MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella sonnei Ss046 chromosome

Total Repeats: 97740

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_007384	TAA	3	9	682351	682359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14002	NC_007384	GGCCG	2	10	682446	682455	0 %	0 %	60 %	40 %	74311219
14003	NC_007384	TTG	2	6	682578	682583	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	74311219
14004	NC_007384	AGC	2	6	682584	682589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74311219
14005	NC_007384	CAG	2	6	682595	682600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74311219
14006	NC_007384	GGC	2	6	682655	682660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74311219
14007	NC_007384	GCG	2	6	682704	682709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74311219
14008	NC_007384	GGC	2	6	682720	682725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74311219
14009	NC_007384	ATC	2	6	682784	682789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74311219
14010	NC_007384	GCG	2	6	682806	682811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74311219
14011	NC_007384	CT	3	6	682821	682826	0 %	50 %	0 %	50 %	74311219
14012	NC_007384	TGCG	2	8	682831	682838	0 %	25 %	50 %	25 %	74311219
14013	NC_007384	CACCGG	2	12	682850	682861	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	74311219
14014	NC_007384	AAT	2	6	682925	682930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	74311219
14015	NC_007384	CGA	2	6	683031	683036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74311219
14016	NC_007384	CAA	2	6	683053	683058	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	74311219
14017	NC_007384	CAC	2	6	683139	683144	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	74311220
14018	NC_007384	CGGT	2	8	683149	683156	0 %	25 %	50 %	25 %	74311220
14019	NC_007384	GCC	2	6	683173	683178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74311220
14020	NC_007384	CCG	2	6	683232	683237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74311220
14021	NC_007384	CCTGG	2	10	683280	683289	0 %	20 %	40 %	40 %	74311220
14022	NC_007384	CAG	2	6	683398	683403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74311220
14023	NC_007384	CGA	2	6	683482	683487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74311220
14024	NC_007384	GC	3	6	683511	683516	0 %	0 %	50 %	50 %	74311220
14025	NC_007384	ACT	2	6	683522	683527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74311220
14026	NC_007384	TTC	2	6	683549	683554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	74311220
14027	NC_007384	GCC	2	6	683563	683568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74311220
14028	NC_007384	ATT	2	6	683596	683601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	74311220
14029	NC_007384	CTGGC	2	10	683642	683651	0 %	20 %	40 %	40 %	74311220
14030	NC_007384	GCG	2	6	683721	683726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74311220
14031	NC_007384	CAG	2	6	683752	683757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74311220
14032	NC_007384	TTC	2	6	683800	683805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	74311220
14033	NC_007384	CAG	2	6	683863	683868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74311220
14034	NC_007384	GCT	2	6	683871	683876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74311220
14035	NC_007384	ATC	2	6	683885	683890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74311220
14036	NC_007384	CCA	4	12	683913	683924	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	74311220
14037	NC_007384	CGC	2	6	683940	683945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74311220
14038	NC_007384	GGTAC	2	10	683964	683973	20 %	20 %	40 %	20 %	74311220
14039	NC_007384	GCCCGC	2	12	683992	684003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74311220
14040	NC_007384	AGGC	2	8	684004	684011	25 %	0 %	50 %	25 %	74311220
14041	NC_007384	CAA	2	6	684103	684108	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	74311220
14042	NC_007384	TGG	2	6	684153	684158	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74311220
14043	NC_007384	ACGC	2	8	684259	684266	25 %	0 %	25 %	50 %	74311220
14044	NC_007384	CAG	2	6	684267	684272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74311220
14045	NC_007384	CAG	2	6	684319	684324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74311220
14046	NC_007384	A	6	6	684367	684372	100 %	0 %	0 %	0 %	74311220
14047	NC_007384	CAC	2	6	684385	684390	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	74311220
14048	NC_007384	ACC	2	6	684407	684412	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	74311220
14049	NC_007384	CCA	4	12	684438	684449	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	74311220
14050	NC_007384	GGC	2	6	684478	684483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74311220
14051	NC_007384	CGG	2	6	684537	684542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74311220
14052	NC_007384	GTT	2	6	684604	684609	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	74311220
14053	NC_007384	GCGG	2	8	684616	684623	0 %	0 %	75 %	25 %	74311220
14054	NC_007384	TCA	2	6	684629	684634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74311220
14055	NC_007384	GC	3	6	684670	684675	0 %	0 %	50 %	50 %	74311220
14056	NC_007384	CCA	2	6	684703	684708	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	74311220
14057	NC_007384	GCG	2	6	684709	684714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74311220
14058	NC_007384	AAT	2	6	684733	684738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	74311220
14059	NC_007384	ACG	2	6	684856	684861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74311220
14060	NC_007384	T	6	6	684862	684867	0 %	100 %	0 %	0 %	74311220
14061	NC_007384	GCAGG	2	10	684882	684891	20 %	0 %	60 %	20 %	74311220
14062	NC_007384	GCCGC	2	10	684939	684948	0 %	0 %	40 %	60 %	74311220
14063	NC_007384	CG	3	6	684949	684954	0 %	0 %	50 %	50 %	74311220
14064	NC_007384	TCGCG	2	10	684999	685008	0 %	20 %	40 %	40 %	74311220
14065	NC_007384	GC	3	6	685049	685054	0 %	0 %	50 %	50 %	74311220
14066	NC_007384	TCA	2	6	685061	685066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74311220
