MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella sonnei Ss046 chromosome

Total Repeats: 97740

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_007384	CTTT	2	8	731754	731761	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
15002	NC_007384	TG	3	6	731772	731777	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15003	NC_007384	ATG	2	6	731790	731795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15004	NC_007384	CAAA	2	8	731804	731811	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
15005	NC_007384	ATG	2	6	731887	731892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74311257
15006	NC_007384	CTG	2	6	731983	731988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74311257
15007	NC_007384	GTT	2	6	732060	732065	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	74311257
15008	NC_007384	CTT	2	6	732198	732203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	74311257
15009	NC_007384	TTC	3	9	732229	732237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	74311257
15010	NC_007384	TG	3	6	732269	732274	0 %	50 %	50 %	0 %	74311257
15011	NC_007384	CTGG	2	8	732279	732286	0 %	25 %	50 %	25 %	74311257
15012	NC_007384	CTTCGC	2	12	732525	732536	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	74311257
15013	NC_007384	GCT	2	6	732574	732579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74311257
15014	NC_007384	TCTG	2	8	732582	732589	0 %	50 %	25 %	25 %	74311257
15015	NC_007384	TGA	2	6	732603	732608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74311257
15016	NC_007384	GCT	2	6	732649	732654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74311257
15017	NC_007384	CTG	2	6	732686	732691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74311257
15018	NC_007384	CAT	2	6	732768	732773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74311257
15019	NC_007384	GCA	2	6	732825	732830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74311257
15020	NC_007384	GAA	2	6	732832	732837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	74311257
15021	NC_007384	CT	3	6	732864	732869	0 %	50 %	0 %	50 %	74311257
15022	NC_007384	AAC	2	6	732875	732880	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	74311257
15023	NC_007384	GAA	2	6	732930	732935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	74311257
15024	NC_007384	CTG	3	9	732952	732960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74311257
15025	NC_007384	TGG	2	6	733067	733072	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74311257
15026	NC_007384	ATC	2	6	733096	733101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74311257
15027	NC_007384	CT	3	6	733105	733110	0 %	50 %	0 %	50 %	74311257
15028	NC_007384	A	6	6	733144	733149	100 %	0 %	0 %	0 %	74311257
15029	NC_007384	GC	3	6	733158	733163	0 %	0 %	50 %	50 %	74311257
15030	NC_007384	GCC	2	6	733229	733234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74311257
15031	NC_007384	TGC	2	6	733256	733261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74311257
15032	NC_007384	TCT	2	6	733304	733309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	74311257
15033	NC_007384	TGG	2	6	733346	733351	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74311257
15034	NC_007384	AGC	2	6	733393	733398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74311257
15035	NC_007384	ACT	2	6	733438	733443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74311257
15036	NC_007384	GTC	2	6	733466	733471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15037	NC_007384	TGG	2	6	733504	733509	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74311258
15038	NC_007384	CTG	2	6	733510	733515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74311258
15039	NC_007384	CTG	2	6	733525	733530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74311258
15040	NC_007384	CAC	2	6	733634	733639	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	74311258
15041	NC_007384	GCG	2	6	733676	733681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74311258
15042	NC_007384	TGC	2	6	733689	733694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74311258
15043	NC_007384	GAT	2	6	733740	733745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74311258
15044	NC_007384	TTC	2	6	733765	733770	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	74311258
15045	NC_007384	CGGT	2	8	733775	733782	0 %	25 %	50 %	25 %	74311258
15046	NC_007384	GAA	2	6	733804	733809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	74311258
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15051	NC_007384	CTG	2	6	733981	733986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74311258
15052	NC_007384	GTG	2	6	733993	733998	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74311258
15053	NC_007384	GAT	2	6	734007	734012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74311258
15054	NC_007384	CTGG	2	8	734122	734129	0 %	25 %	50 %	25 %	74311258
15055	NC_007384	AAG	2	6	734210	734215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	74311258
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15058	NC_007384	GCT	2	6	734301	734306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74311258
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15060	NC_007384	CAT	2	6	734376	734381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74311258
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15063	NC_007384	GGT	2	6	734505	734510	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74311258
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15065	NC_007384	CT	3	6	734601	734606	0 %	50 %	0 %	50 %	74311258
15066	NC_007384	TAAG	2	8	734611	734618	50 %	25 %	25 %	0 %	74311258
15067	NC_007384	CTT	2	6	734658	734663	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15068	NC_007384	AAG	2	6	734728	734733	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15069	NC_007384	TGA	2	6	734739	734744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74311259
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15075	NC_007384	CG	4	8	735123	735130	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15076	NC_007384	TAG	2	6	735133	735138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15077	NC_007384	TTG	2	6	735161	735166	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15082	NC_007384	TGC	2	6	735299	735304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74311260
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15084	NC_007384	TCAG	2	8	735317	735324	25 %	25 %	25 %	25 %	74311260
15085	NC_007384	CGA	2	6	735399	735404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74311260
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15089	NC_007384	TTGATT	2	12	735648	735659	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	74311261
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15093	NC_007384	TCTGG	2	10	735751	735760	0 %	40 %	40 %	20 %	74311261
15094	NC_007384	CT	3	6	735768	735773	0 %	50 %	0 %	50 %	74311261
15095	NC_007384	AG	3	6	735785	735790	50 %	0 %	50 %	0 %	74311261
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15099	NC_007384	CAA	2	6	736265	736270	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	74311261
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15101	NC_007384	CTG	2	6	736353	736358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74311262
15102	NC_007384	CAT	2	6	736391	736396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74311262
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15105	NC_007384	ACC	2	6	736538	736543	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	74311262
15106	NC_007384	GGT	2	6	736550	736555	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74311262
15107	NC_007384	AAT	2	6	736637	736642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	74311262
15108	NC_007384	GGTT	2	8	736682	736689	0 %	50 %	50 %	0 %	74311262
15109	NC_007384	CTTG	2	8	736724	736731	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
15110	NC_007384	AG	3	6	736734	736739	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15111	NC_007384	ATT	2	6	736819	736824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	74311263
15112	NC_007384	CAG	2	6	736826	736831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74311263
15113	NC_007384	TGC	2	6	736832	736837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74311263
15114	NC_007384	GCG	2	6	736852	736857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74311263
15115	NC_007384	GTTC	2	8	736868	736875	0 %	50 %	25 %	25 %	74311263
15116	NC_007384	GGC	2	6	736903	736908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74311263
15117	NC_007384	GGT	2	6	736909	736914	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74311263
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15122	NC_007384	GCT	2	6	737107	737112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74311263
15123	NC_007384	GAA	2	6	737134	737139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	74311263
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15241	NC_007384	A	6	6	741726	741731	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15242	NC_007384	T	6	6	741747	741752	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15243	NC_007384	TGA	2	6	741788	741793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15484	NC_007384	GCA	2	6	753548	753553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74311277
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15492	NC_007384	ATG	2	6	753988	753993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74311277
15493	NC_007384	CAT	2	6	753995	754000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74311277
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