MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella sonnei Ss046 plasmid pSS_046

Total Repeats: 4514

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_007385	TCA	2	6	48877	48882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1002	NC_007385	TCTG	2	8	48891	48898	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1003	NC_007385	TAA	2	6	48922	48927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_007385	TTG	2	6	48975	48980	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_007385	T	7	7	49040	49046	0 %	100 %	0 %	0 %	74314889
1006	NC_007385	AT	3	6	49048	49053	50 %	50 %	0 %	0 %	74314889
1007	NC_007385	GGC	2	6	49154	49159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74314889
1008	NC_007385	ATT	2	6	49296	49301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	74314889
1009	NC_007385	AGGA	2	8	49328	49335	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_007385	ATA	2	6	49370	49375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	74314890
1011	NC_007385	A	8	8	49441	49448	100 %	0 %	0 %	0 %	74314890
1012	NC_007385	TTC	2	6	49466	49471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	74314890
1013	NC_007385	CAT	2	6	49478	49483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74314890
1014	NC_007385	A	6	6	49499	49504	100 %	0 %	0 %	0 %	74314890
1015	NC_007385	TCT	2	6	49582	49587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	74314890
1016	NC_007385	AGA	2	6	49594	49599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	74314890
1017	NC_007385	ATAAA	2	10	49637	49646	80 %	20 %	0 %	0 %	74314890
1018	NC_007385	ATC	2	6	49701	49706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74314890
1019	NC_007385	GAA	2	6	49785	49790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	74314890
1020	NC_007385	AGG	2	6	49815	49820	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_007385	T	6	6	49835	49840	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_007385	GTAA	2	8	49855	49862	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_007385	TGG	2	6	50049	50054	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_007385	CAA	2	6	50080	50085	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1025	NC_007385	GCC	2	6	50134	50139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1026	NC_007385	GTG	2	6	50167	50172	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_007385	TCT	2	6	50175	50180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1028	NC_007385	CAG	2	6	50234	50239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1029	NC_007385	ATC	2	6	50300	50305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74314891
1030	NC_007385	CAC	2	6	50334	50339	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	74314891
1031	NC_007385	ATC	2	6	50372	50377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74314891
1032	NC_007385	ATT	2	6	50498	50503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	74314891
1033	NC_007385	GCC	2	6	50597	50602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74314891
1034	NC_007385	A	7	7	50610	50616	100 %	0 %	0 %	0 %	74314891
1035	NC_007385	CGG	2	6	50658	50663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74314891
1036	NC_007385	GCA	2	6	50798	50803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74314892
1037	NC_007385	GC	3	6	50850	50855	0 %	0 %	50 %	50 %	74314892
1038	NC_007385	GGC	2	6	50993	50998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74314892
1039	NC_007385	CGC	2	6	51010	51015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74314892
1040	NC_007385	TAG	2	6	51137	51142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_007385	ACGA	2	8	51251	51258	50 %	0 %	25 %	25 %	74314893
1042	NC_007385	CCAT	2	8	51275	51282	25 %	25 %	0 %	50 %	74314893
1043	NC_007385	AC	3	6	51286	51291	50 %	0 %	0 %	50 %	74314893
1044	NC_007385	GACT	2	8	51311	51318	25 %	25 %	25 %	25 %	74314893
1045	NC_007385	ATGCTG	2	12	51322	51333	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	74314893
1046	NC_007385	CTG	2	6	51372	51377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74314893
1047	NC_007385	CTG	2	6	51562	51567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74314893
1048	NC_007385	CGC	2	6	51619	51624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74314893
1049	NC_007385	TG	3	6	51645	51650	0 %	50 %	50 %	0 %	74314893
1050	NC_007385	GCA	2	6	51706	51711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74314893
1051	NC_007385	ATGAAG	2	12	51758	51769	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	74314893
1052	NC_007385	GGT	2	6	51831	51836	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74314893
1053	NC_007385	TG	3	6	51904	51909	0 %	50 %	50 %	0 %	74314893
1054	NC_007385	GGC	2	6	51910	51915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74314893
1055	NC_007385	TCA	2	6	51938	51943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74314893
1056	NC_007385	CTG	2	6	51946	51951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74314893
1057	NC_007385	GCTG	2	8	52040	52047	0 %	25 %	50 %	25 %	74314893
1058	NC_007385	GGCA	2	8	52121	52128	25 %	0 %	50 %	25 %	74314893
1059	NC_007385	ATC	2	6	52151	52156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74314893
1060	NC_007385	A	6	6	52183	52188	100 %	0 %	0 %	0 %	74314893
1061	NC_007385	ATT	2	6	52278	52283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	74314894
1062	NC_007385	CCA	2	6	52296	52301	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	74314894
1063	NC_007385	A	6	6	52314	52319	100 %	0 %	0 %	0 %	74314894
1064	NC_007385	T	7	7	52325	52331	0 %	100 %	0 %	0 %	74314894
1065	NC_007385	GTT	2	6	52512	52517	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	74314894
