MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Choleraesuis str. SC-B67 chromosome

Total Repeats: 100226

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_006905	GACCA	2	10	280903	280912	40 %	0 %	20 %	40 %	62178812
6002	NC_006905	GCT	2	6	280981	280986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178812
6003	NC_006905	AGC	2	6	281036	281041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178813
6004	NC_006905	GCA	2	6	281072	281077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178813
6005	NC_006905	GC	3	6	281124	281129	0 %	0 %	50 %	50 %	62178813
6006	NC_006905	CGC	2	6	281177	281182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178813
6007	NC_006905	AAC	2	6	281342	281347	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	62178813
6008	NC_006905	ATA	2	6	281389	281394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	62178813
6009	NC_006905	AATG	2	8	281402	281409	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6010	NC_006905	AAT	2	6	281475	281480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6011	NC_006905	CGC	2	6	281526	281531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178814
6012	NC_006905	TCA	2	6	281564	281569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62178814
6013	NC_006905	T	6	6	281590	281595	0 %	100 %	0 %	0 %	62178814
6014	NC_006905	CTGG	2	8	281701	281708	0 %	25 %	50 %	25 %	62178814
6015	NC_006905	TGA	2	6	281721	281726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62178814
6016	NC_006905	GCG	2	6	281769	281774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178814
6017	NC_006905	CAA	2	6	281784	281789	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	62178814
6018	NC_006905	GCA	3	9	281877	281885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178814
6019	NC_006905	GGTCG	2	10	281905	281914	0 %	20 %	60 %	20 %	62178814
6020	NC_006905	GATTT	2	10	281957	281966	20 %	60 %	20 %	0 %	62178814
6021	NC_006905	T	7	7	281964	281970	0 %	100 %	0 %	0 %	62178814
6022	NC_006905	TTTC	2	8	282159	282166	0 %	75 %	0 %	25 %	62178814
6023	NC_006905	TGC	2	6	282194	282199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178814
6024	NC_006905	TTTGAA	2	12	282307	282318	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	62178814
6025	NC_006905	TGTGT	2	10	282347	282356	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
6026	NC_006905	TAAA	2	8	282411	282418	75 %	25 %	0 %	0 %	62178815
6027	NC_006905	ACG	2	6	282424	282429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178815
6028	NC_006905	TCA	2	6	282449	282454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62178815
6029	NC_006905	GCC	2	6	282504	282509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178815
6030	NC_006905	GCC	2	6	282522	282527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178815
6031	NC_006905	ACCAG	2	10	282577	282586	40 %	0 %	20 %	40 %	62178815
6032	NC_006905	GCG	2	6	282626	282631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178815
6033	NC_006905	TCGC	2	8	282641	282648	0 %	25 %	25 %	50 %	62178815
6034	NC_006905	AAC	2	6	282679	282684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	62178815
6035	NC_006905	CCA	2	6	282692	282697	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	62178815
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6041	NC_006905	ACC	2	6	282838	282843	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	62178815
6042	NC_006905	AG	3	6	282846	282851	50 %	0 %	50 %	0 %	62178815
6043	NC_006905	GAA	2	6	282939	282944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62178815
6044	NC_006905	CAT	2	6	282999	283004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62178815
6045	NC_006905	TCT	2	6	283076	283081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162139613
6046	NC_006905	TG	3	6	283082	283087	0 %	50 %	50 %	0 %	162139613
6047	NC_006905	CCGC	2	8	283124	283131	0 %	0 %	25 %	75 %	162139613
6048	NC_006905	GC	3	6	283143	283148	0 %	0 %	50 %	50 %	162139613
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6052	NC_006905	AGC	2	6	283193	283198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162139613
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6054	NC_006905	GCG	2	6	283335	283340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162139613
6055	NC_006905	TGA	2	6	283398	283403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162139613
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6057	NC_006905	GTC	2	6	283514	283519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162139613
