MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Choleraesuis str. SC-B67 chromosome

Total Repeats: 100226

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_006905	TCAGAT	2	12	640509	640520	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	62179142
13502	NC_006905	ATC	2	6	640622	640627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62179142
13503	NC_006905	ACTG	2	8	640695	640702	25 %	25 %	25 %	25 %	62179142
13504	NC_006905	CG	3	6	640743	640748	0 %	0 %	50 %	50 %	62179142
13505	NC_006905	CGCCTG	2	12	640852	640863	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	62179142
13506	NC_006905	GC	5	10	640964	640973	0 %	0 %	50 %	50 %	62179142
13507	NC_006905	CAA	2	6	641013	641018	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	62179142
13508	NC_006905	CG	3	6	641062	641067	0 %	0 %	50 %	50 %	62179142
13509	NC_006905	CGT	2	6	641088	641093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62179142
13510	NC_006905	GCC	2	6	641095	641100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62179142
13511	NC_006905	TAA	2	6	641112	641117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	62179142
13512	NC_006905	TCG	2	6	641156	641161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62179142
13513	NC_006905	CAG	2	6	641170	641175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62179142
13514	NC_006905	GAT	2	6	641239	641244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62179142
13515	NC_006905	GC	3	6	641278	641283	0 %	0 %	50 %	50 %	62179142
13516	NC_006905	CTG	2	6	641341	641346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62179142
13517	NC_006905	CGG	2	6	641355	641360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62179142
13518	NC_006905	GCA	2	6	641421	641426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62179142
13519	NC_006905	CGT	2	6	641552	641557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62179143
13520	NC_006905	GCG	2	6	641587	641592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62179143
13521	NC_006905	CG	3	6	641639	641644	0 %	0 %	50 %	50 %	62179143
13522	NC_006905	CGC	2	6	641675	641680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62179143
13523	NC_006905	AGCGC	2	10	641683	641692	20 %	0 %	40 %	40 %	62179143
13524	NC_006905	GCGCC	2	10	641753	641762	0 %	0 %	40 %	60 %	62179143
13525	NC_006905	AAT	2	6	641775	641780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	62179143
13526	NC_006905	CCG	2	6	641801	641806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62179143
13527	NC_006905	CGG	2	6	641894	641899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62179143
13528	NC_006905	ATT	2	6	641958	641963	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62179143
13529	NC_006905	GCT	2	6	642006	642011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13530	NC_006905	CGA	2	6	642083	642088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13531	NC_006905	ATG	2	6	642153	642158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62179144
13532	NC_006905	CCG	2	6	642215	642220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62179144
13533	NC_006905	GGTG	2	8	642224	642231	0 %	25 %	75 %	0 %	62179144
13534	NC_006905	CGA	2	6	642275	642280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62179144
13535	NC_006905	ATA	2	6	642301	642306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	62179144
13536	NC_006905	TGC	2	6	642317	642322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62179144
13537	NC_006905	GGC	2	6	642327	642332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62179144
13538	NC_006905	GC	3	6	642343	642348	0 %	0 %	50 %	50 %	62179144
13539	NC_006905	GGC	2	6	642354	642359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62179144
13540	NC_006905	CGG	3	9	642364	642372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62179144
13541	NC_006905	CAT	2	6	642449	642454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62179144
13542	NC_006905	AAG	2	6	642592	642597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62179144
13543	NC_006905	GTC	3	9	642663	642671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62179144
13544	NC_006905	A	6	6	642739	642744	100 %	0 %	0 %	0 %	62179144
13545	NC_006905	CGA	2	6	642758	642763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62179144
13546	NC_006905	TTC	2	6	642771	642776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62179144
13547	NC_006905	ATG	2	6	642843	642848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62179145
13548	NC_006905	TCT	2	6	642852	642857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62179145
13549	NC_006905	TGA	2	6	643012	643017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62179145
13550	NC_006905	TTG	2	6	643092	643097	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62179145
13551	NC_006905	TGG	2	6	643120	643125	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62179145
13552	NC_006905	GCC	3	9	643151	643159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62179145
13553	NC_006905	GTT	2	6	643199	643204	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62179145
13554	NC_006905	AGT	2	6	643222	643227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62179145
