MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Choleraesuis str. SC-B67 chromosome

Total Repeats: 100226

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_006905	TCTA	2	8	499909	499916	25 %	50 %	0 %	25 %	229037914
10502	NC_006905	GCC	2	6	499987	499992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229037914
10503	NC_006905	TGC	2	6	500066	500071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229037914
10504	NC_006905	GC	3	6	500093	500098	0 %	0 %	50 %	50 %	229037914
10505	NC_006905	TGA	2	6	500153	500158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229037914
10506	NC_006905	GCT	2	6	500166	500171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229037914
10507	NC_006905	CAT	2	6	500193	500198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229037914
10508	NC_006905	GGTATG	2	12	500247	500258	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	229037914
10509	NC_006905	CTG	2	6	500269	500274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229037914
10510	NC_006905	CCG	2	6	500289	500294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229037914
10511	NC_006905	CCG	2	6	500302	500307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229037914
10512	NC_006905	ACG	2	6	500353	500358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229037914
10513	NC_006905	ATT	2	6	500386	500391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229037914
10514	NC_006905	CTG	2	6	500455	500460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229037914
10515	NC_006905	TCC	2	6	500577	500582	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10516	NC_006905	CCT	2	6	500588	500593	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10517	NC_006905	TAA	2	6	500598	500603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10518	NC_006905	GAT	2	6	500611	500616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10519	NC_006905	CCG	2	6	500766	500771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62179013
10520	NC_006905	GAA	2	6	500805	500810	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62179013
10521	NC_006905	GCC	2	6	500836	500841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62179013
10522	NC_006905	GCGA	2	8	500867	500874	25 %	0 %	50 %	25 %	62179013
10523	NC_006905	CGC	2	6	500953	500958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62179013
10524	NC_006905	T	6	6	501046	501051	0 %	100 %	0 %	0 %	62179013
10525	NC_006905	ACC	2	6	501115	501120	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	62179013
10526	NC_006905	TGC	2	6	501145	501150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62179013
10527	NC_006905	GGCG	2	8	501179	501186	0 %	0 %	75 %	25 %	62179013
10528	NC_006905	CGG	2	6	501200	501205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62179013
10529	NC_006905	GGC	2	6	501345	501350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62179013
10530	NC_006905	GCT	2	6	501359	501364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62179013
10531	NC_006905	GCG	2	6	501371	501376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62179013
10532	NC_006905	GCG	2	6	501430	501435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62179013
10533	NC_006905	GCA	2	6	501466	501471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62179013
10534	NC_006905	GGC	2	6	501474	501479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62179013
10535	NC_006905	CAC	2	6	501526	501531	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	62179013
10536	NC_006905	CTGG	2	8	501548	501555	0 %	25 %	50 %	25 %	62179013
10537	NC_006905	ATCA	2	8	501583	501590	50 %	25 %	0 %	25 %	62179013
10538	NC_006905	TGG	2	6	501598	501603	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62179013
10539	NC_006905	TCGT	2	8	501631	501638	0 %	50 %	25 %	25 %	62179013
10540	NC_006905	GGC	2	6	501673	501678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62179013
10541	NC_006905	GGCG	2	8	501704	501711	0 %	0 %	75 %	25 %	62179013
10542	NC_006905	GC	3	6	501714	501719	0 %	0 %	50 %	50 %	62179013
10543	NC_006905	GCA	2	6	501728	501733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62179013
10544	NC_006905	GGC	2	6	501752	501757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62179013
10545	NC_006905	AAG	2	6	501760	501765	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62179013
10546	NC_006905	GCC	2	6	501840	501845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62179013
10547	NC_006905	TGGA	2	8	501945	501952	25 %	25 %	50 %	0 %	62179013
10548	NC_006905	CAA	2	6	501981	501986	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	62179013
10549	NC_006905	GC	3	6	502023	502028	0 %	0 %	50 %	50 %	62179013
10550	NC_006905	CTG	2	6	502038	502043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62179013
10551	NC_006905	GC	3	6	502056	502061	0 %	0 %	50 %	50 %	62179013
10552	NC_006905	GGT	2	6	502073	502078	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62179013
10553	NC_006905	TATT	2	8	502109	502116	25 %	75 %	0 %	0 %	62179013
10554	NC_006905	CGT	2	6	502257	502262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62179013
10555	NC_006905	CAG	3	9	502320	502328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62179013
10556	NC_006905	TGG	2	6	502336	502341	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62179013
10557	NC_006905	CGTTGC	2	12	502381	502392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62179013
10558	NC_006905	GGT	2	6	502499	502504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10559	NC_006905	A	6	6	502523	502528	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10560	NC_006905	CTT	2	6	502627	502632	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62179014
