MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella sonnei Ss046 chromosome

Total Repeats: 97740

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18002	NC_007384	GGC	2	6	881343	881348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18003	NC_007384	GCT	2	6	881376	881381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18004	NC_007384	GCG	2	6	881523	881528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18005	NC_007384	TGC	2	6	881536	881541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18006	NC_007384	A	7	7	881704	881710	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18007	NC_007384	GTC	2	6	881758	881763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74311387
18008	NC_007384	GCGG	2	8	881823	881830	0 %	0 %	75 %	25 %	74311387
18009	NC_007384	CTGA	2	8	881903	881910	25 %	25 %	25 %	25 %	74311387
18010	NC_007384	GC	3	6	881997	882002	0 %	0 %	50 %	50 %	74311387
18011	NC_007384	AAT	2	6	882040	882045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18012	NC_007384	TTCA	2	8	882078	882085	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
18013	NC_007384	TGC	2	6	882105	882110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18014	NC_007384	CGA	2	6	882211	882216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74311388
18015	NC_007384	GCCT	2	8	882251	882258	0 %	25 %	25 %	50 %	74311388
18016	NC_007384	GCA	2	6	882262	882267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74311388
18017	NC_007384	ACC	2	6	882297	882302	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	74311388
18018	NC_007384	GTC	2	6	882311	882316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74311388
18019	NC_007384	TGC	2	6	882385	882390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74311388
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18021	NC_007384	TCT	2	6	882501	882506	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	74311388
18022	NC_007384	ATA	2	6	882542	882547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	74311388
18023	NC_007384	T	6	6	882581	882586	0 %	100 %	0 %	0 %	74311388
18024	NC_007384	T	6	6	882603	882608	0 %	100 %	0 %	0 %	74311388
18025	NC_007384	AAT	2	6	882617	882622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	74311388
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18028	NC_007384	GCC	2	6	882722	882727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74311388
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18031	NC_007384	ATA	2	6	882785	882790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	74311388
18032	NC_007384	T	6	6	882874	882879	0 %	100 %	0 %	0 %	74311388
18033	NC_007384	CCAT	2	8	882897	882904	25 %	25 %	0 %	50 %	74311388
18034	NC_007384	AATT	2	8	882914	882921	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18035	NC_007384	TCA	2	6	882928	882933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74311389
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18038	NC_007384	CGA	2	6	883080	883085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74311389
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18042	NC_007384	AACC	2	8	883319	883326	50 %	0 %	0 %	50 %	74311389
18043	NC_007384	TAA	2	6	883417	883422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	74311389
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18045	NC_007384	GCA	2	6	883544	883549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74311389
18046	NC_007384	TACC	2	8	883602	883609	25 %	25 %	0 %	50 %	74311389
18047	NC_007384	GCC	2	6	883613	883618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74311389
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18050	NC_007384	ATC	3	9	883862	883870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74311389
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18052	NC_007384	AGA	2	6	884076	884081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	74311389
18053	NC_007384	GAA	2	6	884123	884128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	74311389
18054	NC_007384	AAG	2	6	884155	884160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18055	NC_007384	ACA	2	6	884168	884173	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18056	NC_007384	CAGA	2	8	884206	884213	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
18057	NC_007384	A	6	6	884254	884259	100 %	0 %	0 %	0 %	74311390
18058	NC_007384	CTA	2	6	884360	884365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74311390
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18065	NC_007384	GC	3	6	884653	884658	0 %	0 %	50 %	50 %	74311390
18066	NC_007384	ACCG	2	8	884697	884704	25 %	0 %	25 %	50 %	74311390
18067	NC_007384	CG	3	6	884716	884721	0 %	0 %	50 %	50 %	74311390
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18070	NC_007384	A	7	7	884902	884908	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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18102	NC_007384	T	6	6	886679	886684	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18103	NC_007384	ATTC	2	8	886704	886711	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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18105	NC_007384	AT	3	6	886740	886745	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18106	NC_007384	AGG	2	6	886878	886883	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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18111	NC_007384	T	7	7	887132	887138	0 %	100 %	0 %	0 %	74311392
18112	NC_007384	TTAT	2	8	887219	887226	25 %	75 %	0 %	0 %	74311392
18113	NC_007384	AGT	2	6	887228	887233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74311392
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18115	NC_007384	A	6	6	887254	887259	100 %	0 %	0 %	0 %	74311392
18116	NC_007384	TTTC	2	8	887310	887317	0 %	75 %	0 %	25 %	74311393
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18494	NC_007384	TCT	2	6	904204	904209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	74311412
18495	NC_007384	CAGGCG	2	12	904299	904310	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	74311412
18496	NC_007384	GAT	2	6	904353	904358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74311412
18497	NC_007384	ACC	2	6	904424	904429	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	74311412
18498	NC_007384	CTGGC	2	10	904479	904488	0 %	20 %	40 %	40 %	74311412
18499	NC_007384	TGGC	2	8	904562	904569	0 %	25 %	50 %	25 %	74311412
18500	NC_007384	ATT	2	6	904647	904652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	74311412

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