MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella sonnei Ss046 chromosome

Total Repeats: 97740

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_007384	GCT	2	6	49242	49247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74310659
1002	NC_007384	TAA	2	6	49250	49255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	74310659
1003	NC_007384	TAC	2	6	49262	49267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74310659
1004	NC_007384	TG	3	6	49411	49416	0 %	50 %	50 %	0 %	74310659
1005	NC_007384	CCCG	2	8	49440	49447	0 %	0 %	25 %	75 %	74310659
1006	NC_007384	TCCA	2	8	49492	49499	25 %	25 %	0 %	50 %	74310659
1007	NC_007384	CGG	2	6	49502	49507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74310659
1008	NC_007384	ACC	2	6	49533	49538	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	74310659
1009	NC_007384	CAG	2	6	49554	49559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74310659
1010	NC_007384	TCA	2	6	49696	49701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74310659
1011	NC_007384	TTAAA	2	10	49703	49712	60 %	40 %	0 %	0 %	74310659
1012	NC_007384	TTAA	2	8	49745	49752	50 %	50 %	0 %	0 %	74310660
1013	NC_007384	TAA	2	6	49778	49783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	74310660
1014	NC_007384	GAA	2	6	49809	49814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	74310660
1015	NC_007384	TCC	2	6	49824	49829	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	74310660
1016	NC_007384	GCC	2	6	49860	49865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74310660
1017	NC_007384	CAG	2	6	49872	49877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74310660
1018	NC_007384	CAG	2	6	49923	49928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74310660
1019	NC_007384	GGT	2	6	49930	49935	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74310660
1020	NC_007384	GAA	2	6	50028	50033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	74310660
1021	NC_007384	TGG	2	6	50042	50047	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74310660
1022	NC_007384	ATG	2	6	50080	50085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74310660
1023	NC_007384	GC	4	8	50086	50093	0 %	0 %	50 %	50 %	74310660
1024	NC_007384	TGA	2	6	50126	50131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74310660
1025	NC_007384	TATC	2	8	50138	50145	25 %	50 %	0 %	25 %	74310660
1026	NC_007384	CAG	2	6	50148	50153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74310660
1027	NC_007384	TAC	2	6	50159	50164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74310660
1028	NC_007384	CACC	2	8	50289	50296	25 %	0 %	0 %	75 %	74310660
1029	NC_007384	GCC	2	6	50331	50336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74310660
1030	NC_007384	AAC	2	6	50359	50364	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	74310660
1031	NC_007384	AGT	2	6	50408	50413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74310660
1032	NC_007384	ATG	2	6	50416	50421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74310660
1033	NC_007384	ACCCA	2	10	50446	50455	40 %	0 %	0 %	60 %	74310660
1034	NC_007384	CAG	2	6	50548	50553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74310660
1035	NC_007384	ATG	2	6	50557	50562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74310660
1036	NC_007384	AAC	2	6	50596	50601	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	74310660
1037	NC_007384	GCG	2	6	50624	50629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74310660
1038	NC_007384	CGA	2	6	50669	50674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74310660
1039	NC_007384	CGA	2	6	50687	50692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74310660
1040	NC_007384	AAC	2	6	50701	50706	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	74310660
1041	NC_007384	AGA	2	6	50780	50785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	74310660
1042	NC_007384	AGCC	2	8	50856	50863	25 %	0 %	25 %	50 %	74310660
1043	NC_007384	CGG	2	6	50904	50909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74310660
1044	NC_007384	GTA	3	9	50919	50927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74310660
1045	NC_007384	GCA	2	6	50956	50961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74310660
1046	NC_007384	AGG	2	6	50969	50974	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	74310660
1047	NC_007384	CAT	2	6	50979	50984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74310660
1048	NC_007384	GGT	2	6	51013	51018	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74310660
1049	NC_007384	CCAG	2	8	51056	51063	25 %	0 %	25 %	50 %	74310660
1050	NC_007384	AACC	2	8	51064	51071	50 %	0 %	0 %	50 %	74310660
1051	NC_007384	CAC	2	6	51081	51086	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	74310660
1052	NC_007384	TAA	2	6	51143	51148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	74310660
1053	NC_007384	CAA	2	6	51184	51189	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	74310660
1054	NC_007384	CGA	2	6	51197	51202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74310660
1055	NC_007384	TTA	2	6	51203	51208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	74310660
1056	NC_007384	CGG	2	6	51210	51215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74310660
1057	NC_007384	TTC	2	6	51256	51261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	74310660
1058	NC_007384	ATTT	2	8	51290	51297	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_007384	GTTT	2	8	51307	51314	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_007384	ATT	3	9	51338	51346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_007384	T	9	9	51419	51427	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_007384	ATT	2	6	51463	51468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_007384	TGT	2	6	51482	51487	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_007384	A	7	7	51497	51503	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_007384	T	6	6	51555	51560	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_007384	ACC	2	6	51692	51697	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1067	NC_007384	ATT	2	6	51743	51748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161986600
1068	NC_007384	GTGC	2	8	51760	51767	0 %	25 %	50 %	25 %	161986600
1069	NC_007384	TGA	2	6	51769	51774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161986600
1070	NC_007384	AAT	2	6	51791	51796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161986600
1071	NC_007384	GCA	2	6	51890	51895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161986600
1072	NC_007384	CG	3	6	51969	51974	0 %	0 %	50 %	50 %	161986600
1073	NC_007384	TGAT	2	8	51996	52003	25 %	50 %	25 %	0 %	161986600
1074	NC_007384	CAA	2	6	52028	52033	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161986600
