MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus elongatus PCC 6301 chromosome

Total Repeats: 50353

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_006576	ATTC	2	8	54179	54186	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1002	NC_006576	CTGA	2	8	54187	54194	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1003	NC_006576	CAA	2	6	54195	54200	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1004	NC_006576	ATT	2	6	54211	54216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_006576	TGG	2	6	54287	54292	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56750054
1006	NC_006576	CTG	2	6	54362	54367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750054
1007	NC_006576	GTC	2	6	54425	54430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750054
1008	NC_006576	GCT	2	6	54437	54442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750054
1009	NC_006576	GAGG	2	8	54470	54477	25 %	0 %	75 %	0 %	56750054
1010	NC_006576	CTG	2	6	54681	54686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750054
1011	NC_006576	GCA	2	6	54796	54801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750054
1012	NC_006576	CTG	2	6	54905	54910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750054
1013	NC_006576	GA	3	6	54932	54937	50 %	0 %	50 %	0 %	56750054
1014	NC_006576	GCC	2	6	54991	54996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56750054
1015	NC_006576	AGG	2	6	55091	55096	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56750054
1016	NC_006576	GCA	2	6	55111	55116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750054
1017	NC_006576	ATG	2	6	55153	55158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56750054
1018	NC_006576	TGA	2	6	55169	55174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56750054
1019	NC_006576	G	6	6	55262	55267	0 %	0 %	100 %	0 %	56750054
1020	NC_006576	GCCTTT	2	12	55317	55328	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	56750054
1021	NC_006576	GGT	2	6	55403	55408	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56750054
1022	NC_006576	TCAG	2	8	55435	55442	25 %	25 %	25 %	25 %	56750054
1023	NC_006576	GGCT	2	8	55448	55455	0 %	25 %	50 %	25 %	56750054
1024	NC_006576	GCA	2	6	55489	55494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750054
1025	NC_006576	GCT	2	6	55506	55511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750054
1026	NC_006576	GCT	2	6	55543	55548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750054
1027	NC_006576	CCA	2	6	55598	55603	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56750054
1028	NC_006576	CAC	2	6	55779	55784	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56750054
1029	NC_006576	CAG	2	6	55850	55855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750054
1030	NC_006576	CCA	2	6	55856	55861	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56750054
1031	NC_006576	CGCAG	2	10	55951	55960	20 %	0 %	40 %	40 %	56750054
1032	NC_006576	CAG	2	6	55971	55976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750054
1033	NC_006576	GGC	2	6	56145	56150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56750054
1034	NC_006576	AGC	2	6	56154	56159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750054
1035	NC_006576	AAC	2	6	56208	56213	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56750054
1036	NC_006576	CTG	2	6	56237	56242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750054
1037	NC_006576	CAT	2	6	56264	56269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56750054
1038	NC_006576	AGCC	2	8	56318	56325	25 %	0 %	25 %	50 %	56750054
1039	NC_006576	GTC	2	6	56360	56365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750054
1040	NC_006576	GCC	2	6	56441	56446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56750054
1041	NC_006576	AACC	2	8	56462	56469	50 %	0 %	0 %	50 %	56750054
1042	NC_006576	CTG	2	6	56760	56765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750054
1043	NC_006576	GAC	2	6	56877	56882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1044	NC_006576	TGT	2	6	56918	56923	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_006576	CAG	2	6	57000	57005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750055
1046	NC_006576	ACC	2	6	57164	57169	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56750055
1047	NC_006576	TCG	2	6	57198	57203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750055
1048	NC_006576	AAG	2	6	57226	57231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56750055
1049	NC_006576	CCCAG	2	10	57282	57291	20 %	0 %	20 %	60 %	56750055
1050	NC_006576	CAT	2	6	57406	57411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56750055
1051	NC_006576	CAC	2	6	57584	57589	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56750055
1052	NC_006576	GGT	2	6	57653	57658	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56750055
1053	NC_006576	CCTCG	2	10	57718	57727	0 %	20 %	20 %	60 %	56750055
1054	NC_006576	TCCAC	2	10	57730	57739	20 %	20 %	0 %	60 %	56750055
1055	NC_006576	CTG	3	9	57767	57775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750055
1056	NC_006576	CGC	2	6	57832	57837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56750055
1057	NC_006576	TCA	2	6	57895	57900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56750055
1058	NC_006576	TTC	2	6	57968	57973	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56750055
1059	NC_006576	GCC	2	6	58066	58071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56750055
1060	NC_006576	GCT	2	6	58154	58159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750055
1061	NC_006576	CAGC	2	8	58174	58181	25 %	0 %	25 %	50 %	56750055
1062	NC_006576	GTT	2	6	58213	58218	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56750055
1063	NC_006576	GCT	2	6	58232	58237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750055
1064	NC_006576	GCA	2	6	58264	58269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750056
1065	NC_006576	AAG	2	6	58317	58322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56750056
