MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pyogenes MGAS5005 chromosome

Total Repeats: 39173

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_007297	GAA	2	6	232293	232298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71910041
5002	NC_007297	GAT	2	6	232329	232334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71910041
5003	NC_007297	AGA	2	6	232340	232345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71910041
5004	NC_007297	CAT	2	6	232418	232423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71910041
5005	NC_007297	ATT	2	6	232434	232439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71910041
5006	NC_007297	ATG	4	12	232467	232478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71910041
5007	NC_007297	ACA	2	6	232479	232484	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71910041
5008	NC_007297	TGA	2	6	232604	232609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5009	NC_007297	ATG	2	6	232631	232636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_007297	TTA	2	6	232668	232673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_007297	TAA	2	6	232738	232743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5012	NC_007297	A	7	7	232748	232754	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5013	NC_007297	T	6	6	232781	232786	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5014	NC_007297	ATT	2	6	232875	232880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71910042
5015	NC_007297	TCT	2	6	232946	232951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	71910042
5016	NC_007297	AGA	2	6	232957	232962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71910042
5017	NC_007297	TAT	2	6	232969	232974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71910042
5018	NC_007297	GAA	2	6	232988	232993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71910042
5019	NC_007297	TTG	2	6	233082	233087	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	71910042
5020	NC_007297	AG	3	6	233110	233115	50 %	0 %	50 %	0 %	71910042
5021	NC_007297	TAT	2	6	233194	233199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71910042
5022	NC_007297	TGA	2	6	233235	233240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71910042
5023	NC_007297	ATTG	2	8	233431	233438	25 %	50 %	25 %	0 %	71910042
5024	NC_007297	GAT	2	6	233441	233446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71910042
5025	NC_007297	G	6	6	233459	233464	0 %	0 %	100 %	0 %	71910042
5026	NC_007297	ACA	2	6	233607	233612	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71910042
5027	NC_007297	TGT	3	9	233614	233622	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	71910042
5028	NC_007297	GA	4	8	233657	233664	50 %	0 %	50 %	0 %	71910042
5029	NC_007297	CAA	2	6	233720	233725	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71910043
5030	NC_007297	GAT	2	6	233773	233778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71910043
5031	NC_007297	ACG	2	6	233813	233818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71910043
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5033	NC_007297	A	6	6	233876	233881	100 %	0 %	0 %	0 %	71910043
5034	NC_007297	CAA	2	6	233890	233895	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71910043
5035	NC_007297	ACT	2	6	233935	233940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71910043
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5037	NC_007297	AGT	2	6	234028	234033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71910043
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5039	NC_007297	AG	3	6	234070	234075	50 %	0 %	50 %	0 %	71910043
5040	NC_007297	CAG	2	6	234164	234169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71910043
5041	NC_007297	ACT	2	6	234172	234177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71910043
5042	NC_007297	AGC	2	6	234270	234275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71910043
5043	NC_007297	ATA	2	6	234290	234295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71910043
5044	NC_007297	GCT	2	6	234397	234402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71910043
5045	NC_007297	GTC	2	6	234428	234433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71910043
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5050	NC_007297	ATT	2	6	234592	234597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71910043
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5052	NC_007297	TTG	2	6	234662	234667	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	71910043
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5055	NC_007297	CAG	2	6	234773	234778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71910043
5056	NC_007297	CAT	2	6	234842	234847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71910043
5057	NC_007297	TAT	2	6	234906	234911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71910043
5058	NC_007297	ATG	2	6	234947	234952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71910043
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5060	NC_007297	TGAA	2	8	235163	235170	50 %	25 %	25 %	0 %	71910043
5061	NC_007297	TAA	2	6	235218	235223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71910043
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5067	NC_007297	AGCTA	2	10	235542	235551	40 %	20 %	20 %	20 %	71910043
5068	NC_007297	CAGA	2	8	235576	235583	50 %	0 %	25 %	25 %	71910043
5069	NC_007297	TGG	2	6	235622	235627	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	71910043
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5081	NC_007297	TGA	2	6	236193	236198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71910043
5082	NC_007297	GTC	2	6	236227	236232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71910043
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5089	NC_007297	A	6	6	236659	236664	100 %	0 %	0 %	0 %	71910044
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5103	NC_007297	TGC	2	6	237305	237310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71910045
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5106	NC_007297	TAT	2	6	237474	237479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5107	NC_007297	TAA	2	6	237513	237518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5108	NC_007297	GAA	2	6	237564	237569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5109	NC_007297	CA	3	6	237600	237605	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5110	NC_007297	TAT	2	6	237659	237664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5111	NC_007297	CAA	2	6	237671	237676	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5112	NC_007297	A	7	7	237746	237752	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5113	NC_007297	ACA	2	6	237840	237845	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71910046
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5115	NC_007297	AC	3	6	237891	237896	50 %	0 %	0 %	50 %	71910046
5116	NC_007297	TGGA	2	8	237918	237925	25 %	25 %	50 %	0 %	71910046
5117	NC_007297	GCAAGA	2	12	237926	237937	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	71910046
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5119	NC_007297	CAT	2	6	237998	238003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71910046
5120	NC_007297	AC	3	6	238006	238011	50 %	0 %	0 %	50 %	71910046
5121	NC_007297	TC	3	6	238047	238052	0 %	50 %	0 %	50 %	71910046
5122	NC_007297	CAA	2	6	238166	238171	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71910046
5123	NC_007297	CCAAT	2	10	238245	238254	40 %	20 %	0 %	40 %	71910046
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5125	NC_007297	GAA	2	6	238350	238355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71910046
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