MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella sonnei Ss046 chromosome

Total Repeats: 97740

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8501	NC_007384	AT	3	6	416103	416108	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8502	NC_007384	CGC	2	6	416147	416152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8503	NC_007384	GTT	2	6	416175	416180	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8504	NC_007384	CTA	2	6	416237	416242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74310980
8505	NC_007384	ACC	2	6	416250	416255	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	74310980
8506	NC_007384	GTTGCC	2	12	416280	416291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74310980
8507	NC_007384	AGTTC	2	10	416294	416303	20 %	40 %	20 %	20 %	74310980
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8513	NC_007384	TTA	2	6	416695	416700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	74310980
8514	NC_007384	GTT	2	6	416721	416726	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	74310980
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8517	NC_007384	AGGT	2	8	416932	416939	25 %	25 %	50 %	0 %	74310980
8518	NC_007384	CCA	2	6	417003	417008	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	74310980
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8520	NC_007384	T	7	7	417098	417104	0 %	100 %	0 %	0 %	74310980
8521	NC_007384	TAT	2	6	417191	417196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8522	NC_007384	GTTTC	2	10	417221	417230	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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8524	NC_007384	CGGG	2	8	417279	417286	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
8525	NC_007384	TTG	2	6	417307	417312	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8529	NC_007384	CACTT	2	10	417868	417877	20 %	40 %	0 %	40 %	161986573
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8533	NC_007384	TCG	2	6	417960	417965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8534	NC_007384	AGC	2	6	417992	417997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8536	NC_007384	ACC	2	6	418075	418080	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8537	NC_007384	CTCGT	2	10	418142	418151	0 %	40 %	20 %	40 %	74310982
8538	NC_007384	CGC	2	6	418171	418176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74310982
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8545	NC_007384	GC	3	6	418380	418385	0 %	0 %	50 %	50 %	74310982
8546	NC_007384	GAT	2	6	418413	418418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74310982
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8548	NC_007384	GGA	2	6	418536	418541	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	74310982
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8554	NC_007384	TGA	3	9	418925	418933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74310983
8555	NC_007384	GCG	2	6	419042	419047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74310983
8556	NC_007384	GGCGC	2	10	419073	419082	0 %	0 %	60 %	40 %	74310983
8557	NC_007384	GC	3	6	419097	419102	0 %	0 %	50 %	50 %	74310983
8558	NC_007384	CAG	2	6	419124	419129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74310983
8559	NC_007384	GAT	2	6	419146	419151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74310983
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8562	NC_007384	TGAT	2	8	419240	419247	25 %	50 %	25 %	0 %	74310983
8563	NC_007384	GCA	2	6	419283	419288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74310983
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8572	NC_007384	C	6	6	419703	419708	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8573	NC_007384	GAAG	2	8	419730	419737	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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8609	NC_007384	GGCA	2	8	421326	421333	25 %	0 %	50 %	25 %	74310986
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8613	NC_007384	GCGCT	2	10	421487	421496	0 %	20 %	40 %	40 %	74310986
8614	NC_007384	CT	3	6	421502	421507	0 %	50 %	0 %	50 %	74310986
8615	NC_007384	GC	3	6	421557	421562	0 %	0 %	50 %	50 %	74310986
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