MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Choleraesuis str. SC-B67 chromosome

Total Repeats: 100226

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_006905	AGA	2	6	22701	22706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62178588
502	NC_006905	CGG	2	6	22743	22748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178588
503	NC_006905	T	6	6	22753	22758	0 %	100 %	0 %	0 %	62178588
504	NC_006905	CT	3	6	22795	22800	0 %	50 %	0 %	50 %	62178588
505	NC_006905	GGT	2	6	22948	22953	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62178588
506	NC_006905	CTA	2	6	22955	22960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62178588
507	NC_006905	CGG	2	6	22995	23000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178588
508	NC_006905	CTGG	2	8	23001	23008	0 %	25 %	50 %	25 %	62178588
509	NC_006905	TAT	2	6	23026	23031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62178588
510	NC_006905	ATA	2	6	23052	23057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	62178588
511	NC_006905	TTA	2	6	23167	23172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_006905	TCTTAA	2	12	23204	23215	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
513	NC_006905	TTAT	2	8	23266	23273	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_006905	A	7	7	23339	23345	100 %	0 %	0 %	0 %	62178589
515	NC_006905	TGA	2	6	23346	23351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62178589
516	NC_006905	ACG	2	6	23352	23357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178589
517	NC_006905	ATA	2	6	23370	23375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	62178589
518	NC_006905	CTTTT	2	10	23394	23403	0 %	80 %	0 %	20 %	62178589
519	NC_006905	T	6	6	23400	23405	0 %	100 %	0 %	0 %	62178589
520	NC_006905	CAG	2	6	23408	23413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178589
521	NC_006905	TTG	2	6	23453	23458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62178589
522	NC_006905	TTTA	2	8	23499	23506	25 %	75 %	0 %	0 %	62178589
523	NC_006905	ATG	2	6	23514	23519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62178589
524	NC_006905	GTT	2	6	23549	23554	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62178589
525	NC_006905	ATG	2	6	23565	23570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62178589
526	NC_006905	AT	3	6	23583	23588	50 %	50 %	0 %	0 %	62178589
527	NC_006905	CG	3	6	23653	23658	0 %	0 %	50 %	50 %	62178589
528	NC_006905	ACG	2	6	23754	23759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178589
529	NC_006905	TGA	2	6	23790	23795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62178589
530	NC_006905	GC	4	8	23796	23803	0 %	0 %	50 %	50 %	62178589
531	NC_006905	CTGA	2	8	23852	23859	25 %	25 %	25 %	25 %	62178589
532	NC_006905	TCTG	2	8	23956	23963	0 %	50 %	25 %	25 %	62178589
533	NC_006905	A	7	7	23968	23974	100 %	0 %	0 %	0 %	62178589
534	NC_006905	GGC	2	6	24000	24005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178589
535	NC_006905	AT	3	6	24057	24062	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_006905	GTT	2	6	24117	24122	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
537	NC_006905	ACA	2	6	24196	24201	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
538	NC_006905	GAT	2	6	24233	24238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
539	NC_006905	TAA	2	6	24260	24265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_006905	TAA	2	6	24267	24272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_006905	ACG	2	6	24307	24312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
542	NC_006905	AAG	2	6	24354	24359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
543	NC_006905	T	7	7	24364	24370	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_006905	GAA	2	6	24400	24405	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
545	NC_006905	CAG	2	6	24410	24415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_006905	A	6	6	24426	24431	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_006905	TGAA	2	8	24467	24474	50 %	25 %	25 %	0 %	62178590
548	NC_006905	TGT	2	6	24522	24527	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62178590
549	NC_006905	TAC	2	6	24544	24549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62178590
550	NC_006905	CGGTA	2	10	24562	24571	20 %	20 %	40 %	20 %	62178590
551	NC_006905	CGC	2	6	24595	24600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178590
552	NC_006905	CTGTT	2	10	24601	24610	0 %	60 %	20 %	20 %	62178590
553	NC_006905	TGG	2	6	24681	24686	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62178590
554	NC_006905	AGA	2	6	24697	24702	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62178590
555	NC_006905	CCAG	2	8	24738	24745	25 %	0 %	25 %	50 %	62178590
556	NC_006905	GCG	2	6	24749	24754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178590
557	NC_006905	CGA	2	6	24825	24830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178590
558	NC_006905	T	7	7	25026	25032	0 %	100 %	0 %	0 %	62178591
559	NC_006905	CG	3	6	25065	25070	0 %	0 %	50 %	50 %	62178591
560	NC_006905	A	8	8	25116	25123	100 %	0 %	0 %	0 %	62178591
561	NC_006905	ATT	2	6	25142	25147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62178591
562	NC_006905	CTG	2	6	25152	25157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178591
563	NC_006905	CGG	2	6	25159	25164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178591
564	NC_006905	CCT	2	6	25246	25251	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	62178591
565	NC_006905	ATT	2	6	25257	25262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62178591
566	NC_006905	TTC	2	6	25265	25270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62178591
567	NC_006905	T	7	7	25282	25288	0 %	100 %	0 %	0 %	62178591
568	NC_006905	CGC	2	6	25345	25350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178591
