MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Choleraesuis str. SC-B67 chromosome

Total Repeats: 100226

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_006905	GCA	2	6	523821	523826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62179037
11002	NC_006905	CCA	2	6	523836	523841	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	62179037
11003	NC_006905	GCGCC	2	10	523854	523863	0 %	0 %	40 %	60 %	62179037
11004	NC_006905	CGGT	2	8	523880	523887	0 %	25 %	50 %	25 %	62179037
11005	NC_006905	CGT	2	6	523912	523917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62179037
11006	NC_006905	CGG	2	6	523924	523929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62179037
11007	NC_006905	ATC	3	9	523934	523942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62179037
11008	NC_006905	CAGCGC	2	12	523978	523989	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	62179037
11009	NC_006905	CAT	2	6	523993	523998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62179037
11010	NC_006905	CGACG	2	10	524062	524071	20 %	0 %	40 %	40 %	62179037
11011	NC_006905	CGG	2	6	524082	524087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62179037
11012	NC_006905	CAGCGC	2	12	524302	524313	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	62179037
11013	NC_006905	CGC	2	6	524322	524327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62179037
11014	NC_006905	CAG	2	6	524329	524334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62179037
11015	NC_006905	CTG	2	6	524455	524460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62179037
11016	NC_006905	CGCC	2	8	524532	524539	0 %	0 %	25 %	75 %	62179037
11017	NC_006905	GCC	2	6	524599	524604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62179038
11018	NC_006905	GACAA	2	10	524632	524641	60 %	0 %	20 %	20 %	62179038
11019	NC_006905	CAT	2	6	524706	524711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62179038
11020	NC_006905	CAG	2	6	524775	524780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62179038
11021	NC_006905	CCA	2	6	524791	524796	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	62179038
11022	NC_006905	GCC	2	6	524815	524820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62179038
11023	NC_006905	GCTG	2	8	524868	524875	0 %	25 %	50 %	25 %	62179038
11024	NC_006905	CGG	2	6	524994	524999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62179038
11025	NC_006905	TCA	2	6	525020	525025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62179038
11026	NC_006905	ATAA	2	8	525054	525061	75 %	25 %	0 %	0 %	62179038
11027	NC_006905	CGA	2	6	525110	525115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62179038
11028	NC_006905	CAG	3	9	525180	525188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62179038
11029	NC_006905	CGG	2	6	525194	525199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62179038
11030	NC_006905	CCAGCA	2	12	525353	525364	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	62179038
11031	NC_006905	AGC	3	9	525370	525378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62179038
11032	NC_006905	CAG	2	6	525381	525386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62179038
11033	NC_006905	CAT	2	6	525457	525462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62179039
11034	NC_006905	CG	3	6	525496	525501	0 %	0 %	50 %	50 %	62179039
11035	NC_006905	CA	3	6	525553	525558	50 %	0 %	0 %	50 %	62179039
11036	NC_006905	AGT	2	6	525666	525671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62179039
11037	NC_006905	TTG	2	6	525672	525677	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62179039
11038	NC_006905	GTG	2	6	525683	525688	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62179039
11039	NC_006905	CG	3	6	525704	525709	0 %	0 %	50 %	50 %	62179039
11040	NC_006905	CCG	2	6	525720	525725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62179039
11041	NC_006905	GA	3	6	525777	525782	50 %	0 %	50 %	0 %	62179039
11042	NC_006905	GC	3	6	525838	525843	0 %	0 %	50 %	50 %	62179039
11043	NC_006905	TTC	2	6	525977	525982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62179039
11044	NC_006905	CG	3	6	526042	526047	0 %	0 %	50 %	50 %	62179039
11045	NC_006905	CG	3	6	526061	526066	0 %	0 %	50 %	50 %	62179039
11046	NC_006905	TGC	2	6	526083	526088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62179039
11047	NC_006905	GCC	2	6	526091	526096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62179039
11048	NC_006905	GCG	2	6	526119	526124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62179039
11049	NC_006905	ATTA	2	8	526169	526176	50 %	50 %	0 %	0 %	62179039
11050	NC_006905	GCT	2	6	526186	526191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62179039
11051	NC_006905	CAC	2	6	526259	526264	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	62179039
11052	NC_006905	CGCA	2	8	526358	526365	25 %	0 %	25 %	50 %	62179039
11053	NC_006905	CGT	2	6	526370	526375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62179039
11054	NC_006905	AG	3	6	526433	526438	50 %	0 %	50 %	0 %	62179039
11055	NC_006905	CAC	2	6	526448	526453	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	62179039
11056	NC_006905	CGG	2	6	526525	526530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62179039
11057	NC_006905	TCA	2	6	526537	526542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62179039
11058	NC_006905	GGC	2	6	526660	526665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62179040
