MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pyogenes MGAS5005 chromosome

Total Repeats: 39173

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_007297	CTTTAT	2	12	160508	160519	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3502	NC_007297	A	6	6	160646	160651	100 %	0 %	0 %	0 %	71909962
3503	NC_007297	GCC	2	6	160784	160789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	71909962
3504	NC_007297	GCT	3	9	160814	160822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71909962
3505	NC_007297	AGA	2	6	160834	160839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71909962
3506	NC_007297	TCA	2	6	160848	160853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71909962
3507	NC_007297	CT	3	6	160869	160874	0 %	50 %	0 %	50 %	71909962
3508	NC_007297	TCA	2	6	160941	160946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71909962
3509	NC_007297	CAT	2	6	160954	160959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71909962
3510	NC_007297	CGA	2	6	160974	160979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71909962
3511	NC_007297	CTT	2	6	160994	160999	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	71909962
3512	NC_007297	ATC	2	6	161045	161050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71909962
3513	NC_007297	CAA	3	9	161138	161146	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71909962
3514	NC_007297	A	6	6	161189	161194	100 %	0 %	0 %	0 %	71909962
3515	NC_007297	GAA	2	6	161195	161200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71909962
3516	NC_007297	CTT	2	6	161227	161232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	71909962
3517	NC_007297	TGT	2	6	161251	161256	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	71909962
3518	NC_007297	AAGC	2	8	161366	161373	50 %	0 %	25 %	25 %	71909962
3519	NC_007297	TTC	2	6	161375	161380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	71909962
3520	NC_007297	CT	3	6	161398	161403	0 %	50 %	0 %	50 %	71909962
3521	NC_007297	TGTT	2	8	161448	161455	0 %	75 %	25 %	0 %	71909962
3522	NC_007297	TTC	2	6	161548	161553	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	71909962
3523	NC_007297	CTT	2	6	161612	161617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	71909962
3524	NC_007297	GTG	2	6	161706	161711	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	71909962
3525	NC_007297	AGC	2	6	161719	161724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71909962
3526	NC_007297	ATTT	2	8	161737	161744	25 %	75 %	0 %	0 %	71909962
3527	NC_007297	TGCTGT	2	12	161770	161781	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	71909962
3528	NC_007297	GGT	2	6	161801	161806	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	71909962
3529	NC_007297	TTC	2	6	161829	161834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	71909962
3530	NC_007297	TCT	2	6	161898	161903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	71909962
3531	NC_007297	TTA	2	6	161953	161958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71909962
3532	NC_007297	AACAA	2	10	162010	162019	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
3533	NC_007297	TAA	2	6	162020	162025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3534	NC_007297	GGA	2	6	162035	162040	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3535	NC_007297	A	6	6	162040	162045	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3536	NC_007297	TCAG	2	8	162149	162156	25 %	25 %	25 %	25 %	71909963
3537	NC_007297	CTT	2	6	162157	162162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	71909963
3538	NC_007297	TTGG	2	8	162261	162268	0 %	50 %	50 %	0 %	71909963
3539	NC_007297	GATG	2	8	162281	162288	25 %	25 %	50 %	0 %	71909963
3540	NC_007297	AAG	2	6	162313	162318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71909963
3541	NC_007297	CTCTTT	2	12	162372	162383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3542	NC_007297	GT	4	8	162408	162415	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3543	NC_007297	ACA	2	6	162474	162479	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71909964
3544	NC_007297	TGAT	2	8	162546	162553	25 %	50 %	25 %	0 %	71909964
3545	NC_007297	TAC	2	6	162575	162580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71909964
3546	NC_007297	CAT	2	6	162586	162591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71909964
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3548	NC_007297	CA	3	6	162779	162784	50 %	0 %	0 %	50 %	71909964
3549	NC_007297	TGG	2	6	162843	162848	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	71909964
3550	NC_007297	AGA	2	6	162883	162888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71909964
3551	NC_007297	CTTA	2	8	162903	162910	25 %	50 %	0 %	25 %	71909964
3552	NC_007297	ATG	2	6	162961	162966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3553	NC_007297	AGC	2	6	163087	163092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71909965
3554	NC_007297	TGCT	2	8	163139	163146	0 %	50 %	25 %	25 %	71909965
3555	NC_007297	GTTG	2	8	163162	163169	0 %	50 %	50 %	0 %	71909965
3556	NC_007297	GTG	2	6	163263	163268	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	71909965
3557	NC_007297	CGA	2	6	163296	163301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71909965
