MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella sonnei Ss046 chromosome

Total Repeats: 97740

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_007384	AAC	2	6	98829	98834	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2002	NC_007384	T	6	6	98860	98865	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2003	NC_007384	TCC	2	6	98902	98907	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2004	NC_007384	GCT	2	6	99045	99050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74310700
2005	NC_007384	TCA	2	6	99090	99095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74310700
2006	NC_007384	CTG	2	6	99103	99108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74310700
2007	NC_007384	CCTG	2	8	99117	99124	0 %	25 %	25 %	50 %	74310700
2008	NC_007384	GATG	2	8	99225	99232	25 %	25 %	50 %	0 %	74310700
2009	NC_007384	AAG	2	6	99287	99292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	74310700
2010	NC_007384	CAA	2	6	99312	99317	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	74310700
2011	NC_007384	AAC	2	6	99336	99341	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	74310700
2012	NC_007384	ATG	2	6	99431	99436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74310701
2013	NC_007384	TAC	2	6	99451	99456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74310701
2014	NC_007384	TGC	2	6	99459	99464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74310701
2015	NC_007384	GGT	2	6	99533	99538	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74310701
2016	NC_007384	CGAT	2	8	99588	99595	25 %	25 %	25 %	25 %	74310701
2017	NC_007384	TGA	2	6	99631	99636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74310701
2018	NC_007384	CAT	2	6	99649	99654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74310701
2019	NC_007384	TGA	2	6	99757	99762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74310701
2020	NC_007384	AGA	2	6	99859	99864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	74310701
2021	NC_007384	GGA	2	6	100078	100083	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	74310701
2022	NC_007384	GCTC	2	8	100104	100111	0 %	25 %	25 %	50 %	74310701
2023	NC_007384	GGC	2	6	100131	100136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74310701
2024	NC_007384	ATC	2	6	100142	100147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74310701
2025	NC_007384	AGC	2	6	100242	100247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74310701
2026	NC_007384	A	6	6	100250	100255	100 %	0 %	0 %	0 %	74310701
2027	NC_007384	GAA	2	6	100301	100306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	74310701
2028	NC_007384	AGTTC	2	10	100334	100343	20 %	40 %	20 %	20 %	74310701
2029	NC_007384	AG	3	6	100354	100359	50 %	0 %	50 %	0 %	74310701
2030	NC_007384	CAG	2	6	100374	100379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74310702
2031	NC_007384	ATT	2	6	100504	100509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	74310702
2032	NC_007384	CGG	2	6	100514	100519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74310702
2033	NC_007384	AAC	2	6	100571	100576	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	74310702
2034	NC_007384	GCA	2	6	100689	100694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74310702
2035	NC_007384	AGC	2	6	100755	100760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74310703
2036	NC_007384	GAA	2	6	100789	100794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	74310703
2037	NC_007384	GTT	2	6	100824	100829	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	74310703
2038	NC_007384	AAG	2	6	101036	101041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	74310703
2039	NC_007384	TTTA	2	8	101155	101162	25 %	75 %	0 %	0 %	74310703
2040	NC_007384	A	6	6	101203	101208	100 %	0 %	0 %	0 %	74310703
2041	NC_007384	TCCG	2	8	101256	101263	0 %	25 %	25 %	50 %	74310703
2042	NC_007384	TCT	2	6	101413	101418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	74310703
2043	NC_007384	TGA	2	6	101457	101462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74310703
2044	NC_007384	AAC	2	6	101494	101499	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	74310703
2045	NC_007384	TGG	2	6	101540	101545	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74310703
2046	NC_007384	TGG	2	6	101684	101689	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74310703
2047	NC_007384	CGTGG	2	10	101707	101716	0 %	20 %	60 %	20 %	74310703
2048	NC_007384	TAG	2	6	101876	101881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74310703
2049	NC_007384	TACT	2	8	101883	101890	25 %	50 %	0 %	25 %	74310703
2050	NC_007384	GGT	2	6	101966	101971	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74310703
2051	NC_007384	AG	3	6	101979	101984	50 %	0 %	50 %	0 %	74310703
2052	NC_007384	C	6	6	102099	102104	0 %	0 %	0 %	100 %	74310703
2053	NC_007384	ATG	2	6	102157	102162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74310703
2054	NC_007384	GGC	4	12	102181	102192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74310703
2055	NC_007384	GGC	2	6	102198	102203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74310703
2056	NC_007384	TATCG	2	10	102214	102223	20 %	40 %	20 %	20 %	74310703
2057	NC_007384	AATA	2	8	102274	102281	75 %	25 %	0 %	0 %	74310703
2058	NC_007384	GTT	3	9	102334	102342	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	74310703
2059	NC_007384	TAC	2	6	102367	102372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74310703
2060	NC_007384	GGC	2	6	102373	102378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74310703
2061	NC_007384	CAT	2	6	102405	102410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74310703
2062	NC_007384	GCG	2	6	102413	102418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74310703
2063	NC_007384	CTT	2	6	102527	102532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	74310704
2064	NC_007384	GA	3	6	102570	102575	50 %	0 %	50 %	0 %	74310704
2065	NC_007384	GCG	2	6	102599	102604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74310704
2066	NC_007384	GTA	2	6	102623	102628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74310704
2067	NC_007384	TCA	2	6	102631	102636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74310704
