MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus haemolyticus JCSC1435 chromosome

Total Repeats: 64498

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007168	AGC	2	6	2	7	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_007168	T	7	7	26	32	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007168	CATT	2	8	46	53	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_007168	TCA	2	6	71	76	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_007168	ATT	2	6	123	128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_007168	TGT	2	6	138	143	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_007168	AGTT	2	8	153	160	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_007168	T	6	6	159	164	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_007168	ATA	2	6	208	213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007168	ATT	2	6	219	224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_007168	AAC	2	6	245	250	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_007168	TC	3	6	271	276	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_007168	GTC	2	6	306	311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_007168	ATT	2	6	318	323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_007168	ATTT	2	8	332	339	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_007168	TA	3	6	348	353	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_007168	AT	3	6	380	385	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_007168	TTA	2	6	404	409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_007168	ATT	2	6	421	426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_007168	ATT	2	6	438	443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_007168	AGA	2	6	489	494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_007168	TTTAT	2	10	500	509	20 %	80 %	0 %	0 %	70725002
23	NC_007168	A	6	6	529	534	100 %	0 %	0 %	0 %	70725002
24	NC_007168	T	6	6	582	587	0 %	100 %	0 %	0 %	70725002
25	NC_007168	ATC	2	6	628	633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	70725002
26	NC_007168	AAG	2	6	680	685	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	70725002
27	NC_007168	CTG	2	6	743	748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	70725002
28	NC_007168	TGA	2	6	765	770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70725002
29	NC_007168	TCAAT	2	10	843	852	40 %	40 %	0 %	20 %	70725002
30	NC_007168	GCA	2	6	907	912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	70725002
31	NC_007168	TA	3	6	960	965	50 %	50 %	0 %	0 %	70725002
32	NC_007168	TGG	2	6	966	971	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	70725002
33	NC_007168	ATGC	2	8	997	1004	25 %	25 %	25 %	25 %	70725002
34	NC_007168	TCA	2	6	1011	1016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	70725002
35	NC_007168	TA	3	6	1049	1054	50 %	50 %	0 %	0 %	70725002
36	NC_007168	TCA	2	6	1082	1087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	70725002
37	NC_007168	TGAT	2	8	1151	1158	25 %	50 %	25 %	0 %	70725002
38	NC_007168	AAG	2	6	1193	1198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	70725002
39	NC_007168	TTC	2	6	1201	1206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	70725002
40	NC_007168	AAG	2	6	1234	1239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	70725002
41	NC_007168	AGA	2	6	1287	1292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	70725002
42	NC_007168	CTC	2	6	1337	1342	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	70725002
43	NC_007168	TTC	2	6	1367	1372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	70725002
44	NC_007168	A	7	7	1375	1381	100 %	0 %	0 %	0 %	70725002
45	NC_007168	GAA	2	6	1384	1389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	70725002
46	NC_007168	CTG	2	6	1406	1411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	70725002
47	NC_007168	TCAA	2	8	1440	1447	50 %	25 %	0 %	25 %	70725002
48	NC_007168	TTGC	2	8	1480	1487	0 %	50 %	25 %	25 %	70725002
49	NC_007168	ATT	2	6	1549	1554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	70725002
50	NC_007168	A	7	7	1570	1576	100 %	0 %	0 %	0 %	70725002
51	NC_007168	ACT	2	6	1610	1615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	70725002
52	NC_007168	A	7	7	1644	1650	100 %	0 %	0 %	0 %	70725002
53	NC_007168	GAA	2	6	1735	1740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	70725002
54	NC_007168	GGT	2	6	1744	1749	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	70725002
55	NC_007168	AAG	2	6	1823	1828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	70725002
56	NC_007168	CAAT	2	8	1854	1861	50 %	25 %	0 %	25 %	70725002
57	NC_007168	ACA	2	6	1886	1891	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_007168	TTA	2	6	1933	1938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_007168	AAG	2	6	1945	1950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_007168	AAT	2	6	1952	1957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_007168	CTA	3	9	2096	2104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_007168	TA	3	6	2124	2129	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_007168	TA	4	8	2132	2139	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_007168	ATG	2	6	2164	2169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70725003