11059	NC_006905	TCG	2	6	526676	526681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62179040
11060	NC_006905	CTT	2	6	526743	526748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62179040
11061	NC_006905	CAG	2	6	526753	526758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62179040
11062	NC_006905	GCG	2	6	526791	526796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62179040
11063	NC_006905	GC	3	6	526833	526838	0 %	0 %	50 %	50 %	62179040
11064	NC_006905	GGCC	2	8	526858	526865	0 %	0 %	50 %	50 %	62179040
11065	NC_006905	AGA	2	6	526866	526871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62179040
11066	NC_006905	TTA	2	6	526946	526951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62179040
11067	NC_006905	GCA	2	6	527061	527066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62179040
11068	NC_006905	CAG	2	6	527167	527172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62179040
11069	NC_006905	TGT	2	6	527178	527183	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62179040
11070	NC_006905	GCG	2	6	527211	527216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62179040
11071	NC_006905	GTT	2	6	527224	527229	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62179040
11072	NC_006905	GCG	2	6	527249	527254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62179040
11073	NC_006905	CAG	2	6	527272	527277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62179040
11074	NC_006905	CGG	3	9	527283	527291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62179040
11075	NC_006905	TGAA	2	8	527297	527304	50 %	25 %	25 %	0 %	62179040
11076	NC_006905	GGC	2	6	527306	527311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62179040
11077	NC_006905	CCA	2	6	527375	527380	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	62179040
11078	NC_006905	CAT	2	6	527460	527465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62179040
11079	NC_006905	ACC	2	6	527492	527497	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	62179040
11080	NC_006905	AGAC	2	8	527532	527539	50 %	0 %	25 %	25 %	62179040
11081	NC_006905	AAAT	2	8	527658	527665	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11082	NC_006905	GAT	2	6	527678	527683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11083	NC_006905	ACGAT	2	10	527710	527719	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
11084	NC_006905	ATCCAG	2	12	527814	527825	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	62179041
11085	NC_006905	GCA	2	6	527858	527863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62179041
11086	NC_006905	ATGC	2	8	527940	527947	25 %	25 %	25 %	25 %	62179041
11087	NC_006905	GCA	2	6	528011	528016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62179041
11088	NC_006905	CGGG	2	8	528028	528035	0 %	0 %	75 %	25 %	62179041
11089	NC_006905	CAG	2	6	528093	528098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62179041
11090	NC_006905	GCTGGA	2	12	528116	528127	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	62179041
11091	NC_006905	GGT	2	6	528153	528158	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62179041
11092	NC_006905	CGC	2	6	528164	528169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62179041
11093	NC_006905	AACC	2	8	528268	528275	50 %	0 %	0 %	50 %	62179041
11094	NC_006905	CGA	2	6	528277	528282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62179041
11095	NC_006905	GC	3	6	528286	528291	0 %	0 %	50 %	50 %	62179041
11096	NC_006905	GTG	2	6	528346	528351	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62179041
11097	NC_006905	TGCC	2	8	528501	528508	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11098	NC_006905	T	6	6	528532	528537	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11099	NC_006905	CTG	3	9	528640	528648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62179042
11100	NC_006905	CAC	2	6	528663	528668	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	62179042
11101	NC_006905	AAG	2	6	528683	528688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62179042
11102	NC_006905	TGT	2	6	528692	528697	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62179042
11103	NC_006905	GAT	3	9	528715	528723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62179042
11104	NC_006905	CAG	2	6	528754	528759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62179042
11105	NC_006905	GGCAGC	2	12	528811	528822	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	62179042
11106	NC_006905	GGCC	2	8	528918	528925	0 %	0 %	50 %	50 %	62179042
11107	NC_006905	GCG	2	6	528956	528961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62179042
11108	NC_006905	GC	3	6	528967	528972	0 %	0 %	50 %	50 %	62179042
11109	NC_006905	CCGAC	2	10	529007	529016	20 %	0 %	20 %	60 %	62179042
11110	NC_006905	ACC	2	6	529051	529056	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	62179042
11111	NC_006905	TGA	2	6	529074	529079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62179042
11112	NC_006905	AGC	2	6	529132	529137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62179042
11113	NC_006905	CGG	2	6	529140	529145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62179042
11114	NC_006905	GCA	2	6	529162	529167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62179042
11115	NC_006905	CGCT	2	8	529279	529286	0 %	25 %	25 %	50 %	62179042
11116	NC_006905	GGA	2	6	529320	529325	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	62179042
