MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella sonnei Ss046 chromosome

Total Repeats: 97740

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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17002	NC_007384	CAGT	2	8	830115	830122	25 %	25 %	25 %	25 %	74311348
17003	NC_007384	ACTG	2	8	830129	830136	25 %	25 %	25 %	25 %	74311348
17004	NC_007384	TCG	2	6	830208	830213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74311348
17005	NC_007384	TCA	2	6	830292	830297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74311348
17006	NC_007384	TCA	2	6	830304	830309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74311348
17007	NC_007384	ATC	2	6	830378	830383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74311348
17008	NC_007384	TCC	2	6	830548	830553	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	74311348
17009	NC_007384	CGTC	2	8	830568	830575	0 %	25 %	25 %	50 %	74311348
17010	NC_007384	CAG	2	6	830584	830589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74311348
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17013	NC_007384	GAT	2	6	830697	830702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74311348
17014	NC_007384	ATC	2	6	830756	830761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74311348
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17016	NC_007384	TTC	2	6	830891	830896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	74311348
17017	NC_007384	CAG	2	6	830920	830925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74311348
17018	NC_007384	AC	3	6	831045	831050	50 %	0 %	0 %	50 %	74311348
17019	NC_007384	CAG	2	6	831061	831066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74311348
17020	NC_007384	GCG	2	6	831090	831095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74311348
17021	NC_007384	CGG	2	6	831134	831139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74311348
17022	NC_007384	GCA	2	6	831210	831215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74311348
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17024	NC_007384	CAT	2	6	831289	831294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74311348
17025	NC_007384	GGCAA	2	10	831340	831349	40 %	0 %	40 %	20 %	74311348
17026	NC_007384	GA	3	6	831351	831356	50 %	0 %	50 %	0 %	74311348
17027	NC_007384	A	7	7	831451	831457	100 %	0 %	0 %	0 %	74311348
17028	NC_007384	GGTT	2	8	831569	831576	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
17029	NC_007384	GTA	2	6	831625	831630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17030	NC_007384	TTG	2	6	831666	831671	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17031	NC_007384	CGG	2	6	831737	831742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17032	NC_007384	GATGC	2	10	831901	831910	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
17033	NC_007384	ATA	2	6	831945	831950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17034	NC_007384	ATTT	2	8	832013	832020	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17035	NC_007384	T	6	6	832042	832047	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17036	NC_007384	TGG	2	6	832096	832101	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17037	NC_007384	CG	3	6	832184	832189	0 %	0 %	50 %	50 %	74311349
17038	NC_007384	TCC	2	6	832207	832212	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	74311349
17039	NC_007384	CGG	2	6	832253	832258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74311349
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17041	NC_007384	AGT	2	6	832342	832347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74311349
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17045	NC_007384	ATG	2	6	832522	832527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17046	NC_007384	CGC	2	6	832616	832621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74311350
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17050	NC_007384	CCGGG	2	10	832880	832889	0 %	0 %	60 %	40 %	74311350
17051	NC_007384	TCA	2	6	832900	832905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74311350
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17053	NC_007384	TGGC	2	8	833017	833024	0 %	25 %	50 %	25 %	74311350
17054	NC_007384	CAG	2	6	833044	833049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74311350
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