MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella sonnei Ss046 chromosome

Total Repeats: 97740

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_007384	T	7	7	659241	659247	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13502	NC_007384	ATT	2	6	659380	659385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13503	NC_007384	T	6	6	659398	659403	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13504	NC_007384	CAA	2	6	659452	659457	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13505	NC_007384	TGG	3	9	659458	659466	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13506	NC_007384	TGA	2	6	659497	659502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13507	NC_007384	CAA	2	6	659558	659563	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13508	NC_007384	CTTA	2	8	659616	659623	25 %	50 %	0 %	25 %	74311201
13509	NC_007384	GAA	2	6	659708	659713	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	74311201
13510	NC_007384	GACG	2	8	659719	659726	25 %	0 %	50 %	25 %	74311201
13511	NC_007384	GCC	2	6	659728	659733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74311201
13512	NC_007384	GCAC	2	8	659736	659743	25 %	0 %	25 %	50 %	74311201
13513	NC_007384	GCG	2	6	659747	659752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74311201
13514	NC_007384	TTC	2	6	659770	659775	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	74311201
13515	NC_007384	CTT	2	6	659799	659804	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	74311201
13516	NC_007384	GAAGCG	2	12	659827	659838	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	74311201
13517	NC_007384	CTG	2	6	659866	659871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74311201
13518	NC_007384	CGC	2	6	659872	659877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74311201
13519	NC_007384	CTT	2	6	659880	659885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	74311201
13520	NC_007384	GCC	2	6	659937	659942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74311201
13521	NC_007384	T	6	6	660058	660063	0 %	100 %	0 %	0 %	74311201
13522	NC_007384	GGAAC	2	10	660069	660078	40 %	0 %	40 %	20 %	74311201
13523	NC_007384	GC	5	10	660116	660125	0 %	0 %	50 %	50 %	74311201
13524	NC_007384	CATA	2	8	660129	660136	50 %	25 %	0 %	25 %	74311201
13525	NC_007384	CAG	2	6	660145	660150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74311201
13526	NC_007384	TCA	2	6	660224	660229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74311201
13527	NC_007384	CAT	2	6	660321	660326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74311201
13528	NC_007384	AGTGA	2	10	660379	660388	40 %	20 %	40 %	0 %	74311201
13529	NC_007384	GCT	2	6	660431	660436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74311201
13530	NC_007384	CCA	2	6	660487	660492	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	74311201
13531	NC_007384	AAT	2	6	660553	660558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	74311201
13532	NC_007384	ACC	2	6	660571	660576	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	74311201
13533	NC_007384	AGC	2	6	660581	660586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74311201
13534	NC_007384	GAT	2	6	660702	660707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74311201
13535	NC_007384	CCG	2	6	660750	660755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74311201
13536	NC_007384	ATTTC	2	10	660792	660801	20 %	60 %	0 %	20 %	74311201
13537	NC_007384	GAT	2	6	660850	660855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74311201
13538	NC_007384	GGCAAA	2	12	660907	660918	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	74311201
13539	NC_007384	GTC	2	6	660931	660936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74311201
13540	NC_007384	GC	3	6	661025	661030	0 %	0 %	50 %	50 %	74311201
13541	NC_007384	TGG	2	6	661037	661042	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74311201
13542	NC_007384	T	6	6	661077	661082	0 %	100 %	0 %	0 %	74311201
13543	NC_007384	GTTG	2	8	661083	661090	0 %	50 %	50 %	0 %	74311201
13544	NC_007384	AG	3	6	661092	661097	50 %	0 %	50 %	0 %	74311201
13545	NC_007384	CAA	2	6	661119	661124	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	74311201
13546	NC_007384	GCT	2	6	661230	661235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74311201
13547	NC_007384	TTG	2	6	661312	661317	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13548	NC_007384	A	7	7	661331	661337	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13549	NC_007384	AGC	2	6	661346	661351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13550	NC_007384	A	6	6	661377	661382	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13551	NC_007384	A	6	6	661384	661389	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13552	NC_007384	TATT	2	8	661437	661444	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13553	NC_007384	TGC	2	6	661506	661511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13554	NC_007384	ATG	2	6	661531	661536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13555	NC_007384	CCT	2	6	661581	661586	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13556	NC_007384	GTG	2	6	661604	661609	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13557	NC_007384	A	6	6	661807	661812	100 %	0 %	0 %	0 %	74311202
13558	NC_007384	CGGT	2	8	661822	661829	0 %	25 %	50 %	25 %	74311202
13559	NC_007384	GCTG	2	8	661919	661926	0 %	25 %	50 %	25 %	74311202
13560	NC_007384	GTT	2	6	661957	661962	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	74311202
13561	NC_007384	CTG	2	6	662014	662019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74311202
13562	NC_007384	GTG	2	6	662032	662037	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74311202
13563	NC_007384	TGGC	2	8	662052	662059	0 %	25 %	50 %	25 %	74311202
