MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sulfolobus acidocaldarius DSM 639 chromosome

Total Repeats: 47491

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_007181	TTCCT	2	10	281930	281939	0 %	60 %	0 %	40 %	70606168
6002	NC_007181	TCA	2	6	281982	281987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	70606168
6003	NC_007181	TACC	2	8	282136	282143	25 %	25 %	0 %	50 %	70606168
6004	NC_007181	CA	3	6	282167	282172	50 %	0 %	0 %	50 %	70606168
6005	NC_007181	CTC	2	6	282209	282214	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	70606168
6006	NC_007181	CAG	2	6	282217	282222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	70606168
6007	NC_007181	AAAGC	2	10	282240	282249	60 %	0 %	20 %	20 %	70606168
6008	NC_007181	CAC	2	6	282306	282311	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	70606168
6009	NC_007181	AAT	2	6	282316	282321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	70606168
6010	NC_007181	CTA	2	6	282322	282327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	70606168
6011	NC_007181	TCT	2	6	282371	282376	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	70606168
6012	NC_007181	AT	3	6	282398	282403	50 %	50 %	0 %	0 %	70606168
6013	NC_007181	GT	3	6	282439	282444	0 %	50 %	50 %	0 %	70606168
6014	NC_007181	CAG	2	6	282448	282453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	70606168
6015	NC_007181	ACAT	2	8	282507	282514	50 %	25 %	0 %	25 %	70606168
6016	NC_007181	AGT	2	6	282523	282528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70606168
6017	NC_007181	ACT	2	6	282531	282536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	70606168
6018	NC_007181	ATT	2	6	282573	282578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	70606168
6019	NC_007181	GTA	2	6	282607	282612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70606168
6020	NC_007181	TGA	2	6	282780	282785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70606168
6021	NC_007181	AATC	2	8	282799	282806	50 %	25 %	0 %	25 %	70606168
6022	NC_007181	ATG	2	6	282878	282883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70606168
6023	NC_007181	TGT	2	6	282893	282898	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	70606168
6024	NC_007181	TCC	2	6	282987	282992	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	70606168
6025	NC_007181	TA	3	6	282997	283002	50 %	50 %	0 %	0 %	70606168
6026	NC_007181	CTC	2	6	283004	283009	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	70606168
6027	NC_007181	GTACT	2	10	283035	283044	20 %	40 %	20 %	20 %	70606168
6028	NC_007181	TCC	2	6	283068	283073	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	70606168
6029	NC_007181	CTT	2	6	283124	283129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	70606168
6030	NC_007181	TTAT	2	8	283170	283177	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6031	NC_007181	TAA	2	6	283185	283190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6032	NC_007181	TAG	2	6	283260	283265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6033	NC_007181	GTA	2	6	283271	283276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6034	NC_007181	TAA	3	9	283318	283326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6035	NC_007181	GTA	2	6	283352	283357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6036	NC_007181	AAT	2	6	283398	283403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6037	NC_007181	ATT	2	6	283407	283412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6038	NC_007181	TTAAA	3	15	283464	283478	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6039	NC_007181	A	6	6	283476	283481	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6040	NC_007181	ACA	2	6	283499	283504	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6041	NC_007181	T	6	6	283520	283525	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6042	NC_007181	ATT	2	6	283588	283593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6043	NC_007181	A	6	6	283618	283623	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6044	NC_007181	TTA	2	6	283625	283630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6045	NC_007181	AT	5	10	283644	283653	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6046	NC_007181	A	7	7	283807	283813	100 %	0 %	0 %	0 %	70606169
6047	NC_007181	AGA	2	6	283858	283863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	70606169
6048	NC_007181	ATT	2	6	283885	283890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	70606169
6049	NC_007181	AGG	2	6	283939	283944	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	70606170
6050	NC_007181	AGG	2	6	283951	283956	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	70606170
6051	NC_007181	AAT	2	6	283960	283965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	70606170
6052	NC_007181	ACG	2	6	284040	284045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	70606170
6053	NC_007181	TAC	2	6	284054	284059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	70606170
6054	NC_007181	TTA	2	6	284072	284077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	70606170
6055	NC_007181	CCA	2	6	284096	284101	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	70606170
6056	NC_007181	A	6	6	284111	284116	100 %	0 %	0 %	0 %	70606170
6057	NC_007181	GTA	2	6	284201	284206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70606170
6058	NC_007181	CA	3	6	284223	284228	50 %	0 %	0 %	50 %	70606170
6059	NC_007181	ACT	2	6	284235	284240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	70606170
6060	NC_007181	AAC	2	6	284248	284253	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	70606170
6061	NC_007181	GAGTA	2	10	284256	284265	40 %	20 %	40 %	0 %	70606170
6062	NC_007181	TATGAA	2	12	284312	284323	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	70606170
6063	NC_007181	GA	3	6	284338	284343	50 %	0 %	50 %	0 %	70606170
6064	NC_007181	GGA	2	6	284363	284368	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	70606170
6065	NC_007181	TGA	2	6	284440	284445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70606170
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6069	NC_007181	AG	4	8	284557	284564	50 %	0 %	50 %	0 %	70606170
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6074	NC_007181	GGA	2	6	284906	284911	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	70606170
6075	NC_007181	TA	3	6	284924	284929	50 %	50 %	0 %	0 %	70606170
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6079	NC_007181	GA	3	6	285105	285110	50 %	0 %	50 %	0 %	70606171
6080	NC_007181	GCA	2	6	285126	285131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	70606171
6081	NC_007181	GTATTC	2	12	285168	285179	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	70606171
6082	NC_007181	A	6	6	285209	285214	100 %	0 %	0 %	0 %	70606171
6083	NC_007181	TCA	2	6	285240	285245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	70606171
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6085	NC_007181	AGA	2	6	285301	285306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	70606171
6086	NC_007181	TGCT	2	8	285326	285333	0 %	50 %	25 %	25 %	70606171
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6089	NC_007181	T	6	6	285486	285491	0 %	100 %	0 %	0 %	70606172
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6092	NC_007181	TA	3	6	285623	285628	50 %	50 %	0 %	0 %	70606172
6093	NC_007181	GAT	2	6	285656	285661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70606172
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6095	NC_007181	ATG	2	6	285876	285881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70606172
6096	NC_007181	GAT	2	6	285941	285946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70606172
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6100	NC_007181	GAT	2	6	286097	286102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70606172
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6102	NC_007181	GTCTC	2	10	286194	286203	0 %	40 %	20 %	40 %	70606172
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6105	NC_007181	TAT	2	6	286326	286331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	70606172
6106	NC_007181	TAT	2	6	286391	286396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6107	NC_007181	T	6	6	286396	286401	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6108	NC_007181	CTT	2	6	286447	286452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6109	NC_007181	GA	3	6	286492	286497	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6110	NC_007181	ATA	2	6	286520	286525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6111	NC_007181	TA	3	6	286540	286545	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6112	NC_007181	A	6	6	286547	286552	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6113	NC_007181	TC	3	6	286641	286646	0 %	50 %	0 %	50 %	70606173
6114	NC_007181	TA	3	6	286651	286656	50 %	50 %	0 %	0 %	70606173
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6125	NC_007181	CT	3	6	287302	287307	0 %	50 %	0 %	50 %	70606173
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6127	NC_007181	CA	3	6	287403	287408	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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