13555	NC_006905	ATC	2	6	643259	643264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62179145
13556	NC_006905	AG	3	6	643330	643335	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13557	NC_006905	TGC	2	6	643414	643419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13558	NC_006905	TAT	2	6	643439	643444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13559	NC_006905	AC	3	6	643445	643450	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13560	NC_006905	CA	3	6	643460	643465	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13561	NC_006905	GT	3	6	643563	643568	0 %	50 %	50 %	0 %	62179146
13562	NC_006905	CG	3	6	643634	643639	0 %	0 %	50 %	50 %	62179146
13563	NC_006905	CGA	2	6	643694	643699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62179146
13564	NC_006905	ATT	2	6	643704	643709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62179146
13565	NC_006905	GATGT	2	10	643905	643914	20 %	40 %	40 %	0 %	62179146
13566	NC_006905	ACCG	2	8	643922	643929	25 %	0 %	25 %	50 %	62179146
13567	NC_006905	AGC	2	6	643966	643971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62179146
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13569	NC_006905	CG	4	8	643982	643989	0 %	0 %	50 %	50 %	62179146
13570	NC_006905	CGAGC	2	10	644054	644063	20 %	0 %	40 %	40 %	62179146
13571	NC_006905	CGG	3	9	644156	644164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62179146
13572	NC_006905	GC	3	6	644215	644220	0 %	0 %	50 %	50 %	62179146
13573	NC_006905	ACT	2	6	644239	644244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62179146
13574	NC_006905	ATGGTG	2	12	644259	644270	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	62179146
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13576	NC_006905	TAC	2	6	644331	644336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62179146
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13578	NC_006905	CGG	2	6	644479	644484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62179146
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13580	NC_006905	ATGA	2	8	644520	644527	50 %	25 %	25 %	0 %	62179146
13581	NC_006905	CCG	2	6	644608	644613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62179146
13582	NC_006905	CTG	2	6	644661	644666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62179146
13583	NC_006905	GCG	2	6	644695	644700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62179146
13584	NC_006905	GCG	3	9	644781	644789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62179146
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13586	NC_006905	TAT	2	6	644822	644827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62179146
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13589	NC_006905	GTAA	2	8	644863	644870	50 %	25 %	25 %	0 %	62179146
13590	NC_006905	T	6	6	644910	644915	0 %	100 %	0 %	0 %	62179147
13591	NC_006905	T	6	6	644917	644922	0 %	100 %	0 %	0 %	62179147
13592	NC_006905	AC	4	8	644942	644949	50 %	0 %	0 %	50 %	62179147
13593	NC_006905	CGC	2	6	645024	645029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62179147
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13595	NC_006905	CTG	2	6	645063	645068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62179147
13596	NC_006905	TCG	2	6	645074	645079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62179147
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13598	NC_006905	CAT	2	6	645180	645185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62179147
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13600	NC_006905	TCA	2	6	645398	645403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62179147
13601	NC_006905	TA	3	6	645427	645432	50 %	50 %	0 %	0 %	62179147
13602	NC_006905	TGGC	2	8	645493	645500	0 %	25 %	50 %	25 %	62179147
13603	NC_006905	GAC	2	6	645571	645576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62179147
13604	NC_006905	GCT	2	6	645597	645602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62179147
13605	NC_006905	CGT	2	6	645773	645778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62179148
13606	NC_006905	T	6	6	645813	645818	0 %	100 %	0 %	0 %	62179148
13607	NC_006905	T	6	6	645845	645850	0 %	100 %	0 %	0 %	62179148
13608	NC_006905	CTT	2	6	645884	645889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62179148
13609	NC_006905	GAC	2	6	645891	645896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62179148
13610	NC_006905	T	6	6	645959	645964	0 %	100 %	0 %	0 %	62179148
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13612	NC_006905	GCA	2	6	646007	646012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62179148
13613	NC_006905	CCAG	2	8	646086	646093	25 %	0 %	25 %	50 %	62179148
13614	NC_006905	TTC	2	6	646104	646109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62179148
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13617	NC_006905	ACC	2	6	646381	646386	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	62179149
13618	NC_006905	CAG	2	6	646402	646407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62179149
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13620	NC_006905	CAGC	2	8	646438	646445	25 %	0 %	25 %	50 %	62179149
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