MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella sonnei Ss046 chromosome

Total Repeats: 97740

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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21002	NC_007384	A	6	6	1027146	1027151	100 %	0 %	0 %	0 %	74311505
21003	NC_007384	AGGA	2	8	1027171	1027178	50 %	0 %	50 %	0 %	74311505
21004	NC_007384	GTG	3	9	1027251	1027259	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74311505
21005	NC_007384	GCC	2	6	1027271	1027276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74311505
21006	NC_007384	CAAA	2	8	1027357	1027364	75 %	0 %	0 %	25 %	74311505
21007	NC_007384	CGCC	2	8	1027520	1027527	0 %	0 %	25 %	75 %	74311505
21008	NC_007384	GCAAAG	2	12	1027546	1027557	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	74311505
21009	NC_007384	GGC	2	6	1027611	1027616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74311505
21010	NC_007384	GC	4	8	1027615	1027622	0 %	0 %	50 %	50 %	74311505
21011	NC_007384	CAC	3	9	1027625	1027633	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	74311505
21012	NC_007384	TGATC	2	10	1027763	1027772	20 %	40 %	20 %	20 %	74311505
21013	NC_007384	TGA	2	6	1027849	1027854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74311505
21014	NC_007384	CTG	2	6	1027869	1027874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74311505
21015	NC_007384	AAC	2	6	1027902	1027907	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	74311505
21016	NC_007384	A	6	6	1027975	1027980	100 %	0 %	0 %	0 %	74311505
21017	NC_007384	CTG	2	6	1028021	1028026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74311505
21018	NC_007384	CGC	2	6	1028103	1028108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74311506
21019	NC_007384	AACG	2	8	1028141	1028148	50 %	0 %	25 %	25 %	74311506
21020	NC_007384	TGG	2	6	1028157	1028162	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74311506
21021	NC_007384	ATT	2	6	1028234	1028239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	74311506
21022	NC_007384	GCC	2	6	1028278	1028283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74311506
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21024	NC_007384	TGA	2	6	1028379	1028384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74311506
21025	NC_007384	CGAG	2	8	1028391	1028398	25 %	0 %	50 %	25 %	74311506
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21029	NC_007384	CG	3	6	1028561	1028566	0 %	0 %	50 %	50 %	74311506
21030	NC_007384	CG	3	6	1028580	1028585	0 %	0 %	50 %	50 %	74311506
21031	NC_007384	TGA	2	6	1028596	1028601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74311506
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21033	NC_007384	CTGG	2	8	1028635	1028642	0 %	25 %	50 %	25 %	74311506
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21042	NC_007384	GCCAC	2	10	1029304	1029313	20 %	0 %	20 %	60 %	74311506
21043	NC_007384	TGC	2	6	1029402	1029407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74311506
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21047	NC_007384	CGG	2	6	1029616	1029621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74311506
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21055	NC_007384	TCAG	2	8	1029846	1029853	25 %	25 %	25 %	25 %	74311506
21056	NC_007384	GCT	2	6	1029890	1029895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74311506
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21058	NC_007384	TGG	2	6	1029955	1029960	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74311506
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21060	NC_007384	CAT	2	6	1030076	1030081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21061	NC_007384	CAT	3	9	1030103	1030111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74311507
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21063	NC_007384	CGTGG	2	10	1030216	1030225	0 %	20 %	60 %	20 %	74311507
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21072	NC_007384	TCG	2	6	1030669	1030674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74311507
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21101	NC_007384	TCA	2	6	1031959	1031964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74311508
21102	NC_007384	GCT	2	6	1032077	1032082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74311508
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21113	NC_007384	GCA	2	6	1032761	1032766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74311508
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21118	NC_007384	A	6	6	1032957	1032962	100 %	0 %	0 %	0 %	74311508
21119	NC_007384	GCA	2	6	1033013	1033018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74311509
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21133	NC_007384	TTTTC	2	10	1033768	1033777	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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21234	NC_007384	GCTA	2	8	1039977	1039984	25 %	25 %	25 %	25 %	74311517
21235	NC_007384	TTC	2	6	1040001	1040006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	74311517
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21237	NC_007384	TGA	2	6	1040017	1040022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74311517