65	NC_007168	AGA	2	6	2182	2187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	70725003
66	NC_007168	ATT	2	6	2189	2194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	70725003
67	NC_007168	TTA	2	6	2195	2200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	70725003
68	NC_007168	AAC	2	6	2238	2243	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	70725003
69	NC_007168	TTC	2	6	2407	2412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	70725003
70	NC_007168	ATT	2	6	2419	2424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	70725003
71	NC_007168	A	6	6	2425	2430	100 %	0 %	0 %	0 %	70725003
72	NC_007168	CAA	2	6	2456	2461	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	70725003
73	NC_007168	TAC	2	6	2540	2545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	70725003
74	NC_007168	TGA	2	6	2559	2564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70725003
75	NC_007168	A	6	6	2592	2597	100 %	0 %	0 %	0 %	70725003
76	NC_007168	CAAA	2	8	2608	2615	75 %	0 %	0 %	25 %	70725003
77	NC_007168	TACT	2	8	2648	2655	25 %	50 %	0 %	25 %	70725003
78	NC_007168	AGA	2	6	2739	2744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	70725003
79	NC_007168	TCA	2	6	2765	2770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	70725003
80	NC_007168	TAAA	2	8	2795	2802	75 %	25 %	0 %	0 %	70725003
81	NC_007168	TTTA	2	8	2856	2863	25 %	75 %	0 %	0 %	70725003
82	NC_007168	TTA	2	6	2893	2898	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	70725003
83	NC_007168	ACA	2	6	2917	2922	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	70725003
84	NC_007168	AAATT	2	10	2945	2954	60 %	40 %	0 %	0 %	70725003
85	NC_007168	ATCG	2	8	2986	2993	25 %	25 %	25 %	25 %	70725003
86	NC_007168	CTT	2	6	2996	3001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	70725003
87	NC_007168	CAA	2	6	3021	3026	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	70725003
88	NC_007168	TTA	2	6	3029	3034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	70725003
89	NC_007168	ATG	2	6	3050	3055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70725003
90	NC_007168	ATC	2	6	3066	3071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	70725003
91	NC_007168	AGA	2	6	3099	3104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	70725003
92	NC_007168	TTTC	2	8	3143	3150	0 %	75 %	0 %	25 %	70725003
93	NC_007168	ATG	2	6	3163	3168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70725003
94	NC_007168	ATG	2	6	3191	3196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70725003
95	NC_007168	AAGTTG	2	12	3197	3208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70725003
96	NC_007168	AGA	2	6	3249	3254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	70725003
97	NC_007168	AATT	2	8	3269	3276	50 %	50 %	0 %	0 %	70725003
98	NC_007168	ACG	2	6	3323	3328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_007168	TTTAAA	2	12	3358	3369	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_007168	ATA	2	6	3424	3429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_007168	ATC	2	6	3431	3436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_007168	TTAAAA	2	12	3452	3463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_007168	CTA	2	6	3551	3556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_007168	A	6	6	3627	3632	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_007168	AT	3	6	3639	3644	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_007168	ATT	2	6	3670	3675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_007168	AAG	2	6	3683	3688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	70725004
108	NC_007168	TAG	2	6	3689	3694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70725004
109	NC_007168	ATT	2	6	3739	3744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	70725004
110	NC_007168	TAAT	2	8	3791	3798	50 %	50 %	0 %	0 %	70725004
111	NC_007168	A	6	6	3823	3828	100 %	0 %	0 %	0 %	70725004
112	NC_007168	ATT	2	6	3886	3891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	70725004
113	NC_007168	GAA	2	6	3948	3953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	70725005
114	NC_007168	A	6	6	4170	4175	100 %	0 %	0 %	0 %	70725005
115	NC_007168	AGA	2	6	4259	4264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	70725005
116	NC_007168	AGA	2	6	4381	4386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	70725005
117	NC_007168	CAA	2	6	4452	4457	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	70725005
118	NC_007168	TCA	2	6	4501	4506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	70725005
119	NC_007168	GA	4	8	4554	4561	50 %	0 %	50 %	0 %	70725005
120	NC_007168	GAT	2	6	4710	4715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70725005
121	NC_007168	GCA	2	6	4766	4771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	70725005
122	NC_007168	TTA	2	6	4845	4850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	70725005
123	NC_007168	GAT	2	6	4854	4859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70725005
