MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella sonnei Ss046 chromosome

Total Repeats: 97740

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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6002	NC_007384	TAAG	2	8	294262	294269	50 %	25 %	25 %	0 %	74310864
6003	NC_007384	CGC	2	6	294297	294302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6004	NC_007384	CGC	2	6	294398	294403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6005	NC_007384	AATC	2	8	294424	294431	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6006	NC_007384	TGT	2	6	294457	294462	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6007	NC_007384	GTG	3	9	294547	294555	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74310865
6008	NC_007384	GGT	2	6	294692	294697	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74310865
6009	NC_007384	CGGT	2	8	294844	294851	0 %	25 %	50 %	25 %	74310865
6010	NC_007384	CTG	2	6	294875	294880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74310865
6011	NC_007384	GGC	2	6	294929	294934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74310865
6012	NC_007384	AT	3	6	294944	294949	50 %	50 %	0 %	0 %	74310865
6013	NC_007384	TGC	2	6	294994	294999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74310865
6014	NC_007384	CGC	2	6	295056	295061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74310865
6015	NC_007384	GC	3	6	295060	295065	0 %	0 %	50 %	50 %	74310865
6016	NC_007384	GCT	2	6	295082	295087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74310865
6017	NC_007384	ATG	2	6	295132	295137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74310865
6018	NC_007384	CGGT	2	8	295313	295320	0 %	25 %	50 %	25 %	74310866
6019	NC_007384	AGT	2	6	295340	295345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74310866
6020	NC_007384	TCA	2	6	295495	295500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74310866
6021	NC_007384	AGC	2	6	295523	295528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74310866
6022	NC_007384	ATC	2	6	295552	295557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74310866
6023	NC_007384	GTA	2	6	295623	295628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74310866
6024	NC_007384	GCC	2	6	295716	295721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74310866
6025	NC_007384	AGC	2	6	295750	295755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74310866
6026	NC_007384	TTC	2	6	295797	295802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	74310866
6027	NC_007384	CTG	2	6	295839	295844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74310866
6028	NC_007384	CTG	2	6	295879	295884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74310866
6029	NC_007384	AAACG	2	10	295899	295908	60 %	0 %	20 %	20 %	74310866
6030	NC_007384	CAA	2	6	295917	295922	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	74310866
6031	NC_007384	AC	3	6	295979	295984	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6032	NC_007384	CGC	2	6	296120	296125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74310867
6033	NC_007384	TC	3	6	296138	296143	0 %	50 %	0 %	50 %	74310867
6034	NC_007384	GGT	2	6	296236	296241	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74310867
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6038	NC_007384	TGAT	2	8	296463	296470	25 %	50 %	25 %	0 %	74310868
6039	NC_007384	CG	3	6	296522	296527	0 %	0 %	50 %	50 %	74310868
6040	NC_007384	CCG	2	6	296589	296594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74310868
6041	NC_007384	TTC	2	6	296600	296605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	74310868
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6043	NC_007384	TATT	2	8	296671	296678	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6044	NC_007384	TAA	2	6	296729	296734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6045	NC_007384	ATA	2	6	296749	296754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6046	NC_007384	AT	3	6	296762	296767	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6047	NC_007384	TTA	2	6	296768	296773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6048	NC_007384	TAA	2	6	296780	296785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6050	NC_007384	ATT	2	6	296849	296854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6053	NC_007384	TTC	2	6	296921	296926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	74310869
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6063	NC_007384	T	6	6	297563	297568	0 %	100 %	0 %	0 %	74310869
6064	NC_007384	GC	3	6	297571	297576	0 %	0 %	50 %	50 %	74310869
6065	NC_007384	CGC	2	6	297626	297631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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6069	NC_007384	T	6	6	297824	297829	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6081	NC_007384	CCTTT	2	10	298808	298817	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
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6089	NC_007384	TGCAT	2	10	299026	299035	20 %	40 %	20 %	20 %	74310871
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6094	NC_007384	CG	3	6	299270	299275	0 %	0 %	50 %	50 %	74310871
6095	NC_007384	CGC	2	6	299432	299437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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6111	NC_007384	CTGG	2	8	300314	300321	0 %	25 %	50 %	25 %	74310873
6112	NC_007384	GCA	3	9	300358	300366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74310873
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6117	NC_007384	CGC	3	9	300782	300790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74310873
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6125	NC_007384	TGAT	2	8	301044	301051	25 %	50 %	25 %	0 %	74310873
6126	NC_007384	GAC	2	6	301154	301159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74310873
6127	NC_007384	CGC	2	6	301211	301216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74310872
6128	NC_007384	TAAA	2	8	301261	301268	75 %	25 %	0 %	0 %	74310872
6129	NC_007384	GAA	2	6	301314	301319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	74310872
6130	NC_007384	A	6	6	301326	301331	100 %	0 %	0 %	0 %	74310872
6131	NC_007384	GC	3	6	301332	301337	0 %	0 %	50 %	50 %	74310872
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6138	NC_007384	GCT	2	6	301553	301558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74310872
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6144	NC_007384	TCG	2	6	301688	301693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74310872
6145	NC_007384	TGC	2	6	301759	301764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74310872
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6150	NC_007384	G	6	6	302120	302125	0 %	0 %	100 %	0 %	74310874
6151	NC_007384	CG	3	6	302148	302153	0 %	0 %	50 %	50 %	74310874
6152	NC_007384	CGTA	2	8	302163	302170	25 %	25 %	25 %	25 %	74310874
6153	NC_007384	AAG	2	6	302246	302251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	74310874
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6156	NC_007384	TGC	2	6	302636	302641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74310874
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6224	NC_007384	A	6	6	306062	306067	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6237	NC_007384	TCA	2	6	306593	306598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74310877
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6248	NC_007384	T	6	6	307154	307159	0 %	100 %	0 %	0 %	74310878
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