MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Choleraesuis str. SC-B67 plasmid pSC138

Total Repeats: 2755

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_006856	TGG	2	6	123347	123352	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	60115668
2502	NC_006856	GTT	2	6	123432	123437	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	60115668
2503	NC_006856	GAGCA	2	10	123492	123501	40 %	0 %	40 %	20 %	60115668
2504	NC_006856	GC	3	6	123503	123508	0 %	0 %	50 %	50 %	60115668
2505	NC_006856	GGCG	2	8	123516	123523	0 %	0 %	75 %	25 %	60115668
2506	NC_006856	TGA	2	6	123536	123541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	60115668
2507	NC_006856	CTT	2	6	123558	123563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	60115668
2508	NC_006856	GTT	2	6	123567	123572	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	60115668
2509	NC_006856	ACG	2	6	123612	123617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	60115668
2510	NC_006856	GGA	2	6	123618	123623	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	60115668
2511	NC_006856	GA	3	6	123622	123627	50 %	0 %	50 %	0 %	60115668
2512	NC_006856	CAGC	2	8	123833	123840	25 %	0 %	25 %	50 %	60115668
2513	NC_006856	ATG	2	6	123901	123906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	60115668
2514	NC_006856	GAT	2	6	123965	123970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	60115667
2515	NC_006856	CAC	2	6	123979	123984	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	60115667
2516	NC_006856	GGT	2	6	124042	124047	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	60115667
2517	NC_006856	GAG	2	6	124156	124161	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2518	NC_006856	AAG	2	6	124179	124184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2519	NC_006856	AC	3	6	124345	124350	50 %	0 %	0 %	50 %	60115669
2520	NC_006856	CAT	2	6	124403	124408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	60115669
2521	NC_006856	TCA	2	6	124434	124439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	60115669
2522	NC_006856	TCT	3	9	124497	124505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	60115669
2523	NC_006856	TTC	2	6	124611	124616	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	60115669
2524	NC_006856	ATG	2	6	124635	124640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	60115669
2525	NC_006856	GCT	2	6	124641	124646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	60115669
2526	NC_006856	GTT	2	6	124696	124701	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	60115669
2527	NC_006856	TG	3	6	124792	124797	0 %	50 %	50 %	0 %	60115669
2528	NC_006856	GAAA	2	8	124909	124916	75 %	0 %	25 %	0 %	60115669
2529	NC_006856	CAT	2	6	125014	125019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	60115669
2530	NC_006856	T	6	6	125069	125074	0 %	100 %	0 %	0 %	60115669
2531	NC_006856	ACTA	2	8	125147	125154	50 %	25 %	0 %	25 %	60115669
2532	NC_006856	GCC	2	6	125229	125234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	60115669
2533	NC_006856	G	6	6	125297	125302	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2534	NC_006856	GCT	2	6	125309	125314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2535	NC_006856	GCTG	2	8	125351	125358	0 %	25 %	50 %	25 %	60115670
2536	NC_006856	CCA	2	6	125360	125365	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	60115670
2537	NC_006856	ACA	2	6	125459	125464	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	60115670
2538	NC_006856	CACAG	2	10	125548	125557	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
2539	NC_006856	CAT	2	6	125611	125616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2540	NC_006856	ACT	2	6	125724	125729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2541	NC_006856	CTTC	2	8	125736	125743	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2542	NC_006856	TGT	2	6	125761	125766	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2543	NC_006856	CGC	2	6	125863	125868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	60115671
2544	NC_006856	A	6	6	125874	125879	100 %	0 %	0 %	0 %	60115671
2545	NC_006856	TGA	2	6	125968	125973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	60115671
2546	NC_006856	TAAGCC	2	12	126013	126024	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	60115671
2547	NC_006856	AAG	2	6	126133	126138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	60115672
2548	NC_006856	TA	3	6	126308	126313	50 %	50 %	0 %	0 %	60115672
2549	NC_006856	CAA	2	6	126446	126451	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	60115673
2550	NC_006856	TCA	2	6	126468	126473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	60115673
2551	NC_006856	CAA	2	6	126578	126583	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2552	NC_006856	CCA	3	9	126609	126617	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2553	NC_006856	ACG	2	6	126719	126724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	60115674
2554	NC_006856	ATC	2	6	126824	126829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	60115674
2555	NC_006856	TCT	2	6	126834	126839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	60115674
2556	NC_006856	GAA	2	6	126862	126867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	60115674
2557	NC_006856	TCC	2	6	126878	126883	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	60115674
2558	NC_006856	GAT	2	6	126913	126918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	60115674
2559	NC_006856	AGC	2	6	126920	126925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	60115674
2560	NC_006856	AGC	2	6	126995	127000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	60115674
2561	NC_006856	GCT	2	6	127007	127012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	60115674
2562	NC_006856	GCCC	2	8	127033	127040	0 %	0 %	25 %	75 %	60115674
2563	NC_006856	GAG	2	6	127164	127169	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	60115674
2564	NC_006856	CTC	2	6	127195	127200	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	60115674
2565	NC_006856	CCG	2	6	127212	127217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	60115674
2566	NC_006856	CAT	2	6	127420	127425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	60115674
2567	NC_006856	CTC	2	6	127430	127435	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	60115675
