MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella sonnei Ss046 plasmid pSS_046

Total Repeats: 4514

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_007385	GAC	2	6	74893	74898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1502	NC_007385	CTGG	2	8	74922	74929	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1503	NC_007385	T	6	6	75014	75019	0 %	100 %	0 %	0 %	74314919
1504	NC_007385	CTG	2	6	75044	75049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74314919
1505	NC_007385	CAGC	2	8	75119	75126	25 %	0 %	25 %	50 %	74314919
1506	NC_007385	ACCTT	2	10	75237	75246	20 %	40 %	0 %	40 %	74314919
1507	NC_007385	GA	3	6	75280	75285	50 %	0 %	50 %	0 %	74314919
1508	NC_007385	ACA	2	6	75385	75390	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	74314919
1509	NC_007385	CG	3	6	75394	75399	0 %	0 %	50 %	50 %	74314919
1510	NC_007385	CAC	2	6	75403	75408	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	74314919
1511	NC_007385	AAG	2	6	75411	75416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	74314919
1512	NC_007385	ACA	2	6	75481	75486	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	74314919
1513	NC_007385	GTC	2	6	75568	75573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74314919
1514	NC_007385	CGAAC	2	10	75586	75595	40 %	0 %	20 %	40 %	74314919
1515	NC_007385	GCTCCT	2	12	75601	75612	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	74314919
1516	NC_007385	GA	4	8	75621	75628	50 %	0 %	50 %	0 %	74314919
1517	NC_007385	GAAT	2	8	75631	75638	50 %	25 %	25 %	0 %	74314919
1518	NC_007385	GCGA	2	8	75686	75693	25 %	0 %	50 %	25 %	74314919
1519	NC_007385	CAG	2	6	75778	75783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74314919
1520	NC_007385	GGC	2	6	75801	75806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74314919
1521	NC_007385	TTG	2	6	76022	76027	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_007385	C	6	6	76104	76109	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1523	NC_007385	GAG	2	6	76166	76171	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_007385	ATAA	2	8	76179	76186	75 %	25 %	0 %	0 %	74314920
1525	NC_007385	CAT	2	6	76226	76231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74314920
1526	NC_007385	GGA	2	6	76361	76366	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	74314920
1527	NC_007385	CTG	2	6	76376	76381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1528	NC_007385	CT	3	6	76448	76453	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1529	NC_007385	TATCTT	2	12	76564	76575	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1530	NC_007385	TGG	2	6	76578	76583	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_007385	AGA	2	6	76618	76623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_007385	GCAG	2	8	76627	76634	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1533	NC_007385	AT	3	6	76737	76742	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_007385	ACA	2	6	76766	76771	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1535	NC_007385	TGAA	2	8	76775	76782	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_007385	AGC	2	6	76811	76816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1537	NC_007385	TAAG	2	8	76870	76877	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_007385	TGG	2	6	76880	76885	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_007385	CTAT	2	8	76898	76905	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1540	NC_007385	TCGG	2	8	76915	76922	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1541	NC_007385	A	6	6	76967	76972	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_007385	GGT	2	6	76987	76992	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_007385	TGCTGA	2	12	77092	77103	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
1544	NC_007385	TAA	2	6	77118	77123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_007385	GTT	2	6	77142	77147	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_007385	GACG	2	8	77153	77160	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1547	NC_007385	TGA	2	6	77161	77166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_007385	GTTC	2	8	77200	77207	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1549	NC_007385	TAG	2	6	77239	77244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_007385	TGC	2	6	77269	77274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1551	NC_007385	TCG	2	6	77281	77286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1552	NC_007385	AAC	2	6	77294	77299	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	74314921
1553	NC_007385	GTTAT	2	10	77335	77344	20 %	60 %	20 %	0 %	74314921
1554	NC_007385	AT	3	6	77379	77384	50 %	50 %	0 %	0 %	74314921
1555	NC_007385	TCA	2	6	77391	77396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74314921
1556	NC_007385	GTT	2	6	77438	77443	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	74314921
1557	NC_007385	T	6	6	77442	77447	0 %	100 %	0 %	0 %	74314921
1558	NC_007385	TGC	2	6	77499	77504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74314921
1559	NC_007385	TAA	2	6	77612	77617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	74314921
1560	NC_007385	ATA	2	6	77651	77656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	74314921
