MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus elongatus PCC 6301 chromosome

Total Repeats: 50353

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_006576	GCA	2	6	138677	138682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750137
2502	NC_006576	GCA	2	6	138710	138715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750137
2503	NC_006576	CTG	2	6	138745	138750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750137
2504	NC_006576	GAG	2	6	138844	138849	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56750137
2505	NC_006576	TTG	2	6	138880	138885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56750137
2506	NC_006576	CGT	2	6	138924	138929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750137
2507	NC_006576	GGC	2	6	138936	138941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56750137
2508	NC_006576	CAC	2	6	138952	138957	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56750137
2509	NC_006576	TGC	2	6	138997	139002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750137
2510	NC_006576	CGC	2	6	139087	139092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56750137
2511	NC_006576	TCC	2	6	139121	139126	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56750137
2512	NC_006576	CAA	2	6	139149	139154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56750137
2513	NC_006576	TGA	2	6	139170	139175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56750137
2514	NC_006576	CTG	2	6	139221	139226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750137
2515	NC_006576	CTG	2	6	139254	139259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750137
2516	NC_006576	GCT	2	6	139310	139315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750137
2517	NC_006576	CCA	3	9	139340	139348	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56750137
2518	NC_006576	CAGA	2	8	139437	139444	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2519	NC_006576	A	6	6	139444	139449	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2520	NC_006576	AGC	2	6	139469	139474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2521	NC_006576	TAG	2	6	139495	139500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56750138
2522	NC_006576	TGT	2	6	139547	139552	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56750138
2523	NC_006576	ACG	2	6	139797	139802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750138
2524	NC_006576	GCA	2	6	139881	139886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2525	NC_006576	TTCGAA	2	12	139938	139949	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	56750139
2526	NC_006576	GCA	2	6	139975	139980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750139
2527	NC_006576	CGC	2	6	140021	140026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56750139
2528	NC_006576	GCC	2	6	140133	140138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56750139
2529	NC_006576	TCA	2	6	140158	140163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56750139
2530	NC_006576	CCA	2	6	140174	140179	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56750139
2531	NC_006576	ACC	2	6	140205	140210	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56750139
2532	NC_006576	GCA	2	6	140222	140227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750139
2533	NC_006576	GAA	2	6	140256	140261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56750139
2534	NC_006576	CAA	2	6	140309	140314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56750139
2535	NC_006576	CGA	2	6	140351	140356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750139
2536	NC_006576	GGT	2	6	140372	140377	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56750139
2537	NC_006576	CAC	2	6	140378	140383	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56750139
2538	NC_006576	GCA	2	6	140474	140479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750139
2539	NC_006576	GGT	2	6	140511	140516	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56750139
2540	NC_006576	AAG	2	6	140539	140544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56750139
2541	NC_006576	CATG	2	8	140546	140553	25 %	25 %	25 %	25 %	56750139
2542	NC_006576	TCA	2	6	140594	140599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56750139
2543	NC_006576	TTC	2	6	140601	140606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56750139
2544	NC_006576	TCG	2	6	140737	140742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750139
2545	NC_006576	CCG	2	6	140761	140766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56750139
2546	NC_006576	CAG	2	6	140862	140867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750139
2547	NC_006576	GGA	2	6	140893	140898	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56750139
2548	NC_006576	CGA	2	6	140984	140989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750139
2549	NC_006576	GACC	2	8	141009	141016	25 %	0 %	25 %	50 %	56750139
2550	NC_006576	CTT	2	6	141017	141022	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56750139
2551	NC_006576	GGT	2	6	141144	141149	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56750139
2552	NC_006576	CGC	2	6	141180	141185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56750139
2553	NC_006576	CAG	2	6	141197	141202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750139
2554	NC_006576	GCC	2	6	141232	141237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56750139
2555	NC_006576	GTC	2	6	141339	141344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2556	NC_006576	TC	3	6	141343	141348	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2557	NC_006576	CGA	2	6	141372	141377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2558	NC_006576	GACG	2	8	141451	141458	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2559	NC_006576	ATC	2	6	141509	141514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2560	NC_006576	GATTT	3	15	141547	141561	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
2561	NC_006576	GAG	2	6	141597	141602	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2562	NC_006576	GCC	2	6	141625	141630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2563	NC_006576	ATC	2	6	141735	141740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56750140
2564	NC_006576	CGATCG	2	12	141836	141847	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	56750140
2565	NC_006576	GTT	2	6	141881	141886	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56750140
2566	NC_006576	GGCTG	2	10	141916	141925	0 %	20 %	60 %	20 %	56750140
2567	NC_006576	GTC	2	6	141966	141971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750140
2568	NC_006576	GCT	2	6	142153	142158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750140
2569	NC_006576	CCAA	2	8	142159	142166	50 %	0 %	0 %	50 %	56750140
2570	NC_006576	CTT	2	6	142235	142240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56750140
2571	NC_006576	GCC	2	6	142247	142252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56750140
2572	NC_006576	GAT	2	6	142386	142391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56750140
2573	NC_006576	CAT	2	6	142455	142460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56750140
2574	NC_006576	CAA	2	6	142560	142565	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2575	NC_006576	GCT	2	6	142586	142591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2576	NC_006576	GTGGG	2	10	142662	142671	0 %	20 %	80 %	0 %	56750141
2577	NC_006576	CGG	2	6	142699	142704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56750141