569	NC_006905	CT	3	6	25351	25356	0 %	50 %	0 %	50 %	62178591
570	NC_006905	A	6	6	25371	25376	100 %	0 %	0 %	0 %	62178591
571	NC_006905	AT	3	6	25381	25386	50 %	50 %	0 %	0 %	62178591
572	NC_006905	TAT	2	6	25391	25396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62178591
573	NC_006905	ACCG	2	8	25415	25422	25 %	0 %	25 %	50 %	62178591
574	NC_006905	TATTT	2	10	25435	25444	20 %	80 %	0 %	0 %	62178591
575	NC_006905	AAAT	2	8	25475	25482	75 %	25 %	0 %	0 %	62178591
576	NC_006905	TAC	2	6	25632	25637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62178591
577	NC_006905	A	6	6	25668	25673	100 %	0 %	0 %	0 %	62178591
578	NC_006905	CCG	2	6	25692	25697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178591
579	NC_006905	ACG	2	6	25767	25772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178591
580	NC_006905	ATG	2	6	25796	25801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62178591
581	NC_006905	TCTG	2	8	25932	25939	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
582	NC_006905	GGC	2	6	25989	25994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_006905	ACG	2	6	26071	26076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
584	NC_006905	GC	3	6	26084	26089	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
585	NC_006905	GCCT	2	8	26113	26120	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
586	NC_006905	GGC	3	9	26181	26189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
587	NC_006905	GCC	2	6	26224	26229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
588	NC_006905	GCA	2	6	26250	26255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
589	NC_006905	GGC	2	6	26280	26285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
590	NC_006905	GGC	2	6	26398	26403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
591	NC_006905	ACT	2	6	26471	26476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
592	NC_006905	GCG	2	6	26495	26500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
593	NC_006905	AGCGAC	2	12	26509	26520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
594	NC_006905	GCA	2	6	26523	26528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_006905	ATT	2	6	26607	26612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_006905	CCTT	2	8	26619	26626	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
597	NC_006905	GAC	2	6	26650	26655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
598	NC_006905	CAT	2	6	26748	26753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
599	NC_006905	GCC	2	6	26769	26774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
600	NC_006905	CCG	2	6	26807	26812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
601	NC_006905	GCG	2	6	26816	26821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
602	NC_006905	CCG	2	6	26882	26887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
603	NC_006905	GGC	2	6	26909	26914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
604	NC_006905	GCG	2	6	26923	26928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_006905	TAG	2	6	26952	26957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
606	NC_006905	GCG	2	6	27074	27079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
607	NC_006905	ATA	2	6	27143	27148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_006905	GAT	2	6	27262	27267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
609	NC_006905	ATT	2	6	27344	27349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_006905	TAT	2	6	27358	27363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_006905	AGG	2	6	27367	27372	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
612	NC_006905	ATCA	2	8	27391	27398	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
613	NC_006905	TTA	2	6	27425	27430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_006905	TGA	2	6	27459	27464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
615	NC_006905	TTG	2	6	27475	27480	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
616	NC_006905	ACA	2	6	27530	27535	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
617	NC_006905	GAT	2	6	27619	27624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
618	NC_006905	CTG	2	6	27718	27723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
619	NC_006905	ACA	2	6	27743	27748	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_006905	GCG	2	6	27785	27790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
621	NC_006905	CAG	2	6	27865	27870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_006905	GCG	2	6	27887	27892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
623	NC_006905	TGG	2	6	27896	27901	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
624	NC_006905	AGCC	2	8	27925	27932	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
625	NC_006905	CG	3	6	28014	28019	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
626	NC_006905	GGT	2	6	28029	28034	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
627	NC_006905	ACA	2	6	28045	28050	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_006905	GAT	2	6	28093	28098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
629	NC_006905	TGA	2	6	28107	28112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
630	NC_006905	CCGA	2	8	28132	28139	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
631	NC_006905	GC	3	6	28142	28147	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
632	NC_006905	GC	3	6	28178	28183	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
633	NC_006905	ACGGTG	2	12	28234	28245	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
634	NC_006905	TTG	2	6	28268	28273	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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636	NC_006905	ATC	2	6	28370	28375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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