14067	NC_007384	A	6	6	685127	685132	100 %	0 %	0 %	0 %	74311220
14068	NC_007384	GC	3	6	685142	685147	0 %	0 %	50 %	50 %	74311220
14069	NC_007384	CTT	2	6	685176	685181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	74311220
14070	NC_007384	CCA	2	6	685215	685220	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	74311220
14071	NC_007384	CGT	2	6	685227	685232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74311220
14072	NC_007384	CGG	2	6	685233	685238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74311220
14073	NC_007384	A	6	6	685244	685249	100 %	0 %	0 %	0 %	74311220
14074	NC_007384	CGC	2	6	685287	685292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74311220
14075	NC_007384	CAT	2	6	685299	685304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74311220
14076	NC_007384	CAG	2	6	685360	685365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74311220
14077	NC_007384	CGG	2	6	685451	685456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74311220
14078	NC_007384	GGC	2	6	685462	685467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74311220
14079	NC_007384	GCC	2	6	685491	685496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74311220
14080	NC_007384	GGC	2	6	685517	685522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74311220
14081	NC_007384	CAGC	2	8	685527	685534	25 %	0 %	25 %	50 %	74311220
14082	NC_007384	GCG	2	6	685547	685552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74311220
14083	NC_007384	GAA	2	6	685669	685674	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	74311220
14084	NC_007384	GCG	2	6	685695	685700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74311220
14085	NC_007384	CAG	2	6	685714	685719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74311220
14086	NC_007384	TCA	2	6	685752	685757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74311220
14087	NC_007384	GAC	2	6	685793	685798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74311221
14088	NC_007384	AT	3	6	685809	685814	50 %	50 %	0 %	0 %	74311221
14089	NC_007384	GTT	2	6	685825	685830	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	74311221
14090	NC_007384	GCC	2	6	685908	685913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74311221
14091	NC_007384	ATT	2	6	685928	685933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	74311221
14092	NC_007384	GCA	2	6	686010	686015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74311221
14093	NC_007384	ACC	2	6	686221	686226	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	74311221
14094	NC_007384	GGT	2	6	686240	686245	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74311221
14095	NC_007384	CAG	2	6	686246	686251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74311221
14096	NC_007384	CGC	2	6	686260	686265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74311221
14097	NC_007384	CAG	2	6	686350	686355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74311222
14098	NC_007384	CAG	2	6	686389	686394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74311222
14099	NC_007384	CCCA	2	8	686395	686402	25 %	0 %	0 %	75 %	74311222
14100	NC_007384	ATG	2	6	686555	686560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74311222
14101	NC_007384	CGC	2	6	686596	686601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74311222
14102	NC_007384	AAT	2	6	686605	686610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	74311222
14103	NC_007384	GGT	2	6	686647	686652	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74311222
14104	NC_007384	TCA	2	6	686667	686672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74311222
14105	NC_007384	CAC	2	6	686692	686697	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	74311222
14106	NC_007384	CCA	2	6	686730	686735	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	74311222
14107	NC_007384	CGC	2	6	686752	686757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74311222
14108	NC_007384	CTGC	2	8	686790	686797	0 %	25 %	25 %	50 %	74311222
14109	NC_007384	ATC	2	6	686911	686916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74311222
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14111	NC_007384	ATC	2	6	686969	686974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74311222
14112	NC_007384	CCA	4	12	687075	687086	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	74311222
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14117	NC_007384	TCA	2	6	687344	687349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74311222
14118	NC_007384	GCG	2	6	687368	687373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74311222
14119	NC_007384	CAGC	2	8	687375	687382	25 %	0 %	25 %	50 %	74311222
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14121	NC_007384	AACGTC	2	12	687469	687480	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	74311222
14122	NC_007384	TGG	2	6	687507	687512	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74311222
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14229	NC_007384	GGTC	2	8	692945	692952	0 %	25 %	50 %	25 %	74311227
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14237	NC_007384	GGT	2	6	693155	693160	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74311227
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14240	NC_007384	CTG	2	6	693318	693323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74311227
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14245	NC_007384	AAAC	2	8	693465	693472	75 %	0 %	0 %	25 %	74311228
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14367	NC_007384	CTA	2	6	699390	699395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74311231
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14370	NC_007384	TCA	2	6	699531	699536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74311231
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14408	NC_007384	AT	3	6	701874	701879	50 %	50 %	0 %	0 %	74311234
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14491	NC_007384	GCT	2	6	705427	705432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74311237
14492	NC_007384	CAC	2	6	705580	705585	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	74311237
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