MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pyogenes MGAS6180 chromosome

Total Repeats: 40690

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007296	ATTT	2	8	91	98	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007296	ACTA	2	8	117	124	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_007296	AAG	2	6	187	192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007296	T	6	6	221	226	0 %	100 %	0 %	0 %	71902668
5	NC_007296	T	6	6	280	285	0 %	100 %	0 %	0 %	71902668
6	NC_007296	ATG	2	6	290	295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71902668
7	NC_007296	A	7	7	365	371	100 %	0 %	0 %	0 %	71902668
8	NC_007296	CTG	2	6	392	397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71902668
9	NC_007296	GAA	2	6	442	447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71902668
10	NC_007296	ATCA	2	8	478	485	50 %	25 %	0 %	25 %	71902668
11	NC_007296	AGC	2	6	494	499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71902668
12	NC_007296	TGC	2	6	594	599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71902668
13	NC_007296	TTA	2	6	682	687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71902668
14	NC_007296	AT	3	6	738	743	50 %	50 %	0 %	0 %	71902668
15	NC_007296	TTA	2	6	758	763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71902668
16	NC_007296	GAAA	2	8	807	814	75 %	0 %	25 %	0 %	71902668
17	NC_007296	TGA	2	6	843	848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71902668
18	NC_007296	A	7	7	865	871	100 %	0 %	0 %	0 %	71902668
19	NC_007296	CT	3	6	874	879	0 %	50 %	0 %	50 %	71902668
20	NC_007296	AAG	2	6	887	892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71902668
21	NC_007296	ATA	3	9	920	928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71902668
22	NC_007296	ACAA	2	8	929	936	75 %	0 %	0 %	25 %	71902668
23	NC_007296	ATC	2	6	965	970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71902668
24	NC_007296	AGA	2	6	981	986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71902668
25	NC_007296	CCT	2	6	1033	1038	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	71902668
26	NC_007296	CAAA	2	8	1194	1201	75 %	0 %	0 %	25 %	71902668
27	NC_007296	TGC	2	6	1224	1229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71902668
28	NC_007296	GAA	2	6	1285	1290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71902668
29	NC_007296	CTA	2	6	1343	1348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71902668
30	NC_007296	TGG	2	6	1443	1448	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	71902668
31	NC_007296	TAA	2	6	1479	1484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71902668
32	NC_007296	A	6	6	1539	1544	100 %	0 %	0 %	0 %	71902668
33	NC_007296	AAC	2	6	1605	1610	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_007296	TC	3	6	1626	1631	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_007296	TTTA	2	8	1633	1640	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_007296	TA	3	6	1652	1657	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_007296	CTA	4	12	1666	1677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_007296	TTA	3	9	1679	1687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_007296	TTA	2	6	1691	1696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_007296	ATT	2	6	1738	1743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71902669
41	NC_007296	TCA	2	6	1805	1810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71902669
42	NC_007296	GTAA	2	8	1889	1896	50 %	25 %	25 %	0 %	71902669
43	NC_007296	TTA	2	6	1937	1942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71902669
44	NC_007296	T	7	7	1951	1957	0 %	100 %	0 %	0 %	71902669
45	NC_007296	ATT	2	6	1964	1969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71902669
46	NC_007296	AAC	2	6	2010	2015	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71902669
47	NC_007296	GTT	2	6	2021	2026	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	71902669
48	NC_007296	AAG	2	6	2091	2096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71902669
49	NC_007296	ATT	2	6	2131	2136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71902669
50	NC_007296	TAT	2	6	2143	2148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71902669
51	NC_007296	GTC	2	6	2184	2189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71902669
52	NC_007296	GACT	2	8	2248	2255	25 %	25 %	25 %	25 %	71902669
53	NC_007296	CAG	2	6	2298	2303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71902669
54	NC_007296	GA	3	6	2335	2340	50 %	0 %	50 %	0 %	71902669
55	NC_007296	CAG	2	6	2346	2351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71902669
56	NC_007296	GAT	2	6	2360	2365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71902669
57	NC_007296	TTA	2	6	2474	2479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71902669
58	NC_007296	GTT	2	6	2501	2506	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	71902669
59	NC_007296	CTT	2	6	2545	2550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	71902669
60	NC_007296	GGTAA	2	10	2636	2645	40 %	20 %	40 %	0 %	71902669
61	NC_007296	AGTC	2	8	2666	2673	25 %	25 %	25 %	25 %	71902669
62	NC_007296	GAA	2	6	2804	2809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71902669
63	NC_007296	AATT	2	8	2820	2827	50 %	50 %	0 %	0 %	71902669
64	NC_007296	TAAG	2	8	2846	2853	50 %	25 %	25 %	0 %	71902669
65	NC_007296	T	7	7	2874	2880	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_007296	TTA	2	6	2882	2887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_007296	ATA	2	6	2900	2905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_007296	TGAAA	2	10	2946	2955	60 %	20 %	20 %	0 %	71902670
69	NC_007296	A	6	6	2953	2958	100 %	0 %	0 %	0 %	71902670
70	NC_007296	ATG	2	6	3067	3072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71902670
71	NC_007296	A	7	7	3099	3105	100 %	0 %	0 %	0 %	71902670
