MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus haemolyticus JCSC1435 plasmid pSHaeB

Total Repeats: 61

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007170	A	7	7	50	56	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007170	AC	3	6	69	74	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_007170	CTTT	2	8	147	154	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_007170	T	6	6	152	157	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_007170	A	7	7	163	169	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_007170	TC	3	6	183	188	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_007170	AAT	2	6	202	207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_007170	TCA	2	6	241	246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_007170	AGG	2	6	293	298	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007170	A	6	6	299	304	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_007170	TTA	2	6	353	358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	68535048
12	NC_007170	ATA	2	6	368	373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	68535048
13	NC_007170	AAT	2	6	381	386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	68535048
14	NC_007170	ATA	2	6	413	418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	68535048
15	NC_007170	TTG	2	6	533	538	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	68535048
16	NC_007170	AT	3	6	569	574	50 %	50 %	0 %	0 %	68535048
17	NC_007170	ATA	2	6	646	651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	68535048
18	NC_007170	TGA	2	6	678	683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	68535048
19	NC_007170	ATTT	2	8	685	692	25 %	75 %	0 %	0 %	68535048
20	NC_007170	ATT	2	6	720	725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	68535048
21	NC_007170	ATT	2	6	747	752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	68535048
22	NC_007170	CCTAAA	2	12	811	822	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	68535048
23	NC_007170	A	7	7	852	858	100 %	0 %	0 %	0 %	68535048
24	NC_007170	CA	3	6	869	874	50 %	0 %	0 %	50 %	68535048
25	NC_007170	ATT	2	6	893	898	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	68535048
26	NC_007170	A	6	6	942	947	100 %	0 %	0 %	0 %	68535048
27	NC_007170	ATT	2	6	1038	1043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	68535048
28	NC_007170	TAA	2	6	1044	1049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	68535048
29	NC_007170	T	6	6	1103	1108	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_007170	CTT	2	6	1138	1143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_007170	TA	3	6	1147	1152	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_007170	AGCGA	2	10	1159	1168	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
33	NC_007170	AGC	2	6	1183	1188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_007170	TA	3	6	1317	1322	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_007170	AGA	2	6	1327	1332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_007170	GAT	2	6	1364	1369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_007170	TTTG	2	8	1385	1392	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_007170	T	10	10	1440	1449	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_007170	GAAA	2	8	1503	1510	75 %	0 %	25 %	0 %	68535049
40	NC_007170	GAA	2	6	1552	1557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	68535049
41	NC_007170	AAAC	2	8	1594	1601	75 %	0 %	0 %	25 %	68535049
42	NC_007170	AT	3	6	1623	1628	50 %	50 %	0 %	0 %	68535049
43	NC_007170	TAA	2	6	1637	1642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	68535049
44	NC_007170	A	7	7	1665	1671	100 %	0 %	0 %	0 %	68535049
45	NC_007170	ACAAT	2	10	1715	1724	60 %	20 %	0 %	20 %	68535049
46	NC_007170	ACA	2	6	1732	1737	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	68535049
47	NC_007170	TAA	2	6	1778	1783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	68535049
48	NC_007170	AGA	2	6	1800	1805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	68535049
49	NC_007170	ACT	2	6	1854	1859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	68535049
50	NC_007170	CGA	2	6	1869	1874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	68535049
51	NC_007170	CAAAAA	2	12	1876	1887	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	68535049
52	NC_007170	ATT	3	9	1955	1963	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	68535049
53	NC_007170	A	6	6	2006	2011	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_007170	A	6	6	2157	2162	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_007170	A	7	7	2170	2176	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_007170	CAT	2	6	2178	2183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_007170	TTGG	2	8	2245	2252	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_007170	GT	3	6	2268	2273	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_007170	CAAC	2	8	2316	2323	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_007170	AC	4	8	2342	2349	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_007170	CCAA	2	8	2356	2363	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.