1561	NC_007385	CTT	2	6	77707	77712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	74314921
1562	NC_007385	GAA	2	6	77734	77739	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	74314921
1563	NC_007385	T	6	6	77747	77752	0 %	100 %	0 %	0 %	74314921
1564	NC_007385	TTTA	2	8	77767	77774	25 %	75 %	0 %	0 %	74314921
1565	NC_007385	TTA	2	6	77791	77796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	74314921
1566	NC_007385	TCT	2	6	77839	77844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	74314921
1567	NC_007385	ATT	2	6	77957	77962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	74314921
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1569	NC_007385	T	6	6	78074	78079	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_007385	G	6	6	78111	78116	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_007385	TG	3	6	78169	78174	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_007385	TG	3	6	78225	78230	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_007385	GAT	2	6	78301	78306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_007385	TTTTA	2	10	78309	78318	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_007385	TTTAT	2	10	78344	78353	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_007385	AAAT	2	8	78459	78466	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_007385	TAA	2	6	78474	78479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_007385	TTATAA	2	12	78507	78518	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_007385	AAT	2	6	78519	78524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_007385	AT	3	6	78591	78596	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_007385	T	6	6	78606	78611	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_007385	TGG	2	6	78636	78641	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_007385	T	6	6	78643	78648	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_007385	A	7	7	78663	78669	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_007385	AGT	2	6	78673	78678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_007385	CAT	2	6	78777	78782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1587	NC_007385	CAG	2	6	78858	78863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1588	NC_007385	TAT	2	6	78973	78978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1592	NC_007385	TCTTT	2	10	79127	79136	0 %	80 %	0 %	20 %	74314922
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1599	NC_007385	AAT	2	6	79352	79357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	74314922
1600	NC_007385	AAGTT	2	10	79373	79382	40 %	40 %	20 %	0 %	74314922
1601	NC_007385	ATT	2	6	79406	79411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	74314922
1602	NC_007385	TGC	2	6	79426	79431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74314922
1603	NC_007385	CG	3	6	79453	79458	0 %	0 %	50 %	50 %	74314922
1604	NC_007385	T	6	6	79471	79476	0 %	100 %	0 %	0 %	74314922
1605	NC_007385	ATGCT	2	10	79541	79550	20 %	40 %	20 %	20 %	74314922
1606	NC_007385	AT	4	8	79599	79606	50 %	50 %	0 %	0 %	74314922
1607	NC_007385	AT	3	6	79642	79647	50 %	50 %	0 %	0 %	74314922
1608	NC_007385	GAA	2	6	79717	79722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	74314922
1609	NC_007385	TTG	2	6	79723	79728	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	74314922
1610	NC_007385	TTC	2	6	79762	79767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	74314922
1611	NC_007385	T	6	6	79797	79802	0 %	100 %	0 %	0 %	74314922
1612	NC_007385	TTA	2	6	79865	79870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	74314922
1613	NC_007385	CTTT	2	8	79890	79897	0 %	75 %	0 %	25 %	74314922
1614	NC_007385	CCTT	2	8	79901	79908	0 %	50 %	0 %	50 %	74314922
1615	NC_007385	CCA	2	6	79935	79940	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	74314922
1616	NC_007385	TGTA	2	8	80005	80012	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_007385	TGA	2	6	80018	80023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_007385	AAT	2	6	80096	80101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_007385	A	6	6	80139	80144	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_007385	TAA	2	6	80208	80213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	74314923
1621	NC_007385	AGAGAA	2	12	80282	80293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	74314923
1622	NC_007385	TTC	2	6	80323	80328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	74314923
1623	NC_007385	ATA	2	6	80373	80378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	74314923
1624	NC_007385	T	6	6	80379	80384	0 %	100 %	0 %	0 %	74314923
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1627	NC_007385	T	6	6	80498	80503	0 %	100 %	0 %	0 %	74314924
1628	NC_007385	AT	3	6	80511	80516	50 %	50 %	0 %	0 %	74314924
1629	NC_007385	GTAA	2	8	80522	80529	50 %	25 %	25 %	0 %	74314924
1630	NC_007385	CTT	2	6	80583	80588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	74314924
1631	NC_007385	TGT	2	6	80682	80687	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	74314924
1632	NC_007385	TGT	2	6	80701	80706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	74314924
1633	NC_007385	GA	3	6	80773	80778	50 %	0 %	50 %	0 %	74314924
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