MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella sonnei Ss046 chromosome

Total Repeats: 97740

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12502	NC_007384	CAGC	2	8	611044	611051	25 %	0 %	25 %	50 %	74311153
12503	NC_007384	T	6	6	611158	611163	0 %	100 %	0 %	0 %	74311153
12504	NC_007384	CAC	2	6	611361	611366	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12505	NC_007384	AGG	2	6	611384	611389	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12506	NC_007384	CAT	2	6	611434	611439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12507	NC_007384	GCA	2	6	611459	611464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12508	NC_007384	TAA	2	6	611515	611520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12509	NC_007384	T	7	7	611584	611590	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12510	NC_007384	ATA	2	6	611634	611639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12511	NC_007384	TGT	2	6	611660	611665	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12512	NC_007384	TGT	2	6	611683	611688	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12513	NC_007384	G	6	6	611733	611738	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
12514	NC_007384	ATTT	2	8	611805	611812	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12515	NC_007384	T	6	6	611829	611834	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12516	NC_007384	ATTT	2	8	611835	611842	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12517	NC_007384	T	6	6	611855	611860	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12518	NC_007384	TAAT	2	8	611936	611943	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12519	NC_007384	ATT	2	6	612201	612206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	74311154
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12521	NC_007384	GC	3	6	612452	612457	0 %	0 %	50 %	50 %	74311154
12522	NC_007384	TGA	2	6	612473	612478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74311154
12523	NC_007384	GTG	2	6	612498	612503	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74311154
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12527	NC_007384	CCG	2	6	612838	612843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74311154
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12529	NC_007384	TGG	2	6	612883	612888	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74311154
12530	NC_007384	TGA	2	6	612941	612946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74311154
12531	NC_007384	GTA	2	6	612973	612978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74311154
12532	NC_007384	GCT	2	6	613205	613210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74311154
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12534	NC_007384	ATC	2	6	613254	613259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74311154
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12542	NC_007384	GCG	2	6	613447	613452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74311154
12543	NC_007384	GGT	2	6	613566	613571	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74311154
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12546	NC_007384	AT	3	6	613707	613712	50 %	50 %	0 %	0 %	74311155
12547	NC_007384	TCAG	2	8	613730	613737	25 %	25 %	25 %	25 %	74311155
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12551	NC_007384	GCCA	2	8	614041	614048	25 %	0 %	25 %	50 %	74311155
12552	NC_007384	TGA	2	6	614058	614063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74311155
12553	NC_007384	ACCG	2	8	614106	614113	25 %	0 %	25 %	50 %	74311155
12554	NC_007384	CAC	2	6	614214	614219	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	74311155
12555	NC_007384	GCC	2	6	614249	614254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74311155
12556	NC_007384	ATT	2	6	614260	614265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	74311155
12557	NC_007384	GGA	2	6	614335	614340	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12558	NC_007384	GCT	2	6	614379	614384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74311156
12559	NC_007384	ACCAA	2	10	614427	614436	60 %	0 %	0 %	40 %	74311156
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12563	NC_007384	CAA	2	6	614620	614625	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	74311156
12564	NC_007384	GCC	2	6	614664	614669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74311156
12565	NC_007384	GAT	2	6	614702	614707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74311156
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12568	NC_007384	CCAGA	2	10	614851	614860	40 %	0 %	20 %	40 %	74311156
12569	NC_007384	GGA	2	6	614887	614892	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	74311156
12570	NC_007384	TGA	2	6	614935	614940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74311156
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12582	NC_007384	GCA	2	6	615258	615263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74311156
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12595	NC_007384	CCT	2	6	615805	615810	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12596	NC_007384	GTG	2	6	615828	615833	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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12602	NC_007384	TGGC	2	8	616276	616283	0 %	25 %	50 %	25 %	74311157
12603	NC_007384	GCA	2	6	616372	616377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74311157
12604	NC_007384	TA	3	6	616549	616554	50 %	50 %	0 %	0 %	74311158
12605	NC_007384	A	6	6	616597	616602	100 %	0 %	0 %	0 %	74311158
12606	NC_007384	ACA	2	6	616915	616920	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	74311158
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12620	NC_007384	CGT	2	6	617836	617841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12622	NC_007384	TG	3	6	617910	617915	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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12624	NC_007384	ACG	2	6	617966	617971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12626	NC_007384	GAT	2	6	618010	618015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12892	NC_007384	A	7	7	630564	630570	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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