	0 %	0 %	0 %	100 %	74314979
2616	NC_007385	TAA	2	6	124595	124600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	74314979
2617	NC_007385	GTT	2	6	124604	124609	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	74314979
2618	NC_007385	AT	3	6	124659	124664	50 %	50 %	0 %	0 %	74314979
2619	NC_007385	TTG	2	6	124788	124793	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	74314979
2620	NC_007385	ATT	2	6	124810	124815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	74314979
2621	NC_007385	T	6	6	124851	124856	0 %	100 %	0 %	0 %	74314979
2622	NC_007385	ATTA	2	8	124887	124894	50 %	50 %	0 %	0 %	74314979
2623	NC_007385	AATT	2	8	124902	124909	50 %	50 %	0 %	0 %	74314979
2624	NC_007385	TTG	2	6	124927	124932	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	74314979
2625	NC_007385	AT	3	6	124935	124940	50 %	50 %	0 %	0 %	74314979
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