MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Choleraesuis str. SC-B67 chromosome

Total Repeats: 100226

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_006905	GAA	2	6	547033	547038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62179059
11502	NC_006905	CGT	2	6	547048	547053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62179059
11503	NC_006905	CTG	2	6	547066	547071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62179059
11504	NC_006905	GAA	2	6	547111	547116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62179059
11505	NC_006905	AAG	2	6	547166	547171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62179059
11506	NC_006905	GAA	2	6	547231	547236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62179059
11507	NC_006905	CTTC	2	8	547286	547293	0 %	50 %	0 %	50 %	62179059
11508	NC_006905	TGA	2	6	547301	547306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62179059
11509	NC_006905	CAG	2	6	547309	547314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62179059
11510	NC_006905	T	9	9	547378	547386	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11511	NC_006905	CAG	2	6	547532	547537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11512	NC_006905	T	6	6	547539	547544	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11513	NC_006905	ATCT	2	8	547784	547791	25 %	50 %	0 %	25 %	162139608
11514	NC_006905	GGC	2	6	547808	547813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162139608
11515	NC_006905	TTA	2	6	547854	547859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162139608
11516	NC_006905	GGC	2	6	547891	547896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162139608
11517	NC_006905	CTG	2	6	547913	547918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162139608
11518	NC_006905	CCA	2	6	547972	547977	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162139608
11519	NC_006905	GGC	2	6	547985	547990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162139608
11520	NC_006905	ATGA	2	8	548054	548061	50 %	25 %	25 %	0 %	162139608
11521	NC_006905	CAT	2	6	548072	548077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162139608
11522	NC_006905	GTTG	2	8	548245	548252	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11523	NC_006905	GC	3	6	548256	548261	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11524	NC_006905	ACTT	2	8	548271	548278	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11525	NC_006905	GCC	2	6	548307	548312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11526	NC_006905	TA	3	6	548338	548343	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11527	NC_006905	GGC	2	6	548353	548358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11528	NC_006905	CGT	3	9	548399	548407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11529	NC_006905	AGA	2	6	548426	548431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11530	NC_006905	TTG	2	6	548476	548481	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62179061
11531	NC_006905	CGA	2	6	548553	548558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62179061
11532	NC_006905	ATT	2	6	548581	548586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62179061
11533	NC_006905	GAA	2	6	548590	548595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62179061
11534	NC_006905	AAG	2	6	548600	548605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62179061
11535	NC_006905	CGC	2	6	548639	548644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62179061
11536	NC_006905	A	6	6	548695	548700	100 %	0 %	0 %	0 %	62179061
11537	NC_006905	TGGCGG	2	12	548705	548716	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	62179061
11538	NC_006905	CTG	2	6	548788	548793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62179061
11539	NC_006905	GACC	2	8	548798	548805	25 %	0 %	25 %	50 %	62179061
11540	NC_006905	GCT	2	6	548820	548825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62179061
11541	NC_006905	GC	3	6	548839	548844	0 %	0 %	50 %	50 %	62179061
11542	NC_006905	ACG	2	6	548954	548959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62179061
11543	NC_006905	TGA	2	6	548991	548996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62179061
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11545	NC_006905	CGC	2	6	549099	549104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62179061
11546	NC_006905	GCA	2	6	549135	549140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62179061
11547	NC_006905	GCG	3	9	549182	549190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62179061
11548	NC_006905	TGT	2	6	549299	549304	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62179061
11549	NC_006905	GTC	2	6	549359	549364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62179061
11550	NC_006905	TGAA	2	8	549383	549390	50 %	25 %	25 %	0 %	62179061
11551	NC_006905	GAA	2	6	549397	549402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62179061
11552	NC_006905	TCG	2	6	549566	549571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62179061
11553	NC_006905	GCG	2	6	549574	549579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62179061
11554	NC_006905	CTG	2	6	549580	549585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62179061
11555	NC_006905	GTG	2	6	549628	549633	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62179061
11556	NC_006905	CGA	2	6	549636	549641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62179061
11557	NC_006905	AAT	2	6	549710	549715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	62179061
11558	NC_006905	A	6	6	549741	549746	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11559	NC_006905	G	6	6	549747	549752	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11560	NC_006905	TG	3	6	549796	549801	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11561	NC_006905	GGT	2	6	549836	549841	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11562	NC_006905	ACTAA	2	10	549879	549888	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
11563	NC_006905	GA	3	6	549889	549894	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11564	NC_006905	TGG	2	6	549955	549960	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62179062
11565	NC_006905	A	7	7	550041	550047	100 %	0 %	0 %	0 %	62179062
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11567	NC_006905	GC	4	8	550187	550194	0 %	0 %	50 %	50 %	62179062
11568	NC_006905	GCCA	2	8	550256	550263	25 %	0 %	25 %	50 %	62179062
11569	NC_006905	TGA	2	6	550265	550270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62179062
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11571	NC_006905	A	7	7	550335	550341	100 %	0 %	0 %	0 %	62179062
11572	NC_006905	CCG	2	6	550344	550349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62179062
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11584	NC_006905	TAAA	2	8	550930	550937	75 %	25 %	0 %	0 %	62179062
11585	NC_006905	TGG	2	6	550960	550965	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62179062
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11595	NC_006905	GCT	2	6	551339	551344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62179062
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11599	NC_006905	TAT	2	6	551489	551494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62179062
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11601	NC_006905	CG	3	6	551661	551666	0 %	0 %	50 %	50 %	62179062
11602	NC_006905	GCG	2	6	551719	551724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62179062
11603	NC_006905	GCTC	2	8	551782	551789	0 %	25 %	25 %	50 %	62179062
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11606	NC_006905	GC	4	8	551838	551845	0 %	0 %	50 %	50 %	62179062
11607	NC_006905	CCTG	2	8	551968	551975	0 %	25 %	25 %	50 %	62179062
11608	NC_006905	GC	3	6	551990	551995	0 %	0 %	50 %	50 %	62179062
11609	NC_006905	CGG	2	6	552047	552052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62179062
11610	NC_006905	GAAA	2	8	552056	552063	75 %	0 %	25 %	0 %	62179062
11611	NC_006905	GGC	2	6	552071	552076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62179062
11612	NC_006905	CGG	2	6	552083	552088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62179062
11613	NC_006905	GGA	2	6	552131	552136	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	62179062
11614	NC_006905	TAA	2	6	552275	552280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11615	NC_006905	T	7	7	552317	552323	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11616	NC_006905	CCA	2	6	552356	552361	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11617	NC_006905	CTG	2	6	552400	552405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11618	NC_006905	GAAGA	2	10	552453	552462	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
11619	NC_006905	A	6	6	552485	552490	100 %	0 %	0 %	0 %	62179063
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11991	NC_006905	CAG	2	6	569728	569733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62179080
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