MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella sonnei Ss046 chromosome

Total Repeats: 97740

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10502	NC_007384	TCA	2	6	511970	511975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74311074
10503	NC_007384	CTG	2	6	512058	512063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74311074
10504	NC_007384	GC	3	6	512072	512077	0 %	0 %	50 %	50 %	74311074
10505	NC_007384	TGG	2	6	512084	512089	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74311074
10506	NC_007384	TCG	2	6	512164	512169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74311074
10507	NC_007384	GATC	2	8	512201	512208	25 %	25 %	25 %	25 %	74311074
10508	NC_007384	CAT	2	6	512246	512251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74311074
10509	NC_007384	GC	3	6	512303	512308	0 %	0 %	50 %	50 %	74311074
10510	NC_007384	A	6	6	512518	512523	100 %	0 %	0 %	0 %	74311076
10511	NC_007384	GCA	2	6	512526	512531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74311076
10512	NC_007384	GCAG	2	8	512606	512613	25 %	0 %	50 %	25 %	74311076
10513	NC_007384	GGC	2	6	512644	512649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74311076
10514	NC_007384	GCC	2	6	512722	512727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74311076
10515	NC_007384	CAG	2	6	512764	512769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74311076
10516	NC_007384	GC	3	6	512779	512784	0 %	0 %	50 %	50 %	74311076
10517	NC_007384	TTG	2	6	512791	512796	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	74311076
10518	NC_007384	CGC	2	6	512805	512810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74311076
10519	NC_007384	CAA	2	6	512857	512862	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	74311076
10520	NC_007384	CAGGC	2	10	512865	512874	20 %	0 %	40 %	40 %	74311076
10521	NC_007384	GCG	2	6	512939	512944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74311076
10522	NC_007384	CAGGAA	2	12	512965	512976	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	74311076
10523	NC_007384	TTG	2	6	512999	513004	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	74311076
10524	NC_007384	TCA	2	6	513009	513014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74311076
10525	NC_007384	AAG	2	6	513019	513024	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	74311075
10526	NC_007384	TGG	2	6	513104	513109	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74311075
10527	NC_007384	TGA	2	6	513159	513164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74311075
10528	NC_007384	GCA	2	6	513167	513172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74311075
10529	NC_007384	TGG	2	6	513188	513193	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74311075
10530	NC_007384	ATA	2	6	513206	513211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	74311075
10531	NC_007384	GAA	2	6	513217	513222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	74311075
10532	NC_007384	GC	3	6	513237	513242	0 %	0 %	50 %	50 %	74311075
10533	NC_007384	CTG	2	6	513322	513327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74311075
10534	NC_007384	ATC	2	6	513404	513409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74311075
10535	NC_007384	CGG	2	6	513426	513431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74311075
10536	NC_007384	CGA	2	6	513492	513497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74311075
10537	NC_007384	CTG	2	6	513544	513549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74311075
10538	NC_007384	CAC	2	6	513573	513578	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	74311075
10539	NC_007384	GGC	2	6	513609	513614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74311075
10540	NC_007384	GCT	2	6	513626	513631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74311075
10541	NC_007384	AGG	2	6	513656	513661	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	74311075
10542	NC_007384	CTGG	2	8	513719	513726	0 %	25 %	50 %	25 %	74311077
10543	NC_007384	GGCG	2	8	513818	513825	0 %	0 %	75 %	25 %	74311077
10544	NC_007384	GGA	2	6	513869	513874	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	74311077
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10547	NC_007384	GAT	2	6	513972	513977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74311077
10548	NC_007384	TGA	3	9	514186	514194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74311077
10549	NC_007384	CGG	2	6	514262	514267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74311077
10550	NC_007384	GTT	2	6	514301	514306	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	74311077
10551	NC_007384	AAC	2	6	514324	514329	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	74311077
10552	NC_007384	GC	3	6	514357	514362	0 %	0 %	50 %	50 %	74311077
10553	NC_007384	CGAT	2	8	514368	514375	25 %	25 %	25 %	25 %	74311077
10554	NC_007384	CTG	2	6	514395	514400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74311077
10555	NC_007384	TGC	2	6	514420	514425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74311077
10556	NC_007384	TGGCAG	2	12	514426	514437	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	74311077
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10560	NC_007384	TGC	2	6	514621	514626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74311077
10561	NC_007384	CTGC	2	8	514638	514645	0 %	25 %	25 %	50 %	74311077
10562	NC_007384	GCCA	2	8	514655	514662	25 %	0 %	25 %	50 %	74311077
10563	NC_007384	GCT	2	6	514709	514714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74311077
10564	NC_007384	TTG	2	6	514737	514742	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	74311077
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10567	NC_007384	TGC	3	9	514837	514845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74311077
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10571	NC_007384	GTA	2	6	514899	514904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74311077
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10573	NC_007384	CGC	2	6	514953	514958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74311077
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10576	NC_007384	GCA	3	9	515108	515116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74311077
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10586	NC_007384	GCGTCA	2	12	515777	515788	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	74311077
10587	NC_007384	TGG	2	6	515797	515802	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74311077
10588	NC_007384	A	6	6	515826	515831	100 %	0 %	0 %	0 %	74311077
10589	NC_007384	CTG	2	6	515832	515837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74311077
10590	NC_007384	GTTT	2	8	515873	515880	0 %	75 %	25 %	0 %	74311077
10591	NC_007384	CTG	3	9	516000	516008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74311077
10592	NC_007384	CGG	2	6	516017	516022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74311077
10593	NC_007384	CTGG	2	8	516023	516030	0 %	25 %	50 %	25 %	74311077
10594	NC_007384	TGA	2	6	516078	516083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74311077
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10596	NC_007384	CGC	2	6	516182	516187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10597	NC_007384	AATA	2	8	516216	516223	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10598	NC_007384	T	6	6	516245	516250	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10599	NC_007384	T	6	6	516377	516382	0 %	100 %	0 %	0 %	74311078
10600	NC_007384	CCAG	2	8	516433	516440	25 %	0 %	25 %	50 %	74311078
10601	NC_007384	GGT	2	6	516464	516469	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74311078
10602	NC_007384	TCG	2	6	516594	516599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74311078
10603	NC_007384	ATG	2	6	516620	516625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74311078
10604	NC_007384	TCT	2	6	516678	516683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	74311078
10605	NC_007384	ACC	2	6	516684	516689	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	74311078
10606	NC_007384	CGC	2	6	516695	516700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74311078
10607	NC_007384	TCGC	2	8	516710	516717	0 %	25 %	25 %	50 %	74311078
10608	NC_007384	ATC	2	6	516747	516752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74311078
10609	NC_007384	CAGC	2	8	516817	516824	25 %	0 %	25 %	50 %	74311078
10610	NC_007384	TGC	2	6	516927	516932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74311078
10611	NC_007384	CCA	2	6	517045	517050	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	74311078
10612	NC_007384	AATC	2	8	517057	517064	50 %	25 %	0 %	25 %	74311078
10613	NC_007384	GCA	2	6	517118	517123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74311078
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10615	NC_007384	CCA	2	6	517195	517200	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	74311078
10616	NC_007384	CAGCGC	2	12	517211	517222	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	74311078
10617	NC_007384	CGG	2	6	517258	517263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74311078
10618	NC_007384	GCG	2	6	517299	517304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74311078
10619	NC_007384	AAT	2	6	517346	517351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	74311078
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