2068	NC_007384	AT	3	6	102652	102657	50 %	50 %	0 %	0 %	74310704
2069	NC_007384	ATT	2	6	102689	102694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	74310704
2070	NC_007384	GCGAAA	2	12	102701	102712	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	74310704
2071	NC_007384	CGAC	2	8	102720	102727	25 %	0 %	25 %	50 %	74310704
2072	NC_007384	ATCT	2	8	102761	102768	25 %	50 %	0 %	25 %	74310704
2073	NC_007384	CAGC	2	8	102769	102776	25 %	0 %	25 %	50 %	74310704
2074	NC_007384	GCT	2	6	102883	102888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74310704
2075	NC_007384	TAC	2	6	102979	102984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74310704
2076	NC_007384	TGG	2	6	103023	103028	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74310704
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2080	NC_007384	GCT	2	6	103186	103191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74310704
2081	NC_007384	CAT	2	6	103202	103207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74310704
2082	NC_007384	ATT	2	6	103220	103225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	74310704
2083	NC_007384	CGA	2	6	103231	103236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74310704
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2085	NC_007384	GCTG	2	8	103251	103258	0 %	25 %	50 %	25 %	74310704
2086	NC_007384	CGA	2	6	103365	103370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74310704
2087	NC_007384	CTG	2	6	103442	103447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74310704
2088	NC_007384	CTG	2	6	103463	103468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74310704
2089	NC_007384	CTG	2	6	103493	103498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74310704
2090	NC_007384	CCG	2	6	103503	103508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74310704
2091	NC_007384	CG	3	6	103507	103512	0 %	0 %	50 %	50 %	74310704
2092	NC_007384	GGT	3	9	103567	103575	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74310704
2093	NC_007384	GGC	2	6	103618	103623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74310704
2094	NC_007384	GC	3	6	103622	103627	0 %	0 %	50 %	50 %	74310704
2095	NC_007384	TGG	2	6	103666	103671	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74310704
2096	NC_007384	GGT	2	6	103735	103740	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74310704
2097	NC_007384	GACG	2	8	103741	103748	25 %	0 %	50 %	25 %	74310704
2098	NC_007384	GAA	2	6	103763	103768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	74310704
2099	NC_007384	CAT	2	6	103777	103782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74310704
2100	NC_007384	ATG	2	6	103881	103886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74310704
2101	NC_007384	TTG	2	6	103926	103931	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	74310704
2102	NC_007384	ACT	2	6	103947	103952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74310704
2103	NC_007384	CTG	2	6	103976	103981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74310704
2104	NC_007384	TGTT	2	8	104108	104115	0 %	75 %	25 %	0 %	74310705
2105	NC_007384	GGC	2	6	104170	104175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74310705
2106	NC_007384	ACT	2	6	104184	104189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74310705
2107	NC_007384	GC	3	6	104290	104295	0 %	0 %	50 %	50 %	74310705
2108	NC_007384	TCC	2	6	104314	104319	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	74310705
2109	NC_007384	CGG	2	6	104345	104350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74310705
2110	NC_007384	GGCA	2	8	104385	104392	25 %	0 %	50 %	25 %	74310705
2111	NC_007384	CAA	2	6	104397	104402	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	74310705
2112	NC_007384	GTT	2	6	104424	104429	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	74310705
2113	NC_007384	CAA	2	6	104535	104540	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	74310705
2114	NC_007384	GCG	2	6	104548	104553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74310705
2115	NC_007384	CGAAAG	2	12	104588	104599	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	74310705
2116	NC_007384	ACA	2	6	104651	104656	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	74310705
2117	NC_007384	GCC	2	6	104719	104724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74310705
2118	NC_007384	CCA	2	6	104741	104746	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	74310705
2119	NC_007384	CTG	2	6	104812	104817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74310705
2120	NC_007384	TGC	2	6	104972	104977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74310705
2121	NC_007384	CGA	2	6	104979	104984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74310705
2122	NC_007384	CCG	2	6	105014	105019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74310705
2123	NC_007384	TGG	3	9	105059	105067	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74310705
2124	NC_007384	GGC	2	6	105123	105128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74310705
2125	NC_007384	GCT	2	6	105133	105138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74310705
2126	NC_007384	GCG	2	6	105194	105199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74310705
2127	NC_007384	GCC	2	6	105301	105306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74310705
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2143	NC_007384	CTG	2	6	106209	106214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74310706
2144	NC_007384	G	6	6	106223	106228	0 %	0 %	100 %	0 %	74310706
2145	NC_007384	TCA	2	6	106316	106321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74310706
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2148	NC_007384	GTC	2	6	106454	106459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74310707
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2150	NC_007384	CGC	2	6	106521	106526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74310707
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2152	NC_007384	ATG	2	6	106605	106610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74310707
2153	NC_007384	GGC	2	6	106621	106626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74310707
