MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Choleraesuis str. SC-B67 chromosome

Total Repeats: 100226

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_006905	AGG	2	6	477470	477475	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	62178989
10002	NC_006905	GA	3	6	477508	477513	50 %	0 %	50 %	0 %	62178989
10003	NC_006905	GAT	2	6	477540	477545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10004	NC_006905	CTCG	2	8	477735	477742	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10005	NC_006905	TTG	2	6	477767	477772	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10006	NC_006905	TCG	2	6	477815	477820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178990
10007	NC_006905	ACT	2	6	477829	477834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62178990
10008	NC_006905	ATT	2	6	477939	477944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62178990
10009	NC_006905	CTGG	2	8	477950	477957	0 %	25 %	50 %	25 %	62178990
10010	NC_006905	TCA	2	6	477964	477969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62178990
10011	NC_006905	CGC	2	6	478063	478068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178991
10012	NC_006905	GGC	2	6	478095	478100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178991
10013	NC_006905	ATAC	2	8	478147	478154	50 %	25 %	0 %	25 %	62178991
10014	NC_006905	AAG	2	6	478217	478222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62178991
10015	NC_006905	GATCGC	2	12	478270	478281	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	62178991
10016	NC_006905	ATC	2	6	478342	478347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62178991
10017	NC_006905	CGC	2	6	478395	478400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178991
10018	NC_006905	CCA	3	9	478470	478478	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	62178991
10019	NC_006905	CTG	2	6	478513	478518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178991
10020	NC_006905	CCGA	2	8	478550	478557	25 %	0 %	25 %	50 %	62178991
10021	NC_006905	TTCG	2	8	478637	478644	0 %	50 %	25 %	25 %	62178991
10022	NC_006905	TAA	2	6	478653	478658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	62178991
10023	NC_006905	GCA	2	6	478770	478775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178991
10024	NC_006905	AAT	2	6	478959	478964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	62178991
10025	NC_006905	TATC	2	8	478998	479005	25 %	50 %	0 %	25 %	62178991
10026	NC_006905	CAC	2	6	479014	479019	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	62178991
10027	NC_006905	ATCG	2	8	479035	479042	25 %	25 %	25 %	25 %	62178991
10028	NC_006905	CCG	2	6	479085	479090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178991
10029	NC_006905	ATT	2	6	479259	479264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62178992
10030	NC_006905	TTA	2	6	479312	479317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62178992
10031	NC_006905	CAA	2	6	479334	479339	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	62178992
10032	NC_006905	CGG	2	6	479416	479421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178992
10033	NC_006905	TCA	2	6	479442	479447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62178992
10034	NC_006905	AGC	2	6	479526	479531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178992
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10037	NC_006905	GCGCT	2	10	479556	479565	0 %	20 %	40 %	40 %	62178992
10038	NC_006905	CAG	2	6	479583	479588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178992
10039	NC_006905	GCC	2	6	479620	479625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178992
10040	NC_006905	TGCC	2	8	479654	479661	0 %	25 %	25 %	50 %	62178992
10041	NC_006905	ATT	2	6	479830	479835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62178992
10042	NC_006905	GCT	2	6	479865	479870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178992
10043	NC_006905	GT	3	6	479910	479915	0 %	50 %	50 %	0 %	62178992
10044	NC_006905	TA	3	6	479947	479952	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10045	NC_006905	ATG	2	6	479973	479978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10046	NC_006905	ACC	2	6	480024	480029	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10047	NC_006905	GCTAA	2	10	480046	480055	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
10048	NC_006905	GTTTG	2	10	480120	480129	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
10049	NC_006905	T	7	7	480134	480140	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10050	NC_006905	TCCG	2	8	480264	480271	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10051	NC_006905	GC	3	6	480333	480338	0 %	0 %	50 %	50 %	62178993
10052	NC_006905	CTG	2	6	480403	480408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178993
10053	NC_006905	CG	3	6	480476	480481	0 %	0 %	50 %	50 %	62178993
10054	NC_006905	GCG	2	6	480527	480532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178993
10055	NC_006905	CGG	2	6	480537	480542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178993
10056	NC_006905	GGC	2	6	480553	480558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178993
10057	NC_006905	GCGG	2	8	480582	480589	0 %	0 %	75 %	25 %	62178993
10058	NC_006905	TGG	2	6	480614	480619	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62178993
10059	NC_006905	TTAA	2	8	480643	480650	50 %	50 %	0 %	0 %	62178993
10060	NC_006905	GCGT	2	8	480656	480663	0 %	25 %	50 %	25 %	62178993
10061	NC_006905	TCA	2	6	480668	480673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62178993
10062	NC_006905	GTTT	2	8	480740	480747	0 %	75 %	25 %	0 %	62178993
10063	NC_006905	T	6	6	480745	480750	0 %	100 %	0 %	0 %	62178993
10064	NC_006905	ATCAA	2	10	480808	480817	60 %	20 %	0 %	20 %	62178993
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10072	NC_006905	CGT	2	6	481267	481272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178993
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10075	NC_006905	ATT	2	6	481420	481425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10076	NC_006905	T	6	6	481427	481432	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10077	NC_006905	TAT	2	6	481440	481445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10081	NC_006905	TTC	2	6	481554	481559	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10082	NC_006905	TAA	2	6	481584	481589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10088	NC_006905	GTT	2	6	481882	481887	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10090	NC_006905	TAA	2	6	481978	481983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10091	NC_006905	GTT	2	6	482000	482005	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10093	NC_006905	AT	3	6	482075	482080	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10094	NC_006905	GTAA	2	8	482089	482096	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10095	NC_006905	GGT	2	6	482111	482116	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10096	NC_006905	TA	3	6	482141	482146	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10097	NC_006905	ACTTT	2	10	482232	482241	20 %	60 %	0 %	20 %	62178995
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10101	NC_006905	CAG	2	6	482322	482327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178995
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10108	NC_006905	A	6	6	482517	482522	100 %	0 %	0 %	0 %	62178995
10109	NC_006905	GCG	2	6	482523	482528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178995