6058	NC_006905	GC	3	6	283530	283535	0 %	0 %	50 %	50 %	162139613
6059	NC_006905	TGG	2	6	283536	283541	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162139613
6060	NC_006905	CG	3	6	283579	283584	0 %	0 %	50 %	50 %	162139613
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6062	NC_006905	CAG	2	6	283666	283671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162139613
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6071	NC_006905	AATGA	2	10	284058	284067	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
6072	NC_006905	ATCA	2	8	284142	284149	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6073	NC_006905	CTG	2	6	284177	284182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6074	NC_006905	A	8	8	284355	284362	100 %	0 %	0 %	0 %	62178817
6075	NC_006905	TGG	3	9	284375	284383	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62178817
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6089	NC_006905	CGGT	2	8	284924	284931	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6090	NC_006905	TG	3	6	285054	285059	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6091	NC_006905	GGC	2	6	285208	285213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6092	NC_006905	AGC	2	6	285248	285253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6100	NC_006905	TAA	2	6	285634	285639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6104	NC_006905	G	6	6	285836	285841	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6105	NC_006905	GGA	2	6	285880	285885	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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6108	NC_006905	TGC	2	6	286219	286224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6109	NC_006905	GTC	2	6	286231	286236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6111	NC_006905	GGA	2	6	286344	286349	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6112	NC_006905	TCA	2	6	286369	286374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6113	NC_006905	AC	3	6	286395	286400	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6114	NC_006905	CGT	2	6	286463	286468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6115	NC_006905	AC	3	6	286564	286569	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6116	NC_006905	GTAG	2	8	286605	286612	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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6118	NC_006905	AAG	2	6	286718	286723	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6119	NC_006905	CA	3	6	286740	286745	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6120	NC_006905	TGA	2	6	286753	286758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6122	NC_006905	GGT	2	6	286831	286836	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6123	NC_006905	TGT	2	6	286876	286881	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6124	NC_006905	CAC	2	6	286915	286920	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6125	NC_006905	AGG	2	6	287008	287013	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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6381	NC_006905	GCT	2	6	300685	300690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178831
6382	NC_006905	CGA	2	6	300713	300718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178831
6383	NC_006905	CAT	2	6	300741	300746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62178831
6384	NC_006905	TG	3	6	300777	300782	0 %	50 %	50 %	0 %	62178831
6385	NC_006905	GGC	2	6	300812	300817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178831
6386	NC_006905	CTGGCG	2	12	300876	300887	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	62178831
6387	NC_006905	GCA	2	6	300927	300932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178831
6388	NC_006905	AAC	2	6	300938	300943	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	62178831
6389	NC_006905	CGC	2	6	301036	301041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178831
6390	NC_006905	CGGA	2	8	301085	301092	25 %	0 %	50 %	25 %	62178831
6391	NC_006905	CGGG	2	8	301114	301121	0 %	0 %	75 %	25 %	62178831
6392	NC_006905	CG	3	6	301132	301137	0 %	0 %	50 %	50 %	62178831
6393	NC_006905	GGC	2	6	301165	301170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178831
6394	NC_006905	CAG	2	6	301222	301227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178831
6395	NC_006905	CGC	2	6	301228	301233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178831
6396	NC_006905	GC	3	6	301246	301251	0 %	0 %	50 %	50 %	62178831
6397	NC_006905	AGC	2	6	301298	301303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178831
