MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella sonnei Ss046 chromosome

Total Repeats: 97740

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19002	NC_007384	GTC	2	6	929582	929587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19003	NC_007384	TG	3	6	929593	929598	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19004	NC_007384	ATT	2	6	929625	929630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19005	NC_007384	AT	3	6	929672	929677	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19006	NC_007384	AGA	2	6	929822	929827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19007	NC_007384	CAT	2	6	929836	929841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19008	NC_007384	A	6	6	929868	929873	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19009	NC_007384	CAC	2	6	929896	929901	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19010	NC_007384	TAT	2	6	929937	929942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19011	NC_007384	TTAT	2	8	929954	929961	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19012	NC_007384	GTG	2	6	930027	930032	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19013	NC_007384	CAT	2	6	930075	930080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19014	NC_007384	ATTTT	2	10	930135	930144	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
19015	NC_007384	A	6	6	930183	930188	100 %	0 %	0 %	0 %	74311433
19016	NC_007384	ATC	2	6	930243	930248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74311433
19017	NC_007384	ACG	2	6	930312	930317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74311433
19018	NC_007384	TGG	2	6	930438	930443	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74311434
19019	NC_007384	ACC	2	6	930461	930466	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	74311434
19020	NC_007384	CGA	2	6	930540	930545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74311434
19021	NC_007384	A	6	6	930734	930739	100 %	0 %	0 %	0 %	74311434
19022	NC_007384	ACA	2	6	930781	930786	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	74311434
19023	NC_007384	ATG	2	6	930795	930800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74311434
19024	NC_007384	T	6	6	930862	930867	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19025	NC_007384	TGG	2	6	930879	930884	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19026	NC_007384	GCGG	2	8	930903	930910	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
19027	NC_007384	T	6	6	930929	930934	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19028	NC_007384	TCACCA	2	12	930945	930956	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
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19030	NC_007384	GTT	2	6	931010	931015	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19031	NC_007384	T	6	6	931014	931019	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19032	NC_007384	A	6	6	931053	931058	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19033	NC_007384	A	8	8	931066	931073	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19034	NC_007384	ATG	2	6	931135	931140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19035	NC_007384	AAT	2	6	931164	931169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19036	NC_007384	TAGA	2	8	931224	931231	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
19037	NC_007384	ATTT	2	8	931237	931244	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19038	NC_007384	AAT	2	6	931261	931266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19039	NC_007384	AAC	2	6	931307	931312	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19040	NC_007384	CAG	2	6	931382	931387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19041	NC_007384	TCA	2	6	931399	931404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19042	NC_007384	TGT	2	6	931524	931529	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	74311435
19043	NC_007384	CGG	2	6	931554	931559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74311435
19044	NC_007384	TGG	2	6	931644	931649	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74311435
19045	NC_007384	CTAT	2	8	931670	931677	25 %	50 %	0 %	25 %	74311435
19046	NC_007384	ATC	2	6	931691	931696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74311435
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19049	NC_007384	GAT	4	12	931791	931802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74311435
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19052	NC_007384	CGC	2	6	931846	931851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74311435
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19055	NC_007384	TGGA	2	8	931957	931964	25 %	25 %	50 %	0 %	74311435
19056	NC_007384	ACAA	2	8	932266	932273	75 %	0 %	0 %	25 %	74311435
19057	NC_007384	ACC	2	6	932275	932280	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	74311435
19058	NC_007384	TAC	2	6	932293	932298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74311435
19059	NC_007384	ATG	2	6	932398	932403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74311435
19060	NC_007384	CAT	2	6	932426	932431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74311435
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19062	NC_007384	TGG	2	6	932532	932537	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74311435
19063	NC_007384	GCG	2	6	932560	932565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74311435
19064	NC_007384	A	6	6	932586	932591	100 %	0 %	0 %	0 %	74311435
19065	NC_007384	CGT	2	6	932619	932624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74311435
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19084	NC_007384	TGG	2	6	933396	933401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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19087	NC_007384	TCA	4	12	933462	933473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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19089	NC_007384	TGT	2	6	933485	933490	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19090	NC_007384	A	6	6	933509	933514	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19091	NC_007384	GAT	3	9	933515	933523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19092	NC_007384	A	6	6	933571	933576	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19093	NC_007384	CCG	2	6	933644	933649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74311437
19094	NC_007384	CAGC	2	8	933662	933669	25 %	0 %	25 %	50 %	74311437
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19097	NC_007384	GGAG	2	8	933838	933845	25 %	0 %	75 %	0 %	74311437
19098	NC_007384	TGT	2	6	933906	933911	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19099	NC_007384	AG	3	6	933956	933961	50 %	0 %	50 %	0 %	74311438
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19103	NC_007384	GCCA	2	8	934075	934082	25 %	0 %	25 %	50 %	74311438
19104	NC_007384	TGC	2	6	934218	934223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74311438
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19106	NC_007384	CGTC	2	8	934253	934260	0 %	25 %	25 %	50 %	74311438
19107	NC_007384	CGC	2	6	934405	934410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74311438
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19109	NC_007384	TG	3	6	934475	934480	0 %	50 %	50 %	0 %	74311438
19110	NC_007384	GAA	2	6	934519	934524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	74311438
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19112	NC_007384	GCTG	2	8	934564	934571	0 %	25 %	50 %	25 %	74311438
19113	NC_007384	AAGGT	2	10	934623	934632	40 %	20 %	40 %	0 %	74311438
19114	NC_007384	CTT	2	6	934663	934668	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	74311438
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19121	NC_007384	GTCA	2	8	935069	935076	25 %	25 %	25 %	25 %	74311438
19122	NC_007384	GAG	2	6	935105	935110	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	74311438
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19498	NC_007384	GCTG	2	8	951988	951995	0 %	25 %	50 %	25 %	74311450
19499	NC_007384	CG	3	6	952011	952016	0 %	0 %	50 %	50 %	74311450
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