2578	NC_006576	GTT	2	6	142728	142733	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56750141
2579	NC_006576	CAA	2	6	142751	142756	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56750141
2580	NC_006576	TCGA	2	8	142785	142792	25 %	25 %	25 %	25 %	56750141
2581	NC_006576	GTG	2	6	142806	142811	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56750141
2582	NC_006576	GAC	2	6	142831	142836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750141
2583	NC_006576	CAA	2	6	142852	142857	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56750141
2584	NC_006576	GCA	2	6	142869	142874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750141
2585	NC_006576	ATG	2	6	142893	142898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56750141
2586	NC_006576	CCG	2	6	142905	142910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56750141
2587	NC_006576	CAC	2	6	143006	143011	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56750141
2588	NC_006576	CAG	2	6	143014	143019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750141
2589	NC_006576	CAC	2	6	143032	143037	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56750141
2590	NC_006576	CGA	3	9	143153	143161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750142
2591	NC_006576	GCT	2	6	143404	143409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750142
2592	NC_006576	GCG	2	6	143432	143437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56750142
2593	NC_006576	CAG	2	6	143521	143526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750142
2594	NC_006576	GCTC	2	8	143547	143554	0 %	25 %	25 %	50 %	56750142
2595	NC_006576	GCG	2	6	143638	143643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56750142
2596	NC_006576	CTG	2	6	143712	143717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750142
2597	NC_006576	GCT	2	6	143743	143748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750142
2598	NC_006576	CCA	2	6	143756	143761	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56750142
2599	NC_006576	GAACC	2	10	143802	143811	40 %	0 %	20 %	40 %	56750142
2600	NC_006576	TCGT	2	8	143936	143943	0 %	50 %	25 %	25 %	56750142
2601	NC_006576	GC	3	6	143955	143960	0 %	0 %	50 %	50 %	56750142
2602	NC_006576	GCG	2	6	143986	143991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56750142
2603	NC_006576	TGA	2	6	144051	144056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56750142
2604	NC_006576	GTGGA	2	10	144143	144152	20 %	20 %	60 %	0 %	56750142
2605	NC_006576	CAG	2	6	144156	144161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750142
2606	NC_006576	GCT	2	6	144164	144169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750142
2607	NC_006576	ATG	2	6	144203	144208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56750142
2608	NC_006576	CTG	3	9	144259	144267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750142
2609	NC_006576	TGA	2	6	144273	144278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56750142
2610	NC_006576	GGA	2	6	144305	144310	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56750142
2611	NC_006576	CAT	2	6	144337	144342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56750142
2612	NC_006576	CGA	2	6	144393	144398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750142
2613	NC_006576	CTTT	2	8	144551	144558	0 %	75 %	0 %	25 %	56750142
2614	NC_006576	TACG	2	8	144630	144637	25 %	25 %	25 %	25 %	56750142
2615	NC_006576	GAT	2	6	144643	144648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56750142
2616	NC_006576	AGC	2	6	144670	144675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750142
2617	NC_006576	CCG	2	6	144705	144710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56750142
2618	NC_006576	GTT	2	6	144725	144730	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56750142
2619	NC_006576	CAG	2	6	144783	144788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2620	NC_006576	GAT	2	6	144861	144866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56750143
2621	NC_006576	GC	3	6	144915	144920	0 %	0 %	50 %	50 %	56750143
2622	NC_006576	CAG	2	6	144974	144979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750143
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2632	NC_006576	AGTC	2	8	145587	145594	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2633	NC_006576	AAG	2	6	145601	145606	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2635	NC_006576	CT	3	6	145660	145665	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2636	NC_006576	AGATT	2	10	145673	145682	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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2661	NC_006576	CAGT	2	8	147343	147350	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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2747	NC_006576	CGGC	2	8	151723	151730	0 %	0 %	50 %	50 %	56750148
2748	NC_006576	CGC	2	6	151873	151878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56750148
2749	NC_006576	CCCG	2	8	151922	151929	0 %	0 %	25 %	75 %	56750148
2750	NC_006576	T	7	7	151949	151955	0 %	100 %	0 %	0 %	56750148
2751	NC_006576	G	6	6	151964	151969	0 %	0 %	100 %	0 %	56750148
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2762	NC_006576	CCCAA	2	10	152525	152534	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
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2765	NC_006576	CTG	2	6	152669	152674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2858	NC_006576	CCACCG	2	12	158499	158510	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	56750154
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2864	NC_006576	AGC	2	6	158875	158880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2870	NC_006576	GTGG	2	8	159192	159199	0 %	25 %	75 %	0 %	56750155
2871	NC_006576	TCGC	2	8	159241	159248	0 %	25 %	25 %	50 %	56750155
2872	NC_006576	CAA	2	6	159261	159266	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56750155
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2982	NC_006576	CCT	2	6	165309	165314	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56750160
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2984	NC_006576	CTGC	2	8	165442	165449	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2985	NC_006576	AGC	2	6	165491	165496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2986	NC_006576	GCT	2	6	165541	165546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750161
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2990	NC_006576	CGATCG	2	12	165669	165680	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	56750161
2991	NC_006576	CCG	2	6	165740	165745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56750161
2992	NC_006576	GCG	2	6	165836	165841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56750161
2993	NC_006576	GTC	2	6	165866	165871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750161
2994	NC_006576	GAC	2	6	165931	165936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750161
2995	NC_006576	AAC	2	6	165970	165975	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56750161
2996	NC_006576	AGC	2	6	166125	166130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750161
2997	NC_006576	AG	3	6	166205	166210	50 %	0 %	50 %	0 %	56750161
2998	NC_006576	GCG	2	6	166231	166236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56750162
2999	NC_006576	GGT	2	6	166288	166293	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56750162
3000	NC_006576	ATG	2	6	166298	166303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56750162

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