3558	NC_007297	AGC	2	6	163315	163320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71909965
3559	NC_007297	AGA	2	6	163336	163341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71909965
3560	NC_007297	ACC	2	6	163440	163445	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	71909965
3561	NC_007297	CTT	2	6	163460	163465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	71909965
3562	NC_007297	ATTG	2	8	163510	163517	25 %	50 %	25 %	0 %	71909965
3563	NC_007297	TGG	2	6	163543	163548	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	71909965
3564	NC_007297	AGA	2	6	163627	163632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71909965
3565	NC_007297	CTG	2	6	163635	163640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71909965
3566	NC_007297	GCG	2	6	163643	163648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	71909965
3567	NC_007297	TGA	2	6	163802	163807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71909966
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3569	NC_007297	GAA	2	6	163845	163850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71909966
3570	NC_007297	TGA	2	6	163975	163980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71909966
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3572	NC_007297	GAA	2	6	164118	164123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71909966
3573	NC_007297	TG	3	6	164385	164390	0 %	50 %	50 %	0 %	71909966
3574	NC_007297	T	6	6	164441	164446	0 %	100 %	0 %	0 %	71909966
3575	NC_007297	GGA	2	6	164480	164485	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	71909966
3576	NC_007297	GCT	2	6	164493	164498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71909966
3577	NC_007297	AAG	2	6	164503	164508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71909966
3578	NC_007297	ATA	2	6	164552	164557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71909966
3579	NC_007297	TCA	2	6	164684	164689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71909967
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3582	NC_007297	CACT	2	8	164847	164854	25 %	25 %	0 %	50 %	71909967
3583	NC_007297	GTTG	2	8	164866	164873	0 %	50 %	50 %	0 %	71909967
3584	NC_007297	CAGG	2	8	164878	164885	25 %	0 %	50 %	25 %	71909967
3585	NC_007297	ACT	2	6	164921	164926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71909967
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3588	NC_007297	AGA	2	6	165132	165137	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71909967
3589	NC_007297	AATC	2	8	165168	165175	50 %	25 %	0 %	25 %	71909967
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3591	NC_007297	TTA	2	6	165243	165248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71909967
3592	NC_007297	TTA	2	6	165276	165281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3593	NC_007297	TGT	2	6	165408	165413	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	71909968
3594	NC_007297	GGTGTT	2	12	165438	165449	0 %	50 %	50 %	0 %	71909968
3595	NC_007297	TTA	2	6	165492	165497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3596	NC_007297	GGAT	2	8	165555	165562	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3597	NC_007297	AG	3	6	165567	165572	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3598	NC_007297	ATG	2	6	165586	165591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71909969
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3601	NC_007297	GCT	2	6	165799	165804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71909969
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3604	NC_007297	TGA	2	6	165855	165860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71909969
3605	NC_007297	ATG	2	6	165935	165940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71909969
3606	NC_007297	CTGA	2	8	165967	165974	25 %	25 %	25 %	25 %	71909969
3607	NC_007297	GAA	2	6	165982	165987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71909969
3608	NC_007297	ACAA	2	8	165995	166002	75 %	0 %	0 %	25 %	71909969
3609	NC_007297	ATT	2	6	166040	166045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71909969
3610	NC_007297	AT	3	6	166130	166135	50 %	50 %	0 %	0 %	71909969
3611	NC_007297	ATTTG	2	10	166358	166367	20 %	60 %	20 %	0 %	71909969
3612	NC_007297	AG	3	6	166405	166410	50 %	0 %	50 %	0 %	71909969
3613	NC_007297	GAT	2	6	166438	166443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71909969
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3615	NC_007297	AGATCA	2	12	166488	166499	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	71909969
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3617	NC_007297	GAC	2	6	166617	166622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71909969
3618	NC_007297	T	7	7	166661	166667	0 %	100 %	0 %	0 %	71909969
3619	NC_007297	GAA	2	6	166705	166710	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71909969
3620	NC_007297	GAT	2	6	166777	166782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71909969
3621	NC_007297	AAT	2	6	166825	166830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71909969
3622	NC_007297	GAT	2	6	166867	166872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71909969
3623	NC_007297	TTG	2	6	166997	167002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	71909969
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