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2158	NC_007384	GTGG	2	8	106835	106842	0 %	25 %	75 %	0 %	74310707
2159	NC_007384	TGC	2	6	106866	106871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74310707
2160	NC_007384	GGC	2	6	106948	106953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74310707
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2162	NC_007384	GTC	2	6	107057	107062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74310707
2163	NC_007384	TGA	2	6	107068	107073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74310707
2164	NC_007384	TGA	2	6	107101	107106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74310707
2165	NC_007384	ATC	2	6	107151	107156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74310707
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2168	NC_007384	CTGGCA	2	12	107258	107269	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	74310707
2169	NC_007384	CG	3	6	107286	107291	0 %	0 %	50 %	50 %	74310707
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2184	NC_007384	TGC	2	6	108086	108091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74310708
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2187	NC_007384	GATC	2	8	108159	108166	25 %	25 %	25 %	25 %	74310708
2188	NC_007384	TGC	2	6	108173	108178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74310708
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2192	NC_007384	GGT	3	9	108345	108353	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74310708
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2213	NC_007384	TGC	2	6	109598	109603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74310709
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2220	NC_007384	CGC	2	6	109793	109798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74310709
2221	NC_007384	GTT	2	6	109814	109819	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	74310709
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2223	NC_007384	GGT	2	6	109945	109950	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74310709
2224	NC_007384	TTA	2	6	109962	109967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	74310709
2225	NC_007384	CGAG	2	8	110012	110019	25 %	0 %	50 %	25 %	74310709
2226	NC_007384	AAG	2	6	110087	110092	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2227	NC_007384	GAAT	2	8	110106	110113	50 %	25 %	25 %	0 %	74310710
2228	NC_007384	ACA	2	6	110116	110121	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	74310710
2229	NC_007384	GGT	2	6	110189	110194	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74310710
2230	NC_007384	ATCAG	2	10	110238	110247	40 %	20 %	20 %	20 %	74310710
2231	NC_007384	GCA	2	6	110278	110283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74310710
2232	NC_007384	CGA	2	6	110301	110306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74310710
2233	NC_007384	ACGT	2	8	110331	110338	25 %	25 %	25 %	25 %	74310710
2234	NC_007384	GTT	2	6	110354	110359	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	74310710
2235	NC_007384	CGT	2	6	110426	110431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74310710
2236	NC_007384	GCTG	2	8	110440	110447	0 %	25 %	50 %	25 %	74310710
2237	NC_007384	ACC	2	6	110504	110509	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	74310710
2238	NC_007384	CGG	2	6	110563	110568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74310710
2239	NC_007384	GCG	2	6	110579	110584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74310710
2240	NC_007384	TGG	2	6	110670	110675	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74310710
2241	NC_007384	TACC	2	8	110710	110717	25 %	25 %	0 %	50 %	74310710
2242	NC_007384	TTA	2	6	110748	110753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	74310710
2243	NC_007384	TG	3	6	110793	110798	0 %	50 %	50 %	0 %	74310710
2244	NC_007384	TGA	2	6	110800	110805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74310710
2245	NC_007384	CGTG	2	8	110878	110885	0 %	25 %	50 %	25 %	74310710
2246	NC_007384	AGA	2	6	110887	110892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	74310710
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2323	NC_007384	TGC	2	6	114947	114952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74310714
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2347	NC_007384	CCG	2	6	115846	115851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2348	NC_007384	ATA	2	6	115892	115897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2349	NC_007384	GAT	2	6	115899	115904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74310715
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2351	NC_007384	TCG	2	6	116016	116021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74310715
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2359	NC_007384	TG	3	6	116645	116650	0 %	50 %	50 %	0 %	74310715
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2362	NC_007384	GAC	2	6	116764	116769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74310715
2363	NC_007384	CT	3	6	116862	116867	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2364	NC_007384	T	9	9	116888	116896	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2365	NC_007384	A	6	6	116915	116920	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2366	NC_007384	TTA	2	6	117108	117113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161986597
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2493	NC_007384	CAC	2	6	123660	123665	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	74310723
2494	NC_007384	CAA	2	6	123702	123707	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	74310723
2495	NC_007384	ATCCC	2	10	123751	123760	20 %	20 %	0 %	60 %	74310725
2496	NC_007384	CATCG	2	10	123764	123773	20 %	20 %	20 %	40 %	74310725
2497	NC_007384	CCA	3	9	123802	123810	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	74310725
2498	NC_007384	TCC	2	6	123824	123829	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	74310725
2499	NC_007384	GAT	3	9	123898	123906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74310725
2500	NC_007384	T	6	6	123996	124001	0 %	100 %	0 %	0 %	74310725

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