MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus haemolyticus JCSC1435 plasmid pSHaeA

Total Repeats: 53

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007169	A	7	7	103	109	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007169	GGGA	2	8	110	117	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007169	GGT	2	6	248	253	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	68535044
4	NC_007169	GAA	2	6	272	277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	68535044
5	NC_007169	A	7	7	276	282	100 %	0 %	0 %	0 %	68535044
6	NC_007169	GAAA	2	8	370	377	75 %	0 %	25 %	0 %	68535044
7	NC_007169	TAGAGA	2	12	400	411	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	68535044
8	NC_007169	A	6	6	422	427	100 %	0 %	0 %	0 %	68535044
9	NC_007169	AT	3	6	431	436	50 %	50 %	0 %	0 %	68535044
10	NC_007169	AGA	2	6	484	489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	68535044
11	NC_007169	TTA	2	6	499	504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	68535044
12	NC_007169	TCT	2	6	585	590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_007169	TA	3	6	602	607	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_007169	T	6	6	620	625	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_007169	T	6	6	666	671	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_007169	GAAA	2	8	678	685	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_007169	A	6	6	697	702	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_007169	TAC	2	6	768	773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	68535045
19	NC_007169	AT	3	6	777	782	50 %	50 %	0 %	0 %	68535045
20	NC_007169	AAC	2	6	833	838	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	68535045
21	NC_007169	GA	3	6	846	851	50 %	0 %	50 %	0 %	68535045
22	NC_007169	TGA	2	6	957	962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	68535045
23	NC_007169	GAA	2	6	1069	1074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	68535045
24	NC_007169	GTT	2	6	1075	1080	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	68535045
25	NC_007169	GTTG	2	8	1100	1107	0 %	50 %	50 %	0 %	68535045
26	NC_007169	CAA	2	6	1121	1126	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	68535045
27	NC_007169	A	6	6	1204	1209	100 %	0 %	0 %	0 %	68535045
28	NC_007169	TAA	2	6	1257	1262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	68535045
29	NC_007169	A	6	6	1326	1331	100 %	0 %	0 %	0 %	68535045
30	NC_007169	CAAAC	2	10	1422	1431	60 %	0 %	0 %	40 %	68535045
31	NC_007169	AGC	2	6	1455	1460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	68535045
32	NC_007169	T	6	6	1500	1505	0 %	100 %	0 %	0 %	68535045
33	NC_007169	TGA	4	12	1509	1520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	68535045
34	NC_007169	TGG	2	6	1584	1589	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	68535045
35	NC_007169	TAAT	2	8	1646	1653	50 %	50 %	0 %	0 %	68535045
36	NC_007169	ACA	2	6	1672	1677	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	68535045
37	NC_007169	GAA	3	9	1681	1689	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	68535045
38	NC_007169	ATT	2	6	1733	1738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	68535045
39	NC_007169	T	7	7	1776	1782	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_007169	T	6	6	1787	1792	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_007169	T	6	6	1835	1840	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_007169	A	6	6	1880	1885	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_007169	TGTTT	2	10	1912	1921	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_007169	AT	4	8	1985	1992	50 %	50 %	0 %	0 %	68535046
45	NC_007169	AAC	2	6	2055	2060	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	68535046
46	NC_007169	A	6	6	2082	2087	100 %	0 %	0 %	0 %	68535046
47	NC_007169	TA	3	6	2113	2118	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_007169	A	7	7	2124	2130	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_007169	GAA	2	6	2166	2171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_007169	A	6	6	2170	2175	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_007169	AAAGAA	2	12	2201	2212	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_007169	A	6	6	2211	2216	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_007169	GAA	2	6	2257	2262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.