6398	NC_006905	TGGA	2	8	301306	301313	25 %	25 %	50 %	0 %	62178831
6399	NC_006905	TG	3	6	301349	301354	0 %	50 %	50 %	0 %	62178831
6400	NC_006905	CTG	2	6	301384	301389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178831
6401	NC_006905	GCA	3	9	301401	301409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178831
6402	NC_006905	GC	3	6	301450	301455	0 %	0 %	50 %	50 %	62178831
6403	NC_006905	G	6	6	301527	301532	0 %	0 %	100 %	0 %	62178831
6404	NC_006905	CAG	3	9	301546	301554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178831
6405	NC_006905	CATATC	2	12	301621	301632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62178831
6406	NC_006905	CATG	2	8	301693	301700	25 %	25 %	25 %	25 %	62178832
6407	NC_006905	GC	3	6	301735	301740	0 %	0 %	50 %	50 %	62178832
6408	NC_006905	TTG	2	6	301848	301853	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62178832
6409	NC_006905	CCG	2	6	301854	301859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178832
6410	NC_006905	GGC	2	6	302078	302083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178832
6411	NC_006905	CGG	2	6	302245	302250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178832
6412	NC_006905	TGCC	2	8	302267	302274	0 %	25 %	25 %	50 %	62178832
6413	NC_006905	CAGC	2	8	302285	302292	25 %	0 %	25 %	50 %	62178832
6414	NC_006905	GGT	2	6	302293	302298	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62178832
6415	NC_006905	CT	3	6	302340	302345	0 %	50 %	0 %	50 %	62178832
6416	NC_006905	TCG	2	6	302482	302487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178832
6417	NC_006905	CTGC	2	8	302532	302539	0 %	25 %	25 %	50 %	62178832
6418	NC_006905	CGC	2	6	302568	302573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178832
6419	NC_006905	TGG	2	6	302732	302737	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62178833
6420	NC_006905	CTT	2	6	302793	302798	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62178833
6421	NC_006905	CGG	2	6	302861	302866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178833
6422	NC_006905	GGT	2	6	302875	302880	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62178833
6423	NC_006905	CAG	2	6	302947	302952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178833
6424	NC_006905	GCC	2	6	302968	302973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178833
6425	NC_006905	GCC	2	6	303030	303035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178833
6426	NC_006905	CAGC	2	8	303051	303058	25 %	0 %	25 %	50 %	62178833
6427	NC_006905	GGC	2	6	303059	303064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178833
6428	NC_006905	GCG	2	6	303066	303071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178833
6429	NC_006905	GCG	2	6	303075	303080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178833
6430	NC_006905	CGCC	2	8	303096	303103	0 %	0 %	25 %	75 %	62178833
6431	NC_006905	CGC	2	6	303112	303117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178833
6432	NC_006905	ATC	2	6	303130	303135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62178833
6433	NC_006905	GGCAG	2	10	303156	303165	20 %	0 %	60 %	20 %	62178833
6434	NC_006905	GCG	2	6	303289	303294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178833
6435	NC_006905	GCG	2	6	303310	303315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178833
6436	NC_006905	ACG	2	6	303322	303327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178833
6437	NC_006905	ATT	2	6	303361	303366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62178833
6438	NC_006905	ATC	2	6	303392	303397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62178833
6439	NC_006905	CCA	3	9	303474	303482	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	62178833
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6441	NC_006905	CGTC	2	8	303579	303586	0 %	25 %	25 %	50 %	62178833
6442	NC_006905	TGA	2	6	303587	303592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62178833
6443	NC_006905	CGG	2	6	303604	303609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178833
6444	NC_006905	GAA	2	6	303688	303693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62178833
6445	NC_006905	GCA	2	6	303726	303731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178833
6446	NC_006905	GCA	2	6	303765	303770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178833
6447	NC_006905	CCCTG	2	10	303773	303782	0 %	20 %	20 %	60 %	62178833
6448	NC_006905	GCA	2	6	303882	303887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178833
