MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella sonnei Ss046 chromosome

Total Repeats: 97740

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_007384	CTG	2	6	563593	563598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74311112
11502	NC_007384	T	7	7	563711	563717	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11503	NC_007384	AG	3	6	563742	563747	50 %	0 %	50 %	0 %	74311113
11504	NC_007384	TGA	2	6	563772	563777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74311113
11505	NC_007384	AT	3	6	563821	563826	50 %	50 %	0 %	0 %	74311113
11506	NC_007384	CAC	2	6	563855	563860	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	74311113
11507	NC_007384	GGC	2	6	564073	564078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74311113
11508	NC_007384	TCA	2	6	564132	564137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74311113
11509	NC_007384	ATACTG	2	12	564162	564173	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	74311113
11510	NC_007384	CGCC	2	8	564186	564193	0 %	0 %	25 %	75 %	74311113
11511	NC_007384	GGT	2	6	564290	564295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74311113
11512	NC_007384	CCAG	2	8	564343	564350	25 %	0 %	25 %	50 %	74311113
11513	NC_007384	CCA	2	6	564394	564399	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	74311113
11514	NC_007384	CAG	2	6	564488	564493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74311113
11515	NC_007384	ATC	2	6	564498	564503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74311113
11516	NC_007384	GCC	2	6	564573	564578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74311113
11517	NC_007384	AGC	2	6	564630	564635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74311113
11518	NC_007384	CAT	2	6	564641	564646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74311113
11519	NC_007384	GC	3	6	564658	564663	0 %	0 %	50 %	50 %	74311113
11520	NC_007384	ACC	2	6	564837	564842	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	74311113
11521	NC_007384	ATA	2	6	564852	564857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	74311113
11522	NC_007384	CAC	2	6	564860	564865	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	74311113
11523	NC_007384	CGG	2	6	564868	564873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74311113
11524	NC_007384	ATA	2	6	564882	564887	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	74311113
11525	NC_007384	ATC	2	6	564894	564899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74311113
11526	NC_007384	GGT	2	6	564908	564913	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74311113
11527	NC_007384	GATC	2	8	564916	564923	25 %	25 %	25 %	25 %	74311113
11528	NC_007384	ACA	2	6	564982	564987	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11529	NC_007384	ATG	2	6	564995	565000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11530	NC_007384	AG	3	6	565067	565072	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11531	NC_007384	AGCGT	2	10	565121	565130	20 %	20 %	40 %	20 %	74311114
11532	NC_007384	TGA	2	6	565148	565153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74311114
11533	NC_007384	AAC	2	6	565162	565167	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	74311114
11534	NC_007384	GGC	2	6	565219	565224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74311114
11535	NC_007384	GCC	2	6	565262	565267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74311114
11536	NC_007384	CAT	3	9	565323	565331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74311114
11537	NC_007384	GAA	2	6	565357	565362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	74311114
11538	NC_007384	CAA	2	6	565431	565436	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	74311114
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11540	NC_007384	CGTT	2	8	565511	565518	0 %	50 %	25 %	25 %	74311114
11541	NC_007384	CTT	2	6	565563	565568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	74311114
11542	NC_007384	CAA	2	6	565578	565583	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	74311114
11543	NC_007384	T	6	6	565666	565671	0 %	100 %	0 %	0 %	74311114
11544	NC_007384	CAG	2	6	565760	565765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11545	NC_007384	T	6	6	565839	565844	0 %	100 %	0 %	0 %	74311115
11546	NC_007384	ACC	2	6	565868	565873	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	74311115
11547	NC_007384	CTG	2	6	565993	565998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74311115
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11551	NC_007384	AGCT	2	8	566355	566362	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11552	NC_007384	GCA	3	9	566428	566436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11553	NC_007384	AG	3	6	566441	566446	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11554	NC_007384	CTG	2	6	566467	566472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11555	NC_007384	TTC	2	6	566545	566550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11556	NC_007384	CCA	2	6	566621	566626	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	74311116
11557	NC_007384	CGA	2	6	566631	566636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74311116
11558	NC_007384	TTCA	2	8	566656	566663	25 %	50 %	0 %	25 %	74311116
11559	NC_007384	GAC	2	6	566671	566676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74311116
11560	NC_007384	T	6	6	566736	566741	0 %	100 %	0 %	0 %	74311116
11561	NC_007384	CGA	2	6	566774	566779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74311116
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11596	NC_007384	CTT	2	6	568604	568609	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11597	NC_007384	TG	3	6	568712	568717	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11598	NC_007384	GAA	2	6	568773	568778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11599	NC_007384	GTCAG	2	10	568818	568827	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
11600	NC_007384	CAGT	2	8	568861	568868	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11601	NC_007384	TGT	2	6	568895	568900	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11603	NC_007384	ATGA	2	8	568979	568986	50 %	25 %	25 %	0 %	74311117
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11606	NC_007384	CT	3	6	569067	569072	0 %	50 %	0 %	50 %	74311117
11607	NC_007384	CTG	2	6	569140	569145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74311117
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11610	NC_007384	A	6	6	569188	569193	100 %	0 %	0 %	0 %	74311117
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11612	NC_007384	CA	3	6	569318	569323	50 %	0 %	0 %	50 %	74311117
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11622	NC_007384	CAA	2	6	569680	569685	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11623	NC_007384	AGTG	2	8	569704	569711	25 %	25 %	50 %	0 %	74311118
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11625	NC_007384	CGC	2	6	569851	569856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74311118
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11630	NC_007384	GAT	2	6	570068	570073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74311118
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11633	NC_007384	AGCC	2	8	570309	570316	25 %	0 %	25 %	50 %	74311118
11634	NC_007384	TTG	2	6	570345	570350	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	74311118
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11639	NC_007384	TGT	2	6	570622	570627	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	74311118
11640	NC_007384	CGGT	2	8	570672	570679	0 %	25 %	50 %	25 %	74311118
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11733	NC_007384	TGG	2	6	574980	574985	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74311121
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