10561	NC_006905	GCA	2	6	502702	502707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62179014
10562	NC_006905	TCG	2	6	502710	502715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62179014
10563	NC_006905	TGG	2	6	502749	502754	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62179014
10564	NC_006905	GCC	2	6	502886	502891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62179014
10565	NC_006905	GAAC	2	8	502924	502931	50 %	0 %	25 %	25 %	62179014
10566	NC_006905	GAAA	2	8	502940	502947	75 %	0 %	25 %	0 %	62179014
10567	NC_006905	CGC	2	6	502963	502968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62179014
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10570	NC_006905	AGA	2	6	503044	503049	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62179014
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10573	NC_006905	ATA	2	6	503166	503171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	62179014
10574	NC_006905	AACGC	2	10	503199	503208	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
10575	NC_006905	AGGG	2	8	503218	503225	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
10576	NC_006905	CAAT	2	8	503253	503260	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10577	NC_006905	ATCG	2	8	503277	503284	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10578	NC_006905	ATG	2	6	503302	503307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10579	NC_006905	CGG	2	6	503342	503347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10580	NC_006905	ACGC	2	8	503353	503360	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10581	NC_006905	GCGG	2	8	503389	503396	0 %	0 %	75 %	25 %	62179015
10582	NC_006905	CAT	2	6	503404	503409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62179015
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10584	NC_006905	CGT	2	6	503445	503450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62179015
10585	NC_006905	GCCAT	2	10	503510	503519	20 %	20 %	20 %	40 %	62179015
10586	NC_006905	TGAA	2	8	503531	503538	50 %	25 %	25 %	0 %	62179015
10587	NC_006905	GCG	2	6	503604	503609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62179015
10588	NC_006905	TCG	2	6	503625	503630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62179015
10589	NC_006905	GA	3	6	503679	503684	50 %	0 %	50 %	0 %	62179015
10590	NC_006905	A	6	6	503705	503710	100 %	0 %	0 %	0 %	62179015
10591	NC_006905	CGC	2	6	503747	503752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62179015
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10595	NC_006905	GAGTCA	2	12	504041	504052	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	62179016
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10598	NC_006905	GCG	2	6	504272	504277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62179016
10599	NC_006905	GAT	2	6	504310	504315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62179016
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10601	NC_006905	CG	3	6	504411	504416	0 %	0 %	50 %	50 %	62179016
10602	NC_006905	CGC	2	6	504579	504584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62179016
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10604	NC_006905	GCT	2	6	504615	504620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62179016
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10606	NC_006905	CAT	2	6	504720	504725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62179016
10607	NC_006905	GGT	2	6	504756	504761	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62179016
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10609	NC_006905	GC	3	6	504784	504789	0 %	0 %	50 %	50 %	62179016
10610	NC_006905	CAC	2	6	504813	504818	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	62179016
10611	NC_006905	GCG	2	6	504841	504846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62179016
10612	NC_006905	GGC	2	6	504849	504854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62179016
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10615	NC_006905	TGAT	2	8	504926	504933	25 %	50 %	25 %	0 %	62179016
10616	NC_006905	AC	3	6	505005	505010	50 %	0 %	0 %	50 %	62179016
10617	NC_006905	T	6	6	505051	505056	0 %	100 %	0 %	0 %	62179016
10618	NC_006905	AAG	2	6	505115	505120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62179016
10619	NC_006905	GGT	2	6	505187	505192	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10620	NC_006905	TTA	2	6	505243	505248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10621	NC_006905	T	7	7	505291	505297	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10992	NC_006905	AAC	2	6	523419	523424	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	62179036
10993	NC_006905	CAG	2	6	523446	523451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62179036
10994	NC_006905	CAG	2	6	523455	523460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62179036
10995	NC_006905	GGT	2	6	523463	523468	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62179036
10996	NC_006905	ACG	2	6	523501	523506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62179036
10997	NC_006905	CGT	2	6	523571	523576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62179036
10998	NC_006905	GCT	2	6	523637	523642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62179036
10999	NC_006905	GGC	2	6	523745	523750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11000	NC_006905	TCA	3	9	523812	523820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62179037

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