1066	NC_007385	CGG	2	6	52711	52716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1067	NC_007385	TGA	2	6	52767	52772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_007385	GCA	2	6	52790	52795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1069	NC_007385	CAA	2	6	52801	52806	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1070	NC_007385	ACA	2	6	52826	52831	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1071	NC_007385	GT	3	6	52844	52849	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_007385	ATG	2	6	52874	52879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_007385	TGG	2	6	52928	52933	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_007385	GGA	2	6	52979	52984	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_007385	AAC	2	6	53027	53032	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1076	NC_007385	TAC	2	6	53157	53162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1077	NC_007385	CA	3	6	53289	53294	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1078	NC_007385	CCTC	2	8	53331	53338	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1079	NC_007385	T	7	7	53356	53362	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_007385	TAATTT	2	12	53367	53378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_007385	ATG	2	6	53417	53422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_007385	TACT	2	8	53434	53441	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1083	NC_007385	TTA	2	6	53483	53488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_007385	A	7	7	53506	53512	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_007385	AATA	2	8	53532	53539	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_007385	AACT	2	8	53546	53553	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1087	NC_007385	ATA	2	6	53684	53689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	74314895
1088	NC_007385	TCA	2	6	53695	53700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74314895
1089	NC_007385	AACTCA	2	12	53722	53733	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	74314895
1090	NC_007385	CTGA	2	8	53761	53768	25 %	25 %	25 %	25 %	74314895
1091	NC_007385	AAG	2	6	53843	53848	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	74314895
1092	NC_007385	ATA	2	6	53927	53932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	74314895
1093	NC_007385	CAT	2	6	53939	53944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74314895
1094	NC_007385	CTGC	2	8	53953	53960	0 %	25 %	25 %	50 %	74314895
1095	NC_007385	ATA	2	6	53984	53989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	74314895
1096	NC_007385	AAC	2	6	54027	54032	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	74314895
1097	NC_007385	GTTC	2	8	54040	54047	0 %	50 %	25 %	25 %	74314895
1098	NC_007385	CAT	2	6	54089	54094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74314895
1099	NC_007385	TTG	2	6	54098	54103	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	74314895
1100	NC_007385	TA	3	6	54116	54121	50 %	50 %	0 %	0 %	74314895
1101	NC_007385	TAT	2	6	54163	54168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	74314895
1102	NC_007385	ACA	2	6	54178	54183	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	74314895
1103	NC_007385	AAT	2	6	54229	54234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	74314895
1104	NC_007385	ATT	2	6	54287	54292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	74314895
1105	NC_007385	ACA	2	6	54465	54470	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	74314895
1106	NC_007385	ACAA	2	8	54524	54531	75 %	0 %	0 %	25 %	74314895
1107	NC_007385	CAG	2	6	54700	54705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74314895
1108	NC_007385	TGC	2	6	54717	54722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74314895
1109	NC_007385	CCT	2	6	54783	54788	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	74314895
1110	NC_007385	GCTCT	2	10	54832	54841	0 %	40 %	20 %	40 %	74314895
1111	NC_007385	GGA	2	6	54876	54881	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	74314895
1112	NC_007385	GAAT	2	8	55071	55078	50 %	25 %	25 %	0 %	74314895
1113	NC_007385	GCAG	2	8	55149	55156	25 %	0 %	50 %	25 %	74314895
1114	NC_007385	GATGCG	2	12	55237	55248	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	74314895
1115	NC_007385	CAG	2	6	55288	55293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74314895
1116	NC_007385	TGAC	2	8	55307	55314	25 %	25 %	25 %	25 %	74314895
1117	NC_007385	GCATAA	2	12	55376	55387	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1118	NC_007385	AAC	3	9	55438	55446	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1119	NC_007385	T	6	6	55496	55501	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_007385	AACC	2	8	55510	55517	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1121	NC_007385	TCC	2	6	55686	55691	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1122	NC_007385	T	7	7	55728	55734	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_007385	TAA	2	6	55790	55795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_007385	CAA	2	6	55807	55812	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	74314896
1125	NC_007385	T	7	7	55819	55825	0 %	100 %	0 %	0 %	74314896
1126	NC_007385	AGA	2	6	55867	55872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	74314896
1127	NC_007385	ACC	2	6	55890	55895	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	74314896
1128	NC_007385	AAC	3	9	55924	55932	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	74314896
1129	NC_007385	ATT	2	6	55957	55962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	74314896
1130	NC_007385	ACC	2	6	56026	56031	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	74314896
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1132	NC_007385	AAC	2	6	56129	56134	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	74314896
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