11117	NC_006905	GAA	2	6	529402	529407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62179042
11118	NC_006905	GTGGC	2	10	529409	529418	0 %	20 %	60 %	20 %	62179042
11119	NC_006905	TCA	2	6	529425	529430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62179042
11120	NC_006905	TGG	2	6	529457	529462	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62179042
11121	NC_006905	GCT	2	6	529491	529496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62179042
11122	NC_006905	CGC	2	6	529576	529581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62179042
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11124	NC_006905	GCC	2	6	529666	529671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62179042
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11128	NC_006905	ACC	2	6	529774	529779	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	62179043
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11143	NC_006905	CGC	2	6	530619	530624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11144	NC_006905	GTA	2	6	530647	530652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62179044
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11182	NC_006905	TCC	2	6	532109	532114	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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11186	NC_006905	GAA	2	6	532222	532227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11194	NC_006905	CGC	2	6	532745	532750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11195	NC_006905	GTC	2	6	532907	532912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62179047
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11221	NC_006905	AGT	2	6	534158	534163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11222	NC_006905	A	6	6	534235	534240	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11223	NC_006905	TCAT	2	8	534296	534303	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11224	NC_006905	TGGC	2	8	534456	534463	0 %	25 %	50 %	25 %	62179048
11225	NC_006905	GGTG	2	8	534465	534472	0 %	25 %	75 %	0 %	62179048
11226	NC_006905	TTTGC	2	10	534483	534492	0 %	60 %	20 %	20 %	62179048
11227	NC_006905	TCT	2	6	534539	534544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11228	NC_006905	CAA	2	6	534561	534566	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11229	NC_006905	GC	3	6	534600	534605	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11230	NC_006905	TCA	2	6	534627	534632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11232	NC_006905	TAT	2	6	534646	534651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11233	NC_006905	AAATT	2	10	534674	534683	60 %	40 %	0 %	0 %	62179049
11234	NC_006905	AAC	2	6	534742	534747	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	62179049
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11237	NC_006905	ATTG	2	8	535032	535039	25 %	50 %	25 %	0 %	62179049
11238	NC_006905	AT	3	6	535047	535052	50 %	50 %	0 %	0 %	62179049
11239	NC_006905	GCGG	2	8	535113	535120	0 %	0 %	75 %	25 %	62179049
11240	NC_006905	TTA	2	6	535124	535129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62179049
11241	NC_006905	ATA	2	6	535151	535156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	62179049
11242	NC_006905	T	8	8	535175	535182	0 %	100 %	0 %	0 %	62179049
11243	NC_006905	A	6	6	535205	535210	100 %	0 %	0 %	0 %	62179049
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11245	NC_006905	GGCC	2	8	535328	535335	0 %	0 %	50 %	50 %	62179049
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11291	NC_006905	GTC	2	6	537375	537380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62179050
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11342	NC_006905	TCA	2	6	539642	539647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62179054
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11351	NC_006905	GTAC	2	8	540117	540124	25 %	25 %	25 %	25 %	62179054
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11364	NC_006905	GAA	2	6	540529	540534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62179054
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11366	NC_006905	CAGAAT	2	12	540661	540672	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	62179054
11367	NC_006905	CAT	3	9	540715	540723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62179054
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11369	NC_006905	GAT	2	6	540817	540822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62179054
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11375	NC_006905	GTT	2	6	541108	541113	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62179054
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11475	NC_006905	GAT	2	6	545904	545909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11485	NC_006905	A	6	6	546266	546271	100 %	0 %	0 %	0 %	62179059
11486	NC_006905	GC	3	6	546284	546289	0 %	0 %	50 %	50 %	62179059
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11488	NC_006905	TGATG	2	10	546432	546441	20 %	40 %	40 %	0 %	62179059
11489	NC_006905	AGC	2	6	546458	546463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62179059
11490	NC_006905	GAAA	2	8	546474	546481	75 %	0 %	25 %	0 %	62179059
11491	NC_006905	GCT	2	6	546490	546495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62179059
11492	NC_006905	GGC	2	6	546556	546561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62179059
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