72	NC_007296	TAAA	2	8	3130	3137	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_007296	A	6	6	3172	3177	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_007296	AGA	2	6	3223	3228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_007296	AAT	2	6	3301	3306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_007296	TCT	2	6	3373	3378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_007296	TCT	2	6	3395	3400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_007296	T	6	6	3402	3407	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_007296	TAA	2	6	3412	3417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_007296	TTGA	2	8	3420	3427	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_007296	CAG	2	6	3460	3465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71902671
82	NC_007296	GCT	2	6	3534	3539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71902671
83	NC_007296	TGGTA	2	10	3572	3581	20 %	40 %	40 %	0 %	71902671
84	NC_007296	A	7	7	3630	3636	100 %	0 %	0 %	0 %	71902671
85	NC_007296	AAAT	2	8	3710	3717	75 %	25 %	0 %	0 %	71902671
86	NC_007296	TGA	3	9	3770	3778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71902671
87	NC_007296	TCAA	2	8	3876	3883	50 %	25 %	0 %	25 %	71902671
88	NC_007296	A	6	6	3904	3909	100 %	0 %	0 %	0 %	71902671
89	NC_007296	AGA	2	6	4016	4021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71902671
90	NC_007296	GTT	2	6	4032	4037	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	71902671
91	NC_007296	AAC	2	6	4055	4060	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71902671
92	NC_007296	CAAA	2	8	4130	4137	75 %	0 %	0 %	25 %	71902671
93	NC_007296	AGT	2	6	4169	4174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71902671
94	NC_007296	AGA	3	9	4193	4201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71902671
95	NC_007296	AGA	2	6	4229	4234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71902671
96	NC_007296	AGC	2	6	4286	4291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71902671
97	NC_007296	ATC	2	6	4294	4299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71902671
98	NC_007296	CAG	2	6	4324	4329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71902671
99	NC_007296	GCT	2	6	4383	4388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71902671
100	NC_007296	TAT	2	6	4391	4396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71902671
101	NC_007296	ATG	2	6	4444	4449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71902671
102	NC_007296	AAG	2	6	4483	4488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71902671
103	NC_007296	GAA	2	6	4503	4508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71902671
104	NC_007296	TGT	2	6	4520	4525	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	71902671
105	NC_007296	CAT	2	6	4538	4543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71902671
106	NC_007296	GAA	2	6	4593	4598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71902672
107	NC_007296	TTG	2	6	4648	4653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	71902672
108	NC_007296	A	6	6	4681	4686	100 %	0 %	0 %	0 %	71902672
109	NC_007296	GAT	2	6	4752	4757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71902672
110	NC_007296	TTA	2	6	4789	4794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71902672
111	NC_007296	CTA	2	6	4822	4827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71902672
112	NC_007296	AAT	2	6	4836	4841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71902672
113	NC_007296	CTA	2	6	4871	4876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71902672
114	NC_007296	ATG	2	6	4909	4914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71902672
115	NC_007296	TTACGT	2	12	4938	4949	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	71902672
116	NC_007296	CAG	2	6	4960	4965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71902672
117	NC_007296	GAC	2	6	5041	5046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71902672
118	NC_007296	TTA	2	6	5065	5070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71902672
119	NC_007296	ATA	2	6	5101	5106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71902672
120	NC_007296	TTTA	2	8	5152	5159	25 %	75 %	0 %	0 %	71902672
121	NC_007296	A	6	6	5176	5181	100 %	0 %	0 %	0 %	71902672
122	NC_007296	ATT	2	6	5221	5226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71902673
123	NC_007296	ACC	2	6	5267	5272	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	71902673
124	NC_007296	GAT	2	6	5342	5347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71902673
125	NC_007296	A	9	9	5349	5357	100 %	0 %	0 %	0 %	71902673
126	NC_007296	TGA	2	6	5422	5427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71902673
127	NC_007296	T	6	6	5444	5449	0 %	100 %	0 %	0 %	71902673
128	NC_007296	TGA	2	6	5673	5678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71902673
129	NC_007296	T	6	6	5789	5794	0 %	100 %	0 %	0 %	71902673
130	NC_007296	GAT	2	6	5798	5803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71902673
131	NC_007296	AAC	2	6	5850	5855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71902673
132	NC_007296	TTA	2	6	5868	5873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71902673
133	NC_007296	GAT	2	6	5957	5962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71902673
134	NC_007296	A	6	6	5963	5968	100 %	0 %	0 %	0 %	71902673
135	NC_007296	AGA	2	6	5977	5982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71902673
136	NC_007296	A	6	6	5998	6003	100 %	0 %	0 %	0 %	71902673
137	NC_007296	ATT	2	6	6040	6045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71902673
138	NC_007296	ATT	2	6	6064	6069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71902673
139	NC_007296	T	6	6	6098	6103	0 %	100 %	0 %	0 %	71902673
140	NC_007296	GAT	2	6	6104	6109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71902673
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