1075	NC_007384	GCC	2	6	52055	52060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161986600
1076	NC_007384	TTTGA	2	10	52073	52082	20 %	60 %	20 %	0 %	161986600
1077	NC_007384	TTC	2	6	52099	52104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161986600
1078	NC_007384	CAG	2	6	52118	52123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161986600
1079	NC_007384	CTG	2	6	52130	52135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161986600
1080	NC_007384	GAAACC	2	12	52232	52243	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	161986600
1081	NC_007384	CTGC	2	8	52256	52263	0 %	25 %	25 %	50 %	161986600
1082	NC_007384	GTT	2	6	52265	52270	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161986600
1083	NC_007384	CGGCG	2	10	52324	52333	0 %	0 %	60 %	40 %	161986600
1084	NC_007384	CGG	3	9	52356	52364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161986600
1085	NC_007384	AAC	2	6	52398	52403	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161986600
1086	NC_007384	GAA	2	6	52460	52465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161986600
1087	NC_007384	CGC	2	6	52471	52476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161986600
1088	NC_007384	TGA	2	6	52580	52585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74310662
1089	NC_007384	AATCA	2	10	52606	52615	60 %	20 %	0 %	20 %	74310662
1090	NC_007384	ATG	2	6	52631	52636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74310662
1091	NC_007384	GAT	2	6	52707	52712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74310662
1092	NC_007384	TGC	3	9	52772	52780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74310662
1093	NC_007384	GGC	2	6	52806	52811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74310662
1094	NC_007384	GCG	2	6	52834	52839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74310662
1095	NC_007384	GGT	2	6	52906	52911	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74310662
1096	NC_007384	GAA	2	6	52924	52929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	74310662
1097	NC_007384	CAG	2	6	52962	52967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74310662
1098	NC_007384	GC	3	6	53071	53076	0 %	0 %	50 %	50 %	74310662
1099	NC_007384	TGG	2	6	53111	53116	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74310662
1100	NC_007384	GTCG	2	8	53122	53129	0 %	25 %	50 %	25 %	74310662
1101	NC_007384	GCA	2	6	53138	53143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74310662
1102	NC_007384	ATGG	2	8	53229	53236	25 %	25 %	50 %	0 %	74310662
1103	NC_007384	TGGT	2	8	53324	53331	0 %	50 %	50 %	0 %	74310662
1104	NC_007384	TTG	2	6	53408	53413	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	74310662
1105	NC_007384	CAT	2	6	53537	53542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74310663
1106	NC_007384	CGGTT	2	10	53561	53570	0 %	40 %	40 %	20 %	74310663
1107	NC_007384	GTTA	2	8	53606	53613	25 %	50 %	25 %	0 %	74310663
1108	NC_007384	CGG	2	6	53651	53656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74310663
1109	NC_007384	ATT	2	6	53685	53690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	74310663
1110	NC_007384	ACT	2	6	53779	53784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74310663
1111	NC_007384	GAA	2	6	53868	53873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	74310663
1112	NC_007384	GC	3	6	53878	53883	0 %	0 %	50 %	50 %	74310663
1113	NC_007384	GTC	2	6	53934	53939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74310663
1114	NC_007384	CACC	2	8	54157	54164	25 %	0 %	0 %	75 %	74310663
1115	NC_007384	GCG	2	6	54178	54183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74310663
1116	NC_007384	CAT	2	6	54237	54242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74310663
1117	NC_007384	A	7	7	54254	54260	100 %	0 %	0 %	0 %	74310663
1118	NC_007384	GGC	2	6	54321	54326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74310663
1119	NC_007384	TGG	2	6	54331	54336	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74310663
1120	NC_007384	TGC	2	6	54376	54381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74310663
1121	NC_007384	GTTG	2	8	54386	54393	0 %	50 %	50 %	0 %	74310663
1122	NC_007384	ATTG	2	8	54404	54411	25 %	50 %	25 %	0 %	74310663
1123	NC_007384	GCC	2	6	54420	54425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74310663
1124	NC_007384	GCC	2	6	54477	54482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74310663
1125	NC_007384	GCA	2	6	54492	54497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74310663
1126	NC_007384	CGA	2	6	54524	54529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74310663
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1128	NC_007384	TCC	2	6	54727	54732	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	74310663
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1258	NC_007384	CAG	2	6	60346	60351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74310668
1259	NC_007384	CG	4	8	60435	60442	0 %	0 %	50 %	50 %	74310668
1260	NC_007384	GCA	2	6	60498	60503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74310668
1261	NC_007384	AAC	2	6	60522	60527	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	74310668
1262	NC_007384	AATG	2	8	60567	60574	50 %	25 %	25 %	0 %	74310669
1263	NC_007384	GCCATT	2	12	60772	60783	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	74310669
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1266	NC_007384	AC	3	6	60919	60924	50 %	0 %	0 %	50 %	74310669
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1282	NC_007384	AAT	2	6	62072	62077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	74310671
1283	NC_007384	CGT	2	6	62258	62263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74310671
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1293	NC_007384	CGG	2	6	62707	62712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74310671
1294	NC_007384	GTT	2	6	62787	62792	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	74310672
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1296	NC_007384	TTC	2	6	62812	62817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	74310672
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1300	NC_007384	GCA	2	6	63071	63076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74310672
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1374	NC_007384	CAT	2	6	66464	66469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1375	NC_007384	GTG	2	6	66554	66559	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1376	NC_007384	GT	3	6	66679	66684	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1380	NC_007384	T	6	6	66859	66864	0 %	100 %	0 %	0 %	74310674
1381	NC_007384	CCA	2	6	66866	66871	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	74310674
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