2568	NC_006856	GAT	2	6	127463	127468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	60115675
2569	NC_006856	TCA	2	6	127490	127495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	60115675
2570	NC_006856	TCA	2	6	127501	127506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	60115675
2571	NC_006856	T	6	6	127524	127529	0 %	100 %	0 %	0 %	60115675
2572	NC_006856	TCC	2	6	127561	127566	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	60115675
2573	NC_006856	CAGC	2	8	127629	127636	25 %	0 %	25 %	50 %	60115675
2574	NC_006856	GA	3	6	127790	127795	50 %	0 %	50 %	0 %	60115675
2575	NC_006856	TGC	2	6	127840	127845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	60115675
2576	NC_006856	GCA	2	6	127868	127873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	60115675
2577	NC_006856	CCG	2	6	127915	127920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	60115675
2578	NC_006856	AAG	2	6	127921	127926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	60115675
2579	NC_006856	TGT	2	6	127970	127975	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	60115675
2580	NC_006856	CTG	2	6	127999	128004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	60115675
2581	NC_006856	CGA	2	6	128018	128023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	60115675
2582	NC_006856	CT	3	6	128148	128153	0 %	50 %	0 %	50 %	60115675
2583	NC_006856	TGA	2	6	128280	128285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	60115675
2584	NC_006856	GTG	2	6	128297	128302	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	60115675
2585	NC_006856	GCT	2	6	128633	128638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2586	NC_006856	CTAA	2	8	128649	128656	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2587	NC_006856	A	6	6	128694	128699	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2588	NC_006856	GCA	2	6	128723	128728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2589	NC_006856	AGTG	2	8	128803	128810	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2590	NC_006856	GTA	2	6	128818	128823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2591	NC_006856	AAG	2	6	129150	129155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2592	NC_006856	TTTA	2	8	129219	129226	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2593	NC_006856	CT	3	6	129289	129294	0 %	50 %	0 %	50 %	60115676
2594	NC_006856	GT	3	6	129476	129481	0 %	50 %	50 %	0 %	60115676
2595	NC_006856	CATC	2	8	129557	129564	25 %	25 %	0 %	50 %	60115676
2596	NC_006856	A	8	8	129577	129584	100 %	0 %	0 %	0 %	60115676
2597	NC_006856	TTAT	2	8	129710	129717	25 %	75 %	0 %	0 %	60115676
2598	NC_006856	ACA	2	6	129792	129797	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	60115676
2599	NC_006856	TGAC	2	8	129803	129810	25 %	25 %	25 %	25 %	60115676
2600	NC_006856	TCAA	2	8	129886	129893	50 %	25 %	0 %	25 %	60115676
2601	NC_006856	GAA	2	6	129901	129906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	60115676
2602	NC_006856	AAT	2	6	129910	129915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	60115676
2603	NC_006856	ATC	2	6	129920	129925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	60115676
2604	NC_006856	AAAGC	2	10	129947	129956	60 %	0 %	20 %	20 %	60115676
2605	NC_006856	TCA	2	6	130034	130039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	60115676
2606	NC_006856	T	6	6	130096	130101	0 %	100 %	0 %	0 %	60115676
2607	NC_006856	TAA	2	6	130119	130124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	60115676
2608	NC_006856	GTG	2	6	130130	130135	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	60115676
2609	NC_006856	TCA	2	6	130277	130282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	60115676
2610	NC_006856	CTCAGG	2	12	130296	130307	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	60115676
2611	NC_006856	AAAC	2	8	130310	130317	75 %	0 %	0 %	25 %	60115676
2612	NC_006856	TGG	2	6	130344	130349	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	60115676
2613	NC_006856	AGA	2	6	130392	130397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	60115676
2614	NC_006856	AGA	2	6	130424	130429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	60115676
2615	NC_006856	CTTT	2	8	130548	130555	0 %	75 %	0 %	25 %	60115676
2616	NC_006856	GAT	2	6	130603	130608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	60115676
2617	NC_006856	GTT	2	6	130642	130647	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	60115676
2618	NC_006856	GAA	2	6	130720	130725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	60115676
2619	NC_006856	GC	3	6	130743	130748	0 %	0 %	50 %	50 %	60115676
2620	NC_006856	ATT	2	6	130861	130866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	60115676
2621	NC_006856	CGA	2	6	130881	130886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	60115676
2622	NC_006856	AAC	2	6	130887	130892	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	60115676
2623	NC_006856	TGA	2	6	130931	130936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	60115676
2624	NC_006856	TGA	2	6	130977	130982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	60115676
2625	NC_006856	CGA	2	6	131001	131006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	60115676
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2627	NC_006856	TTTA	2	8	131184	131191	25 %	75 %	0 %	0 %	60115676
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2737	NC_006856	AGT	2	6	137852	137857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2742	NC_006856	A	6	6	138042	138047	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2743	NC_006856	GCC	2	6	138114	138119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	60115684
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2749	NC_006856	GC	3	6	138367	138372	0 %	0 %	50 %	50 %	60115684
2750	NC_006856	CGG	2	6	138401	138406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	60115684
2751	NC_006856	GCA	2	6	138519	138524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	60115684
2752	NC_006856	GTC	2	6	138577	138582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	60115684
2753	NC_006856	GCAC	2	8	138590	138597	25 %	0 %	25 %	50 %	60115684
2754	NC_006856	GCC	2	6	138616	138621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	60115684
2755	NC_006856	GCGCG	2	10	138697	138706	0 %	0 %	60 %	40 %	60115684

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.