MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella sonnei Ss046 chromosome

Total Repeats: 97740

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13002	NC_007384	T	6	6	635629	635634	0 %	100 %	0 %	0 %	74311178
13003	NC_007384	GAA	2	6	635647	635652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	74311178
13004	NC_007384	GTA	2	6	635668	635673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74311178
13005	NC_007384	TGT	2	6	635754	635759	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	74311178
13006	NC_007384	GTT	2	6	635785	635790	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	74311178
13007	NC_007384	CCG	2	6	635796	635801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74311178
13008	NC_007384	GCAG	2	8	635810	635817	25 %	0 %	50 %	25 %	74311178
13009	NC_007384	TACG	2	8	635904	635911	25 %	25 %	25 %	25 %	74311178
13010	NC_007384	GGT	2	6	636114	636119	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13011	NC_007384	GCATA	2	10	636131	636140	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
13012	NC_007384	ATG	2	6	636188	636193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13013	NC_007384	ATT	2	6	636199	636204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13014	NC_007384	AGCAA	2	10	636238	636247	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
13015	NC_007384	TAT	3	9	636263	636271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13016	NC_007384	TGG	2	6	636386	636391	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74311179
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13018	NC_007384	TAA	2	6	636410	636415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	74311179
13019	NC_007384	AG	3	6	636501	636506	50 %	0 %	50 %	0 %	74311179
13020	NC_007384	AGA	2	6	636513	636518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	74311179
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13022	NC_007384	ATC	2	6	636626	636631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74311179
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13024	NC_007384	CTGA	2	8	636883	636890	25 %	25 %	25 %	25 %	74311180
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13026	NC_007384	GCTT	2	8	637151	637158	0 %	50 %	25 %	25 %	74311180
13027	NC_007384	CTG	2	6	637228	637233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74311180
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13037	NC_007384	GCA	2	6	637807	637812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74311180
13038	NC_007384	ATATT	2	10	637860	637869	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
13039	NC_007384	TAT	2	6	637909	637914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13040	NC_007384	CATT	2	8	637961	637968	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13041	NC_007384	AATG	2	8	637970	637977	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13042	NC_007384	A	6	6	638010	638015	100 %	0 %	0 %	0 %	74311181
13043	NC_007384	AATG	2	8	638051	638058	50 %	25 %	25 %	0 %	74311181
13044	NC_007384	T	6	6	638105	638110	0 %	100 %	0 %	0 %	74311181
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13047	NC_007384	TGA	2	6	638143	638148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74311181
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13059	NC_007384	TGA	2	6	638611	638616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74311181
13060	NC_007384	CCG	2	6	638754	638759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74311182
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13096	NC_007384	TGAGCA	2	12	640274	640285	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	74311183
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13102	NC_007384	TGC	2	6	640642	640647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74311183
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13104	NC_007384	T	6	6	640678	640683	0 %	100 %	0 %	0 %	74311183
13105	NC_007384	TG	3	6	640689	640694	0 %	50 %	50 %	0 %	74311183
13106	NC_007384	TCA	2	6	640739	640744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13107	NC_007384	ATA	2	6	640745	640750	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13108	NC_007384	A	6	6	640750	640755	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13109	NC_007384	ATT	2	6	640780	640785	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13110	NC_007384	A	6	6	640786	640791	100 %	0 %	0 %	0 %	74311184
13111	NC_007384	GAA	2	6	640800	640805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	74311184
13112	NC_007384	TCT	2	6	640811	640816	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	74311184
13113	NC_007384	TC	3	6	640910	640915	0 %	50 %	0 %	50 %	74311184
13114	NC_007384	ATC	2	6	640916	640921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74311184
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13119	NC_007384	TGG	2	6	641057	641062	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74311184
13120	NC_007384	GA	3	6	641067	641072	50 %	0 %	50 %	0 %	74311184
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13122	NC_007384	GAA	2	6	641199	641204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	74311184
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13124	NC_007384	TCT	2	6	641310	641315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	74311184
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13363	NC_007384	AAT	2	6	653065	653070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	74311194
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13367	NC_007384	GAC	2	6	653262	653267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74311194
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13491	NC_007384	ACG	2	6	658777	658782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13492	NC_007384	CAT	2	6	658802	658807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13493	NC_007384	TTC	2	6	658853	658858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13494	NC_007384	CGGT	2	8	658941	658948	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13495	NC_007384	GAA	2	6	658962	658967	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13496	NC_007384	GCG	2	6	659103	659108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13497	NC_007384	A	6	6	659153	659158	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13498	NC_007384	TGG	2	6	659161	659166	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13499	NC_007384	ACG	2	6	659169	659174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13500	NC_007384	CAT	2	6	659194	659199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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