6449	NC_006905	TTC	2	6	303913	303918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62178833
6450	NC_006905	GGC	2	6	304025	304030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178833
6451	NC_006905	GGGC	2	8	304044	304051	0 %	0 %	75 %	25 %	62178833
6452	NC_006905	CGG	2	6	304057	304062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178833
6453	NC_006905	CGG	2	6	304065	304070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178833
6454	NC_006905	CCT	2	6	304080	304085	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	62178833
6455	NC_006905	GCT	2	6	304117	304122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178833
6456	NC_006905	AACG	2	8	304165	304172	50 %	0 %	25 %	25 %	62178833
6457	NC_006905	CG	3	6	304179	304184	0 %	0 %	50 %	50 %	62178833
6458	NC_006905	GAC	2	6	304279	304284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178833
6459	NC_006905	TG	3	6	304298	304303	0 %	50 %	50 %	0 %	62178833
6460	NC_006905	GGC	2	6	304420	304425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178833
6461	NC_006905	AAT	2	6	304517	304522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6462	NC_006905	GC	3	6	304566	304571	0 %	0 %	50 %	50 %	62178834
6463	NC_006905	GGC	2	6	304690	304695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178834
6464	NC_006905	GC	3	6	304724	304729	0 %	0 %	50 %	50 %	62178834
6465	NC_006905	CATA	2	8	304764	304771	50 %	25 %	0 %	25 %	62178834
6466	NC_006905	GCG	2	6	304785	304790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178834
6467	NC_006905	CGC	3	9	304813	304821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178834
6468	NC_006905	GA	3	6	304880	304885	50 %	0 %	50 %	0 %	62178834
6469	NC_006905	CGA	2	6	304889	304894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178834
6470	NC_006905	CA	3	6	304962	304967	50 %	0 %	0 %	50 %	62178834
6471	NC_006905	GCA	2	6	304986	304991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178834
6472	NC_006905	CAG	2	6	305070	305075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178835
6473	NC_006905	GGT	2	6	305127	305132	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62178835
6474	NC_006905	CAG	2	6	305271	305276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178835
6475	NC_006905	GCG	2	6	305297	305302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178835
6476	NC_006905	AGCG	2	8	305308	305315	25 %	0 %	50 %	25 %	62178835
6477	NC_006905	CGC	2	6	305345	305350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178835
6478	NC_006905	TCGC	2	8	305392	305399	0 %	25 %	25 %	50 %	62178835
6479	NC_006905	GCC	2	6	305412	305417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178835
6480	NC_006905	GCCC	2	8	305426	305433	0 %	0 %	25 %	75 %	62178835
6481	NC_006905	GCC	2	6	305506	305511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178835
6482	NC_006905	AGA	2	6	305542	305547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62178835
6483	NC_006905	GTT	2	6	305558	305563	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62178835
6484	NC_006905	CCT	2	6	305624	305629	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	62178835
6485	NC_006905	CA	4	8	305697	305704	50 %	0 %	0 %	50 %	62178835
6486	NC_006905	GGC	2	6	305723	305728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178835
6487	NC_006905	CTG	2	6	305757	305762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178835
6488	NC_006905	T	7	7	305837	305843	0 %	100 %	0 %	0 %	62178836
6489	NC_006905	AAT	2	6	305902	305907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	62178836
6490	NC_006905	CGG	2	6	305918	305923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178836
6491	NC_006905	GCCA	2	8	306011	306018	25 %	0 %	25 %	50 %	62178836
6492	NC_006905	GC	3	6	306075	306080	0 %	0 %	50 %	50 %	62178836
6493	NC_006905	CCA	2	6	306084	306089	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	62178836
6494	NC_006905	GTGTCG	2	12	306101	306112	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	62178836
6495	NC_006905	ACG	2	6	306129	306134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178836
6496	NC_006905	CTG	2	6	306217	306222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178836
6497	NC_006905	AAT	2	6	306298	306303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	62178836
6498	NC_006905	TGT	3	9	306329	306337	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62178836
6499	NC_006905	GAAAC	2	10	306396	306405	60 %	0 %	20 %	20 %	62178836
6500	NC_006905	CGGGA	2	10	306408	306417	20 %	0 %	60 %	20 %	62178836

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