124	NC_007168	GAT	2	6	4875	4880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70725005
125	NC_007168	AAC	3	9	4934	4942	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	70725005
126	NC_007168	AAT	2	6	4974	4979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	70725005
127	NC_007168	AATC	2	8	4994	5001	50 %	25 %	0 %	25 %	70725005
128	NC_007168	ACA	2	6	5056	5061	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	70725006
129	NC_007168	GTAT	2	8	5128	5135	25 %	50 %	25 %	0 %	70725006
130	NC_007168	CAC	2	6	5163	5168	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	70725006
131	NC_007168	CGA	2	6	5198	5203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	70725006
132	NC_007168	CAAAT	2	10	5221	5230	60 %	20 %	0 %	20 %	70725006
133	NC_007168	TTA	2	6	5236	5241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	70725006
134	NC_007168	A	6	6	5305	5310	100 %	0 %	0 %	0 %	70725006
135	NC_007168	GTC	2	6	5314	5319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	70725006
136	NC_007168	CAG	2	6	5320	5325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	70725006
137	NC_007168	TGG	2	6	5354	5359	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	70725006
138	NC_007168	CGG	2	6	5366	5371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	70725006
139	NC_007168	GGT	2	6	5391	5396	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	70725006
140	NC_007168	TTC	2	6	5411	5416	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	70725006
141	NC_007168	GTT	2	6	5418	5423	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	70725006
142	NC_007168	CTAT	2	8	5470	5477	25 %	50 %	0 %	25 %	70725006
143	NC_007168	A	6	6	5490	5495	100 %	0 %	0 %	0 %	70725006
144	NC_007168	GTAG	2	8	5523	5530	25 %	25 %	50 %	0 %	70725006
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169	NC_007168	TTC	2	6	6597	6602	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	70725006
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172	NC_007168	ATG	2	6	6834	6839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70725006
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174	NC_007168	AGG	2	6	7049	7054	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
175	NC_007168	TCAA	2	8	7077	7084	50 %	25 %	0 %	25 %	70725007
176	NC_007168	CGT	2	6	7201	7206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	70725007
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249	NC_007168	TAT	2	6	10900	10905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
250	NC_007168	ATT	2	6	10910	10915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
251	NC_007168	AATG	2	8	10920	10927	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
252	NC_007168	ATT	2	6	10983	10988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
253	NC_007168	TAA	2	6	11038	11043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
254	NC_007168	AATT	2	8	11074	11081	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
255	NC_007168	AG	3	6	11084	11089	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
256	NC_007168	ATTG	2	8	11113	11120	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
257	NC_007168	CTAC	2	8	11131	11138	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
258	NC_007168	AAC	2	6	11146	11151	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
259	NC_007168	TAA	2	6	11155	11160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
260	NC_007168	T	7	7	11262	11268	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
261	NC_007168	AAATT	2	10	11292	11301	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
262	NC_007168	AG	3	6	11352	11357	50 %	0 %	50 %	0 %	70725009
263	NC_007168	GAT	2	6	11397	11402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70725009
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267	NC_007168	GAA	2	6	11466	11471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	70725009
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270	NC_007168	GAC	2	6	11538	11543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	70725009
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408	NC_007168	CTT	2	6	18014	18019	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	70725014
409	NC_007168	GAT	2	6	18024	18029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70725014
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411	NC_007168	ATC	2	6	18124	18129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	70725014
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421	NC_007168	TTAA	2	8	18482	18489	50 %	50 %	0 %	0 %	70725015
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432	NC_007168	ACT	2	6	18887	18892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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498	NC_007168	A	6	6	22008	22013	100 %	0 %	0 %	0 %	70725017
499	NC_007168	GAA	2	6	22019	22024	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
500	NC_007168	TTG	2	6	22110	22115	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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