MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Choleraesuis str. SC-B67 chromosome

Total Repeats: 100226

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_006905	A	6	6	665059	665064	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14002	NC_006905	GGC	2	6	665088	665093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14003	NC_006905	TAT	2	6	665110	665115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14004	NC_006905	TTG	2	6	665186	665191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14005	NC_006905	ACT	2	6	665192	665197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62179165
14006	NC_006905	CAT	3	9	665213	665221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62179165
14007	NC_006905	TA	3	6	665229	665234	50 %	50 %	0 %	0 %	62179165
14008	NC_006905	AT	3	6	665317	665322	50 %	50 %	0 %	0 %	62179165
14009	NC_006905	TAACC	2	10	665364	665373	40 %	20 %	0 %	40 %	62179165
14010	NC_006905	TCA	2	6	665383	665388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62179165
14011	NC_006905	CAG	2	6	665432	665437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62179165
14012	NC_006905	TTA	2	6	665473	665478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62179165
14013	NC_006905	ATG	2	6	665560	665565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62179165
14014	NC_006905	TAA	2	6	665636	665641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	62179165
14015	NC_006905	CAA	2	6	665741	665746	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	62179165
14016	NC_006905	ACG	2	6	665747	665752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62179165
14017	NC_006905	T	7	7	665762	665768	0 %	100 %	0 %	0 %	62179165
14018	NC_006905	ATC	2	6	665800	665805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62179165
14019	NC_006905	CTG	2	6	665815	665820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62179165
14020	NC_006905	ATC	2	6	665824	665829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62179165
14021	NC_006905	GAT	2	6	665880	665885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62179165
14022	NC_006905	CAA	2	6	665888	665893	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	62179165
14023	NC_006905	AAT	2	6	665975	665980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	62179165
14024	NC_006905	CTA	2	6	665984	665989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62179165
14025	NC_006905	ACA	2	6	666010	666015	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	62179165
14026	NC_006905	CAA	2	6	666017	666022	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	62179165
14027	NC_006905	CAA	2	6	666077	666082	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	62179165
14028	NC_006905	AAC	2	6	666087	666092	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	62179165
14029	NC_006905	TAG	2	6	666109	666114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62179165
14030	NC_006905	TG	3	6	666180	666185	0 %	50 %	50 %	0 %	62179165
14031	NC_006905	ATA	2	6	666361	666366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	62179165
14032	NC_006905	ACAT	2	8	666394	666401	50 %	25 %	0 %	25 %	62179165
14033	NC_006905	TTTA	2	8	666636	666643	25 %	75 %	0 %	0 %	62179165
14034	NC_006905	TTC	2	6	666650	666655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62179166
14035	NC_006905	AT	3	6	666665	666670	50 %	50 %	0 %	0 %	62179166
14036	NC_006905	TTC	2	6	666699	666704	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62179166
14037	NC_006905	CCA	2	6	666746	666751	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	62179166
14038	NC_006905	AAC	2	6	666991	666996	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	62179166
14039	NC_006905	CCAAC	2	10	667010	667019	40 %	0 %	0 %	60 %	62179166
14040	NC_006905	TTAAT	2	10	667056	667065	40 %	60 %	0 %	0 %	62179166
14041	NC_006905	TAT	2	6	667137	667142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62179166
14042	NC_006905	ATT	2	6	667412	667417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62179166
14043	NC_006905	CGT	2	6	667440	667445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62179166
14044	NC_006905	TGA	2	6	667446	667451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62179166
14045	NC_006905	CTT	2	6	667524	667529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62179166
14046	NC_006905	GGC	2	6	667648	667653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62179167
14047	NC_006905	CAA	2	6	667679	667684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	62179167
14048	NC_006905	CAT	2	6	667716	667721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62179167
14049	NC_006905	GTG	3	9	667732	667740	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62179167
14050	NC_006905	GC	3	6	667758	667763	0 %	0 %	50 %	50 %	62179167
14051	NC_006905	AC	3	6	667841	667846	50 %	0 %	0 %	50 %	62179167
14052	NC_006905	CGAT	2	8	667889	667896	25 %	25 %	25 %	25 %	62179167
14053	NC_006905	AAT	2	6	667994	667999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14054	NC_006905	TAT	2	6	668030	668035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14055	NC_006905	GTT	2	6	668045	668050	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14056	NC_006905	AC	3	6	668101	668106	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14057	NC_006905	TTG	2	6	668184	668189	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14058	NC_006905	GC	3	6	668249	668254	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14059	NC_006905	CTC	2	6	668372	668377	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	62179168
14060	NC_006905	ATT	2	6	668408	668413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62179168
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14062	NC_006905	GTC	2	6	668447	668452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62179168
14063	NC_006905	TCA	2	6	668548	668553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62179168
14064	NC_006905	A	7	7	668621	668627	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14065	NC_006905	TAA	2	6	668679	668684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14066	NC_006905	ATA	2	6	668690	668695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14067	NC_006905	ATT	2	6	668745	668750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14068	NC_006905	GC	3	6	668830	668835	0 %	0 %	50 %	50 %	62179169
14069	NC_006905	GGGA	2	8	668930	668937	25 %	0 %	75 %	0 %	62179169
14070	NC_006905	CAA	2	6	669005	669010	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	62179169
14071	NC_006905	GTC	2	6	669024	669029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62179169
14072	NC_006905	CTT	2	6	669032	669037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62179169
14073	NC_006905	GGC	2	6	669064	669069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62179169
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14075	NC_006905	GCA	2	6	669113	669118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62179169
14076	NC_006905	CAG	2	6	669139	669144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14077	NC_006905	TGA	2	6	669310	669315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14078	NC_006905	TCA	2	6	669346	669351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14079	NC_006905	TCG	2	6	669389	669394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14082	NC_006905	ATCACC	2	12	669522	669533	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	62179170
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14087	NC_006905	CTG	2	6	669821	669826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62179170
14088	NC_006905	CTG	2	6	669869	669874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62179170
14089	NC_006905	GGC	2	6	669887	669892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62179170
14090	NC_006905	GCG	3	9	669919	669927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62179170
14091	NC_006905	CGT	2	6	669974	669979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62179170
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14094	NC_006905	CGC	2	6	670189	670194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62179170
14095	NC_006905	ATTT	2	8	670281	670288	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14096	NC_006905	A	6	6	670390	670395	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14097	NC_006905	TTAT	2	8	670430	670437	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14098	NC_006905	AGA	2	6	670475	670480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62179171
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14102	NC_006905	ATG	2	6	670646	670651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62179171
14103	NC_006905	GCG	2	6	670693	670698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62179171
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14105	NC_006905	TTA	2	6	670850	670855	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62179171
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14107	NC_006905	G	8	8	670909	670916	0 %	0 %	100 %	0 %	62179171
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14114	NC_006905	GAAC	2	8	671283	671290	50 %	0 %	25 %	25 %	62179171
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14119	NC_006905	GAT	2	6	671392	671397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62179171
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14124	NC_006905	GGT	2	6	671547	671552	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62179171
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14492	NC_006905	ACG	2	6	688991	688996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62179189
14493	NC_006905	CGC	2	6	689039	689044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62179189
14494	NC_006905	ATC	2	6	689081	689086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62179189
14495	NC_006905	CGG	2	6	689175	689180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62179189
14496	NC_006905	GAT	2	6	689218	689223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62179189
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14498	NC_006905	GCGCT	2	10	689287	689296	0 %	20 %	40 %	40 %	62179189
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14500	NC_006905	TGC	2	6	689312	689317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62179189

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