MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella sonnei Ss046 chromosome

Total Repeats: 97740

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15504	NC_007384	GCT	2	6	754585	754590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74311278
15505	NC_007384	CTG	2	6	754658	754663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74311278
15506	NC_007384	AGAA	2	8	754724	754731	75 %	0 %	25 %	0 %	74311278
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15510	NC_007384	GAT	2	6	754876	754881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74311278
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15537	NC_007384	TTA	2	6	756800	756805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	74311280
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15557	NC_007384	A	6	6	757751	757756	100 %	0 %	0 %	0 %	74311281
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15596	NC_007384	GC	4	8	759697	759704	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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15601	NC_007384	TCCC	2	8	759951	759958	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
15602	NC_007384	CGTC	2	8	759960	759967	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
15603	NC_007384	CTG	2	6	760036	760041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15606	NC_007384	GTG	2	6	760245	760250	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15607	NC_007384	GA	3	6	760253	760258	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15608	NC_007384	T	6	6	760279	760284	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15609	NC_007384	GTT	2	6	760285	760290	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15610	NC_007384	TCC	2	6	760317	760322	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15611	NC_007384	GCC	2	6	760332	760337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15612	NC_007384	TCCT	2	8	760418	760425	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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15620	NC_007384	TGA	2	6	760871	760876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15625	NC_007384	CCA	2	6	761309	761314	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	74311285
15626	NC_007384	GTCTG	2	10	761369	761378	0 %	40 %	40 %	20 %	74311285
15627	NC_007384	TAA	2	6	761477	761482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	74311285
15628	NC_007384	CGT	2	6	761541	761546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74311285
15629	NC_007384	ATC	2	6	761593	761598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74311285
15630	NC_007384	GCT	2	6	761604	761609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74311285
15631	NC_007384	A	7	7	761611	761617	100 %	0 %	0 %	0 %	74311285
15632	NC_007384	CA	3	6	761707	761712	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15633	NC_007384	TTCG	2	8	761740	761747	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
15634	NC_007384	ACCG	2	8	761765	761772	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
15635	NC_007384	A	6	6	761808	761813	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15636	NC_007384	AC	4	8	761834	761841	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15637	NC_007384	TTTGA	2	10	761873	761882	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
15638	NC_007384	GTTT	2	8	761934	761941	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
15639	NC_007384	CAG	2	6	761991	761996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15642	NC_007384	CCGT	2	8	762122	762129	0 %	25 %	25 %	50 %	74311286
15643	NC_007384	AAAAT	2	10	762145	762154	80 %	20 %	0 %	0 %	74311286
15644	NC_007384	TTG	2	6	762175	762180	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	74311286
15645	NC_007384	TTC	2	6	762274	762279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	74311286
15646	NC_007384	GC	3	6	762349	762354	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15647	NC_007384	ACA	2	6	762413	762418	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15648	NC_007384	A	6	6	762418	762423	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15649	NC_007384	CCG	2	6	762425	762430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15650	NC_007384	GA	3	6	762438	762443	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15651	NC_007384	GGGAT	2	10	762507	762516	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
15652	NC_007384	CCCG	2	8	762523	762530	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
15653	NC_007384	TGC	2	6	762683	762688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15655	NC_007384	CTTCT	2	10	762927	762936	0 %	60 %	0 %	40 %	74311287
15656	NC_007384	AC	3	6	763016	763021	50 %	0 %	0 %	50 %	74311287
15657	NC_007384	CTG	2	6	763035	763040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74311287
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15660	NC_007384	CTG	2	6	763164	763169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74311287
15661	NC_007384	CTG	2	6	763201	763206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74311287
15662	NC_007384	GCG	2	6	763228	763233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74311287
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15665	NC_007384	TCACC	2	10	763487	763496	20 %	20 %	0 %	60 %	74311287
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15668	NC_007384	GGT	2	6	763680	763685	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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15674	NC_007384	ACCGC	2	10	763933	763942	20 %	0 %	20 %	60 %	74311288
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15678	NC_007384	CCT	2	6	764180	764185	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15679	NC_007384	GCG	2	6	764274	764279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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15682	NC_007384	TA	3	6	764420	764425	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15683	NC_007384	CAC	2	6	764429	764434	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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15685	NC_007384	TTC	2	6	764556	764561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15686	NC_007384	TCC	2	6	764595	764600	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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15744	NC_007384	CG	3	6	768000	768005	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15745	NC_007384	C	6	6	768023	768028	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
15746	NC_007384	GCA	2	6	768031	768036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15749	NC_007384	A	6	6	768235	768240	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15750	NC_007384	CGG	2	6	768326	768331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15751	NC_007384	ATT	2	6	768339	768344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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