1066	NC_006576	GCC	2	6	58335	58340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56750056
1067	NC_006576	CTG	2	6	58370	58375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750056
1068	NC_006576	TGC	2	6	58394	58399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750056
1069	NC_006576	GTT	2	6	58438	58443	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56750056
1070	NC_006576	TGGC	2	8	58444	58451	0 %	25 %	50 %	25 %	56750056
1071	NC_006576	GCG	2	6	58494	58499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56750056
1072	NC_006576	GAT	2	6	58523	58528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56750056
1073	NC_006576	TCG	2	6	58548	58553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750056
1074	NC_006576	CAGC	2	8	58567	58574	25 %	0 %	25 %	50 %	56750056
1075	NC_006576	G	6	6	58684	58689	0 %	0 %	100 %	0 %	56750056
1076	NC_006576	TCG	2	6	58692	58697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750056
1077	NC_006576	CTG	2	6	58754	58759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750056
1078	NC_006576	CGC	2	6	58761	58766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56750056
1079	NC_006576	CCAG	2	8	58771	58778	25 %	0 %	25 %	50 %	56750056
1080	NC_006576	TGT	2	6	58849	58854	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56750056
1081	NC_006576	GCC	2	6	58861	58866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56750056
1082	NC_006576	G	6	6	58886	58891	0 %	0 %	100 %	0 %	56750056
1083	NC_006576	CGG	2	6	58987	58992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56750056
1084	NC_006576	TGCC	2	8	59044	59051	0 %	25 %	25 %	50 %	56750056
1085	NC_006576	TCA	2	6	59052	59057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56750056
1086	NC_006576	GCTC	2	8	59130	59137	0 %	25 %	25 %	50 %	56750057
1087	NC_006576	CGG	2	6	59146	59151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56750057
1088	NC_006576	GCA	2	6	59335	59340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750057
1089	NC_006576	CAA	2	6	59362	59367	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56750057
1090	NC_006576	TCT	2	6	59541	59546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56750057
1091	NC_006576	CGC	2	6	59605	59610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56750057
1092	NC_006576	TTG	2	6	59613	59618	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56750057
1093	NC_006576	TGACCT	2	12	59626	59637	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	56750057
1094	NC_006576	GCC	2	6	59648	59653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56750057
1095	NC_006576	CCAAGG	2	12	59689	59700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750057
1096	NC_006576	AAG	2	6	59829	59834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56750057
1097	NC_006576	GCC	2	6	59846	59851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56750057
1098	NC_006576	GTC	2	6	59954	59959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750057
1099	NC_006576	GGC	2	6	59975	59980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56750057
1100	NC_006576	TTC	2	6	60026	60031	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1101	NC_006576	GAG	2	6	60070	60075	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_006576	ATCC	2	8	60100	60107	25 %	25 %	0 %	50 %	56750058
1103	NC_006576	CCG	2	6	60108	60113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56750058
1104	NC_006576	CTT	2	6	60118	60123	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56750058
1105	NC_006576	GCG	2	6	60149	60154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56750058
1106	NC_006576	CCCGAT	2	12	60158	60169	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	56750058
1107	NC_006576	AGC	2	6	60204	60209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750058
1108	NC_006576	TGCC	2	8	60282	60289	0 %	25 %	25 %	50 %	56750058
1109	NC_006576	TGC	2	6	60295	60300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750058
1110	NC_006576	CTG	2	6	60383	60388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750058
1111	NC_006576	TGC	2	6	60421	60426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750058
1112	NC_006576	G	6	6	60461	60466	0 %	0 %	100 %	0 %	56750058
1113	NC_006576	TGC	2	6	60633	60638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750058
1114	NC_006576	CTG	2	6	60641	60646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750058
1115	NC_006576	CTG	2	6	60887	60892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750058
1116	NC_006576	CCA	2	6	60893	60898	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56750058
1117	NC_006576	CCA	2	6	60944	60949	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56750059
1118	NC_006576	AGCC	2	8	61009	61016	25 %	0 %	25 %	50 %	56750059
1119	NC_006576	TGC	2	6	61128	61133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750059
1120	NC_006576	TC	3	6	61213	61218	0 %	50 %	0 %	50 %	56750059
1121	NC_006576	GCG	2	6	61280	61285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56750059
1122	NC_006576	GTC	2	6	61301	61306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750059
1123	NC_006576	ATC	2	6	61331	61336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56750059
1124	NC_006576	ACA	2	6	61359	61364	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56750059
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1253	NC_006576	GCT	2	6	69055	69060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1254	NC_006576	GCT	2	6	69087	69092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1255	NC_006576	GGAA	2	8	69093	69100	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1256	NC_006576	AGC	2	6	69165	69170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1257	NC_006576	GT	3	6	69260	69265	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1353	NC_006576	CTGC	2	8	74853	74860	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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