13564	NC_007384	GCA	2	6	662148	662153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74311202
13565	NC_007384	GCG	2	6	662313	662318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13566	NC_007384	AT	3	6	662357	662362	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13567	NC_007384	TCA	2	6	662417	662422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13568	NC_007384	GTGG	2	8	662444	662451	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
13569	NC_007384	TCG	2	6	662522	662527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74311203
13570	NC_007384	CCTG	2	8	662567	662574	0 %	25 %	25 %	50 %	74311203
13571	NC_007384	TTC	2	6	662623	662628	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	74311203
13572	NC_007384	TGC	2	6	662653	662658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74311203
13573	NC_007384	GAT	2	6	662662	662667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74311203
13574	NC_007384	GGGCT	2	10	662672	662681	0 %	20 %	60 %	20 %	74311203
13575	NC_007384	CA	3	6	662727	662732	50 %	0 %	0 %	50 %	74311203
13576	NC_007384	TGG	2	6	662778	662783	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74311203
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13578	NC_007384	CAT	2	6	662827	662832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74311203
13579	NC_007384	CAA	2	6	662859	662864	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	74311203
13580	NC_007384	CAC	2	6	662938	662943	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	74311203
13581	NC_007384	CGG	2	6	662979	662984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74311203
13582	NC_007384	ACA	2	6	663226	663231	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13583	NC_007384	ACC	2	6	663355	663360	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	74311204
13584	NC_007384	AGC	2	6	663421	663426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74311204
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13589	NC_007384	GGC	2	6	663666	663671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74311204
13590	NC_007384	AGT	2	6	663860	663865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74311204
13591	NC_007384	CGCCAG	2	12	663870	663881	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	74311204
13592	NC_007384	TTC	2	6	663924	663929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	74311204
13593	NC_007384	CAA	2	6	664001	664006	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	74311204
13594	NC_007384	TTC	2	6	664137	664142	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	74311204
13595	NC_007384	TGC	2	6	664154	664159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74311204
13596	NC_007384	TGG	2	6	664178	664183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74311204
13597	NC_007384	CGT	2	6	664184	664189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74311204
13598	NC_007384	GAC	2	6	664190	664195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74311204
13599	NC_007384	GCG	2	6	664251	664256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74311204
13600	NC_007384	CTG	2	6	664272	664277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74311204
13601	NC_007384	CTT	2	6	664283	664288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	74311204
13602	NC_007384	CCG	2	6	664409	664414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74311204
13603	NC_007384	GCG	2	6	664572	664577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74311205
13604	NC_007384	GCA	2	6	664636	664641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74311205
13605	NC_007384	ACGC	2	8	664679	664686	25 %	0 %	25 %	50 %	74311205
13606	NC_007384	CA	3	6	664733	664738	50 %	0 %	0 %	50 %	74311205
13607	NC_007384	GTA	2	6	664751	664756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74311205
13608	NC_007384	CTG	2	6	664798	664803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74311205
13609	NC_007384	ATA	2	6	664896	664901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	74311205
13610	NC_007384	TCG	2	6	664920	664925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74311205
13611	NC_007384	CGCC	2	8	664933	664940	0 %	0 %	25 %	75 %	74311205
13612	NC_007384	CG	3	6	665006	665011	0 %	0 %	50 %	50 %	74311205
13613	NC_007384	CTT	2	6	665026	665031	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	74311205
13614	NC_007384	TGA	2	6	665089	665094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74311205
13615	NC_007384	CA	3	6	665152	665157	50 %	0 %	0 %	50 %	74311205
13616	NC_007384	T	7	7	665213	665219	0 %	100 %	0 %	0 %	74311205
13617	NC_007384	TCA	2	6	665311	665316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74311205
13618	NC_007384	TGG	2	6	665326	665331	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74311205
13619	NC_007384	TAGT	2	8	665349	665356	25 %	50 %	25 %	0 %	74311205
13620	NC_007384	CGC	3	9	665437	665445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74311205
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13622	NC_007384	GTT	2	6	665503	665508	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	74311205
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13993	NC_007384	TTTACC	2	12	682122	682133	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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13995	NC_007384	CAA	2	6	682200	682205	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13996	NC_007384	A	6	6	682204	682209	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13997	NC_007384	ATA	2	6	682224	682229	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13998	NC_007384	ATTA	2	8	682234	682241	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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