21238	NC_007384	TCA	2	6	1040032	1040037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74311517
21239	NC_007384	TCA	2	6	1040053	1040058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74311517
21240	NC_007384	ACC	2	6	1040209	1040214	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	74311517
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21242	NC_007384	CGG	2	6	1040248	1040253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74311517
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21245	NC_007384	TGA	2	6	1040501	1040506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74311517
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21249	NC_007384	CACAG	2	10	1040605	1040614	40 %	0 %	20 %	40 %	74311517
21250	NC_007384	TACC	2	8	1040630	1040637	25 %	25 %	0 %	50 %	74311517
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21253	NC_007384	ACAA	2	8	1040698	1040705	75 %	0 %	0 %	25 %	74311517
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21261	NC_007384	CAA	2	6	1041093	1041098	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	74311517
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21264	NC_007384	CAG	2	6	1041345	1041350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74311517
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21344	NC_007384	CG	3	6	1044942	1044947	0 %	0 %	50 %	50 %	161986558
21345	NC_007384	GTT	2	6	1044989	1044994	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161986558
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21347	NC_007384	TTTG	2	8	1045034	1045041	0 %	75 %	25 %	0 %	161986558
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21351	NC_007384	GTT	2	6	1045285	1045290	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	74311521
21352	NC_007384	AGC	2	6	1045344	1045349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74311521
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21354	NC_007384	AATC	2	8	1045435	1045442	50 %	25 %	0 %	25 %	74311521
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21426	NC_007384	CAGT	2	8	1048559	1048566	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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21466	NC_007384	TAAT	2	8	1050310	1050317	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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21468	NC_007384	ATAATG	2	12	1050326	1050337	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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21470	NC_007384	GCG	2	6	1050610	1050615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21471	NC_007384	TTTG	3	12	1050629	1050640	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
21472	NC_007384	CAG	2	6	1050681	1050686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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21474	NC_007384	CA	3	6	1050804	1050809	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
21475	NC_007384	TGC	2	6	1050840	1050845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21476	NC_007384	ATG	2	6	1050865	1050870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21477	NC_007384	CCT	2	6	1050915	1050920	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21478	NC_007384	GTG	2	6	1050938	1050943	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21479	NC_007384	A	6	6	1051141	1051146	100 %	0 %	0 %	0 %	74311528
21480	NC_007384	GCTG	2	8	1051253	1051260	0 %	25 %	50 %	25 %	74311528
21481	NC_007384	GTT	2	6	1051291	1051296	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	74311528
21482	NC_007384	CTG	2	6	1051348	1051353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74311528
21483	NC_007384	GTG	2	6	1051366	1051371	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74311528
21484	NC_007384	TGGC	2	8	1051386	1051393	0 %	25 %	50 %	25 %	74311528
21485	NC_007384	GCA	2	6	1051482	1051487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74311528
21486	NC_007384	TTA	2	6	1051621	1051626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21487	NC_007384	GCG	2	6	1051815	1051820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74311529
21488	NC_007384	GGT	2	6	1051941	1051946	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74311529
21489	NC_007384	CTG	2	6	1051971	1051976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74311529
21490	NC_007384	TCCGC	2	10	1051991	1052000	0 %	20 %	20 %	60 %	74311529
21491	NC_007384	GCC	2	6	1052068	1052073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74311529
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21493	NC_007384	CAT	2	6	1052103	1052108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74311529
21494	NC_007384	AT	3	6	1052127	1052132	50 %	50 %	0 %	0 %	74311529
21495	NC_007384	CCG	2	6	1052152	1052157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74311529
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21497	NC_007384	TCA	2	6	1052327	1052332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74311529
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21499	NC_007384	TGA	2	6	1052381	1052386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74311529
21500	NC_007384	CAT	2	6	1052391	1052396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74311529

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