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10111	NC_006905	AATG	2	8	482637	482644	50 %	25 %	25 %	0 %	62178996
10112	NC_006905	GCC	2	6	482685	482690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178996
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10114	NC_006905	CG	3	6	482750	482755	0 %	0 %	50 %	50 %	62178996
10115	NC_006905	G	6	6	482767	482772	0 %	0 %	100 %	0 %	62178996
10116	NC_006905	GCC	2	6	482788	482793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178996
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10120	NC_006905	GCG	2	6	482881	482886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178996
10121	NC_006905	TGCC	2	8	482981	482988	0 %	25 %	25 %	50 %	62178996
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10124	NC_006905	TCG	2	6	483127	483132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178996
10125	NC_006905	CT	3	6	483145	483150	0 %	50 %	0 %	50 %	62178996
10126	NC_006905	TGT	2	6	483164	483169	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62178996
10127	NC_006905	TTA	2	6	483298	483303	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62178996
10128	NC_006905	CCA	2	6	483330	483335	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	62178996
10129	NC_006905	TTG	2	6	483349	483354	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62178996
10130	NC_006905	TATCGA	2	12	483357	483368	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	62178996
10131	NC_006905	ATG	2	6	483401	483406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62178996
10132	NC_006905	TAT	2	6	483420	483425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62178996
10133	NC_006905	GGC	2	6	483484	483489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178996
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10135	NC_006905	GCGTGG	2	12	483614	483625	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	62178996
10136	NC_006905	CAAAG	2	10	483690	483699	60 %	0 %	20 %	20 %	62178996
10137	NC_006905	GGC	2	6	483726	483731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178996
10138	NC_006905	TTC	2	6	483825	483830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62178997
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10142	NC_006905	AGC	2	6	484100	484105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178997
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10144	NC_006905	GCG	2	6	484267	484272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178997
10145	NC_006905	ACC	2	6	484279	484284	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	62178997
10146	NC_006905	GGA	2	6	484305	484310	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	62178997
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10148	NC_006905	GC	3	6	484388	484393	0 %	0 %	50 %	50 %	62178997
10149	NC_006905	GGC	2	6	484428	484433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178997
10150	NC_006905	TCT	2	6	484550	484555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62178997
10151	NC_006905	TG	3	6	484578	484583	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10152	NC_006905	TGA	2	6	484643	484648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10155	NC_006905	GCC	2	6	484815	484820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178998
10156	NC_006905	GCC	2	6	484849	484854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178998
10157	NC_006905	GGC	2	6	484932	484937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178998
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10159	NC_006905	CAG	2	6	485049	485054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178998
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10161	NC_006905	CT	3	6	485078	485083	0 %	50 %	0 %	50 %	62178998
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10166	NC_006905	ATT	3	9	485238	485246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10167	NC_006905	GAT	2	6	485271	485276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10168	NC_006905	ATG	2	6	485339	485344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62178999
10169	NC_006905	TTG	2	6	485358	485363	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62178999
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10188	NC_006905	ACAAT	2	10	486206	486215	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
10189	NC_006905	CTG	2	6	486256	486261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10192	NC_006905	CGT	2	6	486360	486365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62179001
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10213	NC_006905	GCGCT	2	10	487426	487435	0 %	20 %	40 %	40 %	162139610
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10229	NC_006905	GCA	2	6	487986	487991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162139610
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10232	NC_006905	GC	4	8	488128	488135	0 %	0 %	50 %	50 %	162139610
10233	NC_006905	ATA	2	6	488138	488143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162139610
10234	NC_006905	CGG	2	6	488191	488196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162139610
10235	NC_006905	GTAAT	2	10	488280	488289	40 %	40 %	20 %	0 %	162139610
10236	NC_006905	A	6	6	488441	488446	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10237	NC_006905	GAG	2	6	488448	488453	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10238	NC_006905	GGC	2	6	488481	488486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62179004
10239	NC_006905	TGA	2	6	488510	488515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62179004
10240	NC_006905	AGC	2	6	488524	488529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62179004
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10242	NC_006905	GGA	2	6	488558	488563	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	62179004
10243	NC_006905	TTGGCA	2	12	488638	488649	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	62179004
10244	NC_006905	TC	4	8	488658	488665	0 %	50 %	0 %	50 %	62179004
10245	NC_006905	A	6	6	488684	488689	100 %	0 %	0 %	0 %	62179004
10246	NC_006905	CGT	2	6	488739	488744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62179004
10247	NC_006905	GCG	2	6	488814	488819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62179004
10248	NC_006905	GCG	2	6	488860	488865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62179004
10249	NC_006905	CGG	2	6	488897	488902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62179004
10250	NC_006905	TGGA	2	8	488943	488950	25 %	25 %	50 %	0 %	62179004
10251	NC_006905	GAA	2	6	488973	488978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62179004
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10256	NC_006905	GGC	2	6	489279	489284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62179004
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10287	NC_006905	T	6	6	490552	490557	0 %	100 %	0 %	0 %	62179005
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10492	NC_006905	CAT	2	6	499650	499655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229037914
10493	NC_006905	TG	3	6	499656	499661	0 %	50 %	50 %	0 %	229037914
10494	NC_006905	CGG	2	6	499674	499679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229037914
10495	NC_006905